患者皮肤转录组分析防御素表达定位
确定防御素在银屑病患者皮肤中的表达细胞亚群及空间分布。
分析公共bulk RNAseq(GSE121212)、scRNAseq(GSE151177)和空间转录组(GSE202011)数据集,鉴定DEFB4A和DEFB103B表达的角质形成细胞亚群。
Defensins Mediate Skin Inflammation and Itch in Psoriasis
包含患者单细胞/空间转录组分析、Def cKO小鼠IMQ模型、中性粒细胞及T细胞功能验证、DRG钙成像机制验证
Def cKO小鼠(角质形成细胞特异性防御素基因簇敲除) Mrgpra3DTA小鼠(Mrgpra3+神经元消融) PirtSalsa与PirtGCaMP6s小鼠(DRG神经元钙成像) 银屑病患者皮肤转录组数据集(GSE121212、GSE151177、GSE202011)
Def cKO小鼠中Defb基因缺失验证:qPCR检测IMQ处理7天后Defb1、2、3、4、6、14表达 IMQ诱导银屑病模型:5% IMQ乳膏局部涂抹于颈背部及耳部,连续7天 中性粒细胞检测:流式门控Live CD45+CD11b+Ly6G+,免疫荧光anti-Ly6G IL-17分泌检测:骨髓来源中性粒细胞经hBD3(10 μM)或LPS(100 μg/mL)刺激12小时后ELISA检测上清IL-17 Mrgpra3神经元功能验证:hBD2(10 μM)刺激DRG神经元钙成像,及面颊注射hBD2(100 μM)后抓挠行为记录
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定防御素在银屑病患者皮肤中的表达细胞亚群及空间分布。
分析公共bulk RNAseq(GSE121212)、scRNAseq(GSE151177)和空间转录组(GSE202011)数据集,鉴定DEFB4A和DEFB103B表达的角质形成细胞亚群。
验证防御素缺失对银屑病样炎症表型的影响。
使用角质形成细胞特异性防御素基因簇敲除(Def cKO)小鼠和WT小鼠,颈背部及耳部涂抹5% IMQ连续7天,每日测量皮肤厚度、红斑、鳞屑并计算累积PSI评分,第8天取皮进行H&E染色。
探究防御素是否影响银屑病皮肤中中性粒细胞和T细胞浸润。
IMQ处理7天后取皮,流式细胞术检测中性粒细胞(Live CD45+CD11b+Ly6G+)和IL-17+ TCRγδ T细胞比例;免疫荧光检测Ly6G+细胞;qPCR检测炎症相关基因表达。
验证防御素能否直接刺激中性粒细胞释放IL-17。
分离WT小鼠骨髓来源中性粒细胞,用hBD2(10 μM)、hBD3(10 μM)、LPS(100 μg/mL)或PMA(100 μg/mL)刺激12小时,收集上清ELISA检测IL-17,同时LDH检测细胞毒性。
评估防御素缺失是否减轻银屑病相关瘙痒。
WT和Def cKO小鼠IMQ处理7天,第0天和第8天记录30分钟抓挠行为,手动计数和Scratch-AID自动分析。
验证Mrgpra3+神经元是否介导防御素诱导的瘙痒。
使用Mrgpra3DTA小鼠(Mrgpra3+神经元消融),IMQ处理7天记录抓挠行为;面颊注射mBD4、hBD2、hBD3(100 μM)后记录抓挠行为。
验证hBD2是否直接激活Mrgpra3+感觉神经元。
分离PirtSalsa小鼠DRG神经元,体外钙成像检测hBD2(10 μM)、CQ(1 mM)、capsaicin(30 μM)、KCl(100 mM)响应;分离WT和Mrgpra3DTA小鼠DRG神经元,Fluo-4负载后钙成像;PirtGCaMP6s小鼠L4 DRG在体钙成像,足底注射hBD2和CQ。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| IMQ诱导银屑病模型 | 5%咪喹莫特乳膏 | Padagis | -- |
| 流式细胞术 | Live/Dead可固定Aqua死细胞染色试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
| CD45-PerCP/Cyanine 5.5流式抗体 | BioLegend | QA17A26 | |
| CD11b-PE-eFluor 610流式抗体 | Invitrogen | M1/70 | |
| Ly6G-Brilliant Violet 421流式抗体 | BioLegend | 1A8 | |
| CD3-FITC流式抗体 | BioLegend | 17A2 | |
| TCR γ/δ-Brilliant Violet 421流式抗体 | BioLegend | GL3 | |
| IL-17F-PE流式抗体 | BioLegend | 9D3.1C8 | |
| 组织消化 | Liberase TL酶 | Roche | -- |
| DNase 1 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 免疫荧光 | 兔抗小鼠Ly6G抗体 | Cell Signaling Technology | E6Z1T |
| Alexa Fluor 488山羊抗兔IgG | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 含DAPI的Fluoromount-G封片剂 | Invitrogen | -- | |
| RNA提取与RT-PCR | TRIzol试剂 | -- | -- |
| Qiagen RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- | |
| High-Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | -- | |
| TaqMan Fast Advanced预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| 骨髓中性粒细胞分离 | 中性粒细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- |
| 细胞刺激 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| 人β-防御素2 | Anaspec | -- | |
| 人β-防御素3 | Anaspec | -- | |
| 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | Sigma-Aldrich | -- | |
| ELISA | DuoSet ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- |
| LDH检测 | LDH细胞毒性检测试剂盒II | -- | ab65393 |
| DRG培养 | 中性蛋白酶 | Gibco | -- |
| 胶原酶1 | Worthington | CSL-1 | |
| 多聚-D-赖氨酸 | -- | -- | |
| 层粘连蛋白 | -- | -- | |
| 体外钙成像 | Fluo-4 AM钙指示剂 | Invitrogen | -- |
| 氯喹 | -- | -- | |
| 辣椒素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| IMQ诱导银屑病模型 | IMQ浓度5%,每日涂抹颈背部及耳部,连续7天;小鼠年龄7-10周龄,性别匹配;第8天取皮 阅读提示:Methods 'Mouse lines and IMQ-induced psoriasis model' |
| 流式细胞术检测中性粒细胞和T细胞 | 皮肤消化条件(Liberase TL 1.67 Wunsch units/mL,DNase 1 10%,37°C 1.5小时);抗体克隆号及稀释比例;门控策略(中性粒细胞:Live CD45+CD11b+Ly6G+;IL-17+ T细胞:Live CD45+CD3+TCRγ/δ+IL-17+) 阅读提示:Methods 'Flow Cytometry';Figure 3b, 3e |
| 骨髓中性粒细胞刺激与IL-17检测 | 细胞数10^5/孔;刺激物浓度(LPS 100 μg/mL,hBD2 10 μM,hBD3 10 μM,PMA 100 μg/mL);刺激时间12小时;ELISA试剂盒及检测波长 阅读提示:Methods 'Isolation and stimulation of bone marrow-derived neutrophils'和'Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA)';Figure 3d |
| 抓挠行为学分析 | IMQ处理7天;适应期3天(每天15分钟);记录时间30分钟;面颊注射体积20 μL,浓度100 μM;手动计数与Scratch-AID分析 阅读提示:Methods 'Behaviour studies';Figure 4a-4j |
| DRG钙成像 | DRG来源小鼠周龄5-6周;hBD2浓度10 μM,CQ 1 mM,capsaicin 30 μM,KCl 100 mM;Fluo-4 AM浓度5 μM负载30分钟;激活阈值ΔF/F ≥ 50% 阅读提示:Methods 'In vitro calcium imaging'和'In vivo calcium imaging';Figure 5a-5d |