儿童CKMD表型与循环蛋白质组关联分析
鉴定与儿童期CKMD表型相关的循环蛋白质
对273名儿童的血浆5,420种蛋白质(Olink Explore HT)与25种CKMD表型进行线性混合效应回归
Paediatric proteomic signatures of cardiometabolic disease-associated traits predict adult disease outcomes
含儿童与成人血浆蛋白质组、UK Biobank队列、GLP-1RA干预及PWAS遗传验证等多层证据
BHRC西班牙裔/拉丁裔儿童与青少年(273人,血浆蛋白质组) BHRC同社区成人(494人) UK Biobank成人队列(28,256人) STEP 1 semaglutide随机临床试验成人蛋白质组
儿童血浆蛋白质组与25种CKMD表型的线性混合效应回归(q<0.05) 儿童与成人表型-蛋白质组效应量的Pearson相关性比较 PCA联合LASSO构建6个潜在因子蛋白质组评分并应用于成人队列 UK Biobank中儿童来源蛋白质组评分与CKMD结局的Cox回归 基于遗传预测蛋白质组的PWAS与Mendelian randomization分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定与儿童期CKMD表型相关的循环蛋白质
对273名儿童的血浆5,420种蛋白质(Olink Explore HT)与25种CKMD表型进行线性混合效应回归
检验儿童期蛋白质组-表型关系是否在成人中重现
在685名BHRC成人中应用相同建模策略,比较儿童与成人效应量
构建儿童CKMD表型的多蛋白质复合评分
对16种表型进行PCA,保留6个varimax旋转正交潜在因子,用LASSO回归构建蛋白质组评分
检验儿童来源蛋白质组评分与成人CKMD横断面和纵向结局的关联
将儿童LASSO模型重新校准后应用于BHRC成人和UK Biobank成人,进行Cox回归
评估儿童CKMD相关蛋白质在成人GLP-1RA治疗中是否发生有利变化
将1,032种儿童CKMD相关蛋白质映射到STEP 1临床试验semaglutide治疗68周后的蛋白质组数据
检验儿童CKMD相关且GLP-1RA响应的蛋白质是否与成人CKMD结局存在遗传关联
对131种蛋白质进行PWAS,整合ARIC遗传预测模型和大型GWAS数据
评估CKMD相关蛋白质在儿童至成人过渡期的变异性来源
利用BAMSE队列纵向蛋白质组数据,分析年龄和性别解释的变异比例
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质组分析 | Olink Explore HT | Olink | -- |
| Olink Explore 3072 | Olink | -- | |
| SomaScan | -- | -- | |
| 肝脏影像学 | FibroScan | Echosens | -- |
| 体成分分析 | 双能X射线吸收仪 | Hologic | -- |
| 药物处理 | 司美格鲁肽 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 儿童CKMD表型与蛋白质组关联分析 | 儿童样本量273人、年龄13.1±2.7岁、性别比例53%女性;蛋白质检测平台Olink Explore HT,5,420种蛋白质;统计模型校正年龄和性别;FDR方法Benjamini–Yekutieli 阅读提示:Methods中Study sample、Paediatric and adult CKMD phenotyping、Proteomics、Association of the circulating proteome with CKMD phenotypes in children and adults |
| 儿童多蛋白质CKMD特征构建 | PCA纳入16种表型;保留6个潜在因子;LASSO回归五折交叉验证重复5次;缺失值随机森林插补;蛋白质和表型均值中心化和标准化 阅读提示:Methods中Identifying a proteomic signature across CKMD phenotypes in childhood using machine learning approaches |
| 儿童CKMD蛋白质组评分在UK Biobank中的验证 | UK Biobank样本量28,256人;中位随访13.7年;Cox回归校正变量包括年龄、年龄²、性别、种族、BMI、HbA1c、TG、HDL-C、Townsend剥夺指数、吸烟和饮酒;每个潜在因子模型样本量不同 阅读提示:Methods中Paediatric proteomic signatures of CKMD and long-term adult CKMD outcomes;Extended Data Table 1;Fig. 5图注 |
| GLP-1RA治疗蛋白质组可调节性分析 | STEP 1临床试验semaglutide治疗68周;SomaScan平台;q-value≤0.05;映射1,032种儿童CKMD相关蛋白质 阅读提示:Methods中Paediatric proteomic signatures related to dynamic changes in the circulating proteome with GLP-1 receptor agonist therapy in adults;Fig. 6图注 |
| PWAS遗传验证 | 131种蛋白质纳入PWAS;遗传预测模型来自7,213名欧洲血统ARIC参与者;GWAS样本量因结局不同而异;Bonferroni校正阈值0.05 阅读提示:Methods中Genetically predicted PWAS;Extended Data Fig. 4图注 |