Helios KO 小鼠代谢与脂肪组织表型分析
验证 Helios 缺陷 Tregs 是否导致脂肪组织丢失和代谢紊乱。
对 4 周龄开始的小鼠进行代谢研究,检测脂肪质量、瘦质量、肝脏重量、肝甘油三酯、血糖、胰岛素、瘦素及胰岛素耐量试验,并进行 H&E 染色。
Helios is critical for Treg effector differentiation in adipose autoimmunity
包含体外 Treg 转录组、ChIP-seq、流式表型分析、CD8+ T 细胞功能验证、β2m dKO 体内验证及代谢分析
Ikzf2fl/fl x Foxp3YFP-Cre 小鼠(Treg 特异性 Helios KO) Ikzf2fl/fl x Foxp3WT-RFP/Foxp3YFP-Cre 杂合雌性小鼠 β2-microglobulin 缺陷 dKO 小鼠 WT 与 KO 小鼠脾脏及脂肪组织 Tregs
Helios KO 小鼠脂肪组织 CD8+ T 细胞浸润和脂肪细胞破坏;β2m dKO 小鼠保留脂肪组织 AT KO Tregs 中 CD62L−Tcf1− eTreg 比例增加,ST2、CXCR3、Klrg1、IRF4 表达降低 ChIP-seq 显示 Helios 结合 Id3、Tcf7、Lef1、Bach2 位点 代谢指标:KO 小鼠血糖和胰岛素升高,胰岛素耐量试验显示胰岛素抵抗;dKO 小鼠代谢异常消失 杂合雌性小鼠竞争实验显示 eTreg 功能缺陷为细胞内在性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证 Helios 缺陷 Tregs 是否导致脂肪组织丢失和代谢紊乱。
对 4 周龄开始的小鼠进行代谢研究,检测脂肪质量、瘦质量、肝脏重量、肝甘油三酯、血糖、胰岛素、瘦素及胰岛素耐量试验,并进行 H&E 染色。
确定脂肪组织破坏是否由 CD8+ T 细胞介导。
对性腺和皮下 AT 进行流式免疫表型分析,检测 CD107、granzyme B、IFNγ 和 Fas-L 表达;将 KO 小鼠与 β2m 缺陷小鼠杂交,分析 dKO 小鼠脂肪组织和代谢指标。
分析 Helios 缺陷 AT Tregs 的表型变化及 eTreg 分化状态。
对脾脏和 AT Tregs 进行流式分析,检测 Foxp3、CD44、CD25、PD-1、ICOS、ST2、IL-10、IFNγ、t-bet、CD62L、Tcf1、Lef1、Id3、Klrg1、IRF4、CXCR3、IL-18R1 表达。
全面分析 Helios 缺陷 Tregs 的转录组变化。
对 6 周龄 WT 和 KO 小鼠脾脏及 AT Tregs 进行 RNA-seq,分析差异表达基因、PCA 和火山图。
鉴定 Helios 直接调控的靶基因。
对 WT 和 KO 脾脏 Tregs 进行 Helios ChIP-seq,鉴定富集峰、motif 和通路富集,并与转录组数据整合。
排除炎症环境的外在影响,验证 eTreg 缺陷是否为细胞内在性。
分析 Ikzf2fl/fl x Foxp3WT-RFP/Foxp3YFP-Cre 杂合雌性小鼠中 RFP+(WT)和 YFP+(KO)Tregs 的比例、转录组和表型。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型建立 | Ikzf2fl/fl x Foxp3YFP-Cre(KO)、Ikzf2fl/fl x Foxp3WT-RFP/Foxp3YFP-Cre 杂合雌性、β2m 缺陷 dKO、Helios-GFP x Foxp3-RFP、Ikzf2fl/fl x CD4-Cre x Foxp3-GFP 小鼠的遗传背景和构建方式 阅读提示:Animals 小节和 Fig. S1–S3 图注 |
| 代谢研究 | 小鼠年龄(4 周龄开始,36 周龄终点)、性别、样本量、胰岛素剂量(0.75 unit/kg i.p.)、禁食时间(2 h)、检测指标(血糖、胰岛素、瘦素、肝甘油三酯) 阅读提示:Metabolic studies 小节和 Fig. 1 图注 |
| 脂肪组织免疫表型分析 | 组织消化条件(Liberase TL 200 μg/ml,DNase I 20 μg/ml,20 min,37°C)、小鼠年龄(12–14 周龄)、流式抗体组合和设门策略 阅读提示:Flow cytometry analysis 小节和 Fig. 2、Fig. S2 图注 |
| RNA-seq 分析 | Treg 分选策略(dump gate 去除 CD8、NK、B 细胞)、小鼠年龄(6–7 周龄)、样本量(WT n=3,KO n=3)、测序平台(NextSeq 2000)和差异表达分析阈值 阅读提示:RNA-seq gene expression profiling 和 RNA-seq and data analysis 小节,Fig. 4 图注 |
| ChIP-seq 分析 | Helios 抗体(D8W4X)、交联条件(1% 甲醛,10 min)、超声片段大小(100–400 bp)、参考峰坐标(CistromeDB: 57122)、MACS2 峰 calling 阈值 阅读提示:ChIP, ChIP-seq, and data analysis 小节和 Fig. 5 图注 |