病毒分离与全基因组测序
从表现呼吸道症状的鸡中分离H6 AIVs并鉴定其基因组成。
采集咽喉拭子接种10日龄SPF鸡胚,收获尿囊液进行HA试验和RT-PCR筛选,阳性样本全基因组测序, plaque纯化获得六株H6分离株。
Novel emerging reassortant H6 avian influenza viruses with internal genes from G57 genotype of H9N2 pose potential zoonotic risk
含体外细胞模型、反向遗传重配、小鼠和鸡体内攻毒及传播实验,并开展受体结合与聚合酶活性机制验证
鸡和Houdan鸡咽喉拭子分离的H6N1/H6N2禽流感病毒 CEF、MDCK和A549细胞 BALB/c小鼠 10日龄SPF鸡
病毒分离株:CZ56、CZ57、CZ58、CZ511、AH25107(H6N1)和NJ2501(H6N2) 细胞感染:CEF、MDCK和A549细胞,MOI为0.01,检测6、12、24、48和72 hpi病毒滴度 小鼠攻毒:5周龄BALB/c小鼠,每组11只,经鼻接种105 TCID50,监测14天体重和存活 鸡攻毒:10日龄SPF鸡,每组106只,经鼻接种0.1 mL,每组4只直接接触鸡,检测3和5 dpi气管和肺病毒滴度及2、4、6、8、10 dpi拭子排毒 反向遗传重配:rCZ56以XZ508(G57 H9N2)为骨架,含CZ56 HA,用于受体结合分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从表现呼吸道症状的鸡中分离H6 AIVs并鉴定其基因组成。
采集咽喉拭子接种10日龄SPF鸡胚,收获尿囊液进行HA试验和RT-PCR筛选,阳性样本全基因组测序, plaque纯化获得六株H6分离株。
追溯H6分离株各基因片段的进化来源和重配模式。
使用MAFFT、BEAST、MEGA 11等软件对HA、NA和内部基因进行系统发育分析,构建MCC树和邻接树。
评估H6分离株与致病性、传播和耐药相关的关键氨基酸位点。
分析HA裂解位点、受体结合位点、PB2、PB1、PA、NP、M、NS1等蛋白的分子标记。
评估H6分离株的血凝能力和病毒释放特性。
使用鸡、鹅、火鸡和豚鼠红细胞进行血凝试验,鸡红细胞进行洗脱动力学试验,MUNANA为底物检测NA活性。
检测H6分离株对禽样和人样受体的结合能力。
使用Neu5Acα2-3Galb1-4GlcNAcb-sp3-PAA-biotin和Neu5Acα2-6Galb1-4GlcNAcb-sp3-PAA-biotin两种糖聚合物进行ELISA结合试验,并以反向遗传重配病毒rCZ56验证H6N1 HA的内在结合能力。
评估H6分离株在禽源和哺乳动物细胞中的复制能力。
在CEF、MDCK和A549细胞中感染H6病毒,检测不同时间点病毒滴度,并在MDCK细胞中进行蚀斑试验。
评估H6分离株对哺乳动物的致病性。
5周龄BALB/c小鼠经鼻接种H6病毒,监测体重和存活,检测鼻甲、肺和脑组织病毒滴度,并进行肺组织病理分析。
评估H6分离株在鸡中的致病性和接触传播能力。
10日龄SPF鸡经鼻接种H6病毒,引入未感染接触鸡,检测气管和肺病毒滴度及口咽和泄殖腔拭子排毒。
比较H6分离株与参考毒株的RNP聚合酶活性。
在293 T细胞中共转染荧光素酶报告质粒和RNP质粒,48 h后检测荧光素酶活性。
评估H6分离株之间是否存在抗原漂移。
收集21 dpi剩余鸡血清,进行交叉血凝抑制试验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| NA活性检测 | 4-甲基伞形酮-N-乙酰神经氨酸 | Sigma-Aldrich | -- |
| 96孔黑色微孔板 | Thermo Fisher | -- | |
| BioTek Synergy-2酶标仪 | BioTek | -- | |
| 受体结合分析 | 禽样受体糖聚合物 | Glycitech | -- |
| 人样受体糖聚合物 | Glycitech | -- | |
| Pierce链霉亲和素高结合容量包被96孔板 | Pierce | -- | |
| H6特异性单克隆抗体4C2 | 本实验室制备 | -- | |
| HRP偶联抗鼠IgG抗体 | -- | -- | |
| TMB底物 | -- | -- | |
| 病毒拯救 | pDP2002质粒 | -- | -- |
| ExnaseTM II重组酶 | -- | -- | |
| 聚合酶活性检测 | 双荧光素酶报告系统 | -- | -- |
| 细胞培养 | opti-MEM培养基 | -- | -- |
| TPCK-胰蛋白酶 | -- | -- | |
| 蚀斑试验 | 0.1%结晶紫溶液 | -- | -- |
| 组织病理学 | 10%中性缓冲福尔马林 | -- | -- |
| 血凝抑制试验 | 0.5%红细胞 | -- | -- |
| 统计 | GraphPad 8软件 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 病毒分离 | 样本来源:2025年中国表现呼吸道症状的鸡和Houdan鸡咽喉拭子;鸡胚:10日龄SPF鸡胚,孵育72 h 阅读提示:Methods中Viral isolation and identification小节 |
| 体外复制动力学 | 细胞系:CEF、MDCK、A549;MOI:0.01;维持液:opti-MEM含1 μg/mL TPCK-trypsin;采样时间:6、12、24、48、72 hpi;重复:三次 阅读提示:Methods中Viral growth kinetics小节及Figure 5图注 |
| 受体结合分析 | 糖聚合物:Neu5Acα2-3Galb1-4GlcNAcb-sp3-PAA-biotin和Neu5Acα2-6Galb1-4GlcNAcb-sp3-PAA-biotin;浓度:5、0.2、0.008 μg/mL;病毒用量:64 HAU;检测抗体:4C2 阅读提示:Methods中Receptor binding preference analysis小节及Figure 4图注 |
| 小鼠攻毒 | 小鼠:5周龄BALB/c,每组11只;接种剂量:105 TCID50/25 μL,经鼻;监测14天;3和5 dpi各安乐死3只采样;安乐死标准:体重下降超过25% 阅读提示:Methods中Mouse challenge study小节及Figure 6图注 |
| 鸡攻毒与传播 | 鸡:10日龄SPF,每组106只,经鼻接种0.1 mL;接触鸡:每组4只;3和5 dpi各安乐死3只;口咽和泄殖腔拭子采集时间:2、4、6、8、10 dpi 阅读提示:Methods中Chicken challenge study小节及Figure 8图注 |
| 聚合酶活性检测 | 细胞:293 T;质粒:p-Luci、RNP质粒、Renilla内参;检测时间:48 h;重复:三次 阅读提示:Methods中Luciferase assay for polymerase activity小节及Figure 7图注 |
| 反向遗传重配 | 骨架:A/chicken/Xuzhou/508/2019(H9N2)(XZ508);HA来源:CZ56;转染细胞:293 T和MDCK共培养;收毒时间:转染后3天 阅读提示:Methods中Plasmid construction and virus rescue小节及Supplementary Figure 2 |