人源化小鼠模型建立与巨噬细胞群体界定
建立可支持人肺巨噬细胞发育的人源化小鼠模型,并鉴定 CD43− 与 CD43+ 巨噬细胞亚群。
比较 NSGS 与 NSG-Quad 人源化小鼠,移植人 CD34+ HSPC,流式检测 BAL 和肺中 CD64+ HLA-DR+ CD206+ CD14− 巨噬细胞及 CD43 等标志物。
IL-9R/Arg1 pathway promotes polyamine metabolism in human airway macrophages
含人源化小鼠体内IL-9处理、患者BAL样本、bulk RNA测序及nor-NOHA功能验证,多层级证据且含机制验证。
人源化 NSG-Quad 小鼠(移植人 CD34+ HSPC) NSGS 人源化小鼠 成人哮喘患者与健康对照 BAL 样本 儿童哮喘患者 BAL 样本 人单核细胞来源巨噬细胞(hMDMs)
人源化 NSG-Quad 小鼠经鼻内给予重组人 IL-9 2 μg/天,连续 3 天,末次处理后 1 天处死 成人哮喘患者 n=6 与健康对照 n=5 的 BAL 样本流式分析 T2-high 哮喘儿童 n=6 与 T2-low 哮喘儿童 n=6 的 BAL 样本比较 hMDMs 经 20 ng/mL IL-9 处理,有或无 100 μM nor-NOHA,24 小时后检测 流式分选 CD43− 与 CD43+ BAL 巨噬细胞后进行 bulk RNA 测序,显著阈值 adj p < 0.05 且 |log2FC| > 1
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立可支持人肺巨噬细胞发育的人源化小鼠模型,并鉴定 CD43− 与 CD43+ 巨噬细胞亚群。
比较 NSGS 与 NSG-Quad 人源化小鼠,移植人 CD34+ HSPC,流式检测 BAL 和肺中 CD64+ HLA-DR+ CD206+ CD14− 巨噬细胞及 CD43 等标志物。
直接评估 IL-9 对人肺巨噬细胞群体扩增和表型的影响。
人源化 NSG-Quad 小鼠经鼻内给予重组人 IL-9,流式检测肺和 BAL 中 CD43−/CD43+ 巨噬细胞比例和数量,以及 IL-9R、Arg1 表达。
验证人源化小鼠发现是否在哮喘患者中重现,并比较成人及儿童患者。
收集成人哮喘与健康对照、儿童 T2-high 与 T2-low 哮喘患者 BAL,流式检测 CD43−/CD43+ 巨噬细胞比例及 IL-9R、Arg1 表达。
解析哮喘中 CD43− 巨噬细胞的转录特征。
流式分选成人 BAL CD43− 和 CD43+ 巨噬细胞,进行 bulk RNA 测序、PCA 和差异基因分析。
检测 IL-9 是否改变肺微环境中 Arg1 下游多胺及重塑相关代谢物。
检测患者 BALF、人源化小鼠 BALF 和 hMDMs 中总多胺及羟脯氨酸浓度,并与巨噬细胞表型进行相关性分析。
直接验证 IL-9 诱导的多胺生成是否依赖精氨酸酶活性。
培养 hMDMs,经 IL-4 和 IL-9 处理,有或无 nor-NOHA,检测 Arg1 表达、精氨酸酶活性、多胺和羟脯氨酸。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | NSG QUAD 小鼠 | The Jackson Laboratory | Strain # 028657 |
| NSGS 小鼠 | The Jackson Laboratory | stock no. 013062 | |
| Teklad Uniprim 药物饲料 | Harlan Laboratories | TD 06596 | |
| 细胞培养 | StemSpan SFEM II 培养基 | StemCell Technologies | -- |
| 重组人 SCF | Peprotech | -- | |
| 动物照射 | MARK I 68A 型照射器 | JL Shepherd & Associates | -- |
| IL-9 处理 | 重组人 IL-9 | Biolegend | 594404 |
| 肺组织消化 | 胶原酶 A | Roche | -- |
| 红细胞裂解 | ACK 裂解缓冲液 | Lonza | -- |
| 多胺检测 | 总多胺检测试剂盒 | Abcam | -- |
| 荧光检测 | FilterMax F5 多模式微孔板读数仪 | Molecular Devices | -- |
| IL-9 ELISA | IL-9 酶联免疫吸附测定试剂盒 | Biolegend | -- |
| 羟脯氨酸检测 | 总羟脯氨酸检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | MAK459 |
| hMDMs 培养 | 人 M-CSF | BioLegend | 574805 |
| hMDMs 处理 | 人 IL-4 | R&D systems | 202-IL |
| 精氨酸酶抑制 | Nω-羟基-去甲-L-精氨酸二乙酸盐(nor-NOHA) | Sigma-Aldrich | 399275–1MG |
| RNA 提取 | RNeasy Micro 试剂盒 | Qiagen | 74004 |
| cDNA 合成 | SMART-Seq v4 超低起始量 RNA 测序试剂盒 | Takara Clontech Laboratories, Inc. | -- |
| 文库构建 | Nextera XT DNA 文库构建试剂盒 | Illumina, Inc. | -- |
| RNA 测序 | NovaSeq X PLUS 测序仪 | Illumina, Inc. | -- |
| 流式细胞术 | LSR4 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| Fortessa 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| FACSAria 流式细胞分选仪 | BD Biosciences | -- | |
| SORPAria 流式细胞分选仪 | BD Biosciences | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人源化小鼠 IL-9 处理模型 | 重组人 IL-9 剂量 2 μg/天、连续 3 天经鼻内给药、末次处理后 1 天处死、n=10 PBS 与 IL-9 组 阅读提示:Materials and Methods 中 IL-9 injection model 小节 |
| 患者 BAL 样本流式分析 | 成人哮喘 n=6 与健康对照 n=5;儿童 T2-high n=6 与 T2-low n=6;BAL 新鲜细胞用于流式;CD64+ HLA-DR+ CD206+ 门控 阅读提示:Materials and Methods 中 Patient samples 和 Flow cytometry 小节;Figure 2、Figure 3G、Figure 6 图注 |
| hMDMs 培养与 nor-NOHA 功能验证 | PBMC 在含 50 ng/mL M-CSF 的 DMEM 中培养 5 天;5 ng/mL IL-4 处理 24 小时;20 ng/mL IL-9 有或无 100 μM nor-NOHA;24 小时后收集样本;n=4 阅读提示:Materials and Methods 中 Human monocyte-derived macrophages (hMDMs) culture and treatment 小节;Figure 8K–M 图注 |
| bulk RNA 测序与差异基因分析 | 3 例患者 BAL 细胞混合后分选 CD43−/+ 巨噬细胞;每样本 1 ng RNA;NovaSeq X PLUS 100 bp 双端测序;DESeq2 阈值 adj p < 0.05 且 |log2FC| > 1 阅读提示:Materials and Methods 中 Cell sorting and bulk RNA sequencing 及 Analysis of Bulk RNA sequencing 小节;Figure 7 图注 |
| 多胺及羟脯氨酸代谢物检测 | 总多胺检测使用 Abcam 试剂盒,535/587 nm 荧光;羟脯氨酸使用 Sigma-Aldrich MAK459,560 nm 吸光度;样本来源包括 BALF、细胞裂解液和培养基 阅读提示:Materials and Methods 中 Total polyamine assay 和 Hydroxyproline Assay 小节;Figure 8 图注 |