样本与数据采集
获取全国代表性成人样本的血液RNA及社会人口学、行为与临床协变量数据。
从Add Health第5波随机三分之一子样本中,于家访体检时采集静脉血至PAXgene Blood RNA管,提取全血polyadenylated RNA进行测序,并收集人口学和行为协变量。
Perceived everyday discrimination and leukocyte gene expression in a nationally representative sample of U.S. Adults
基于全国代表性队列的横断面观察分析,使用全血RNA测序评估52基因CTRA,并进行了加权回归及二次项检验。
Add Health第5波全国代表性成人队列(n=1,051) 全血白细胞RNA测序样本
日常歧视量表5条目平均分经z分数标准化 CTRA 52基因先验集(19个促炎基因与33个I型干扰素/抗体反应基因)表达量 加权回归模型逐步调整批次、人口学、生活方式及白细胞亚型协变量 二次项回归模型检验非线性关联并计算Johnson-Neyman边界 敏感性分析额外调整CRP和教育程度
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取全国代表性成人样本的血液RNA及社会人口学、行为与临床协变量数据。
从Add Health第5波随机三分之一子样本中,于家访体检时采集静脉血至PAXgene Blood RNA管,提取全血polyadenylated RNA进行测序,并收集人口学和行为协变量。
量化感知的日常歧视暴露水平。
使用5条目改编版日常歧视量表评估人际不公正待遇频率,4点Likert计分,取平均后z分数标准化。
计算先验定义的CTRA复合评分及其子成分评分。
使用52个CTRA相关基因(19个促炎基因和33个I型干扰素/抗体反应基因),log2转化并标准化后计算促炎评分、干扰素/抗体评分及CTRA复合评分(促炎减干扰素/抗体)。
检验日常歧视与CTRA及其子成分的线性和非线性关联。
采用加权线性回归和二次项回归模型,逐步调整协变量,并使用Johnson-Neyman分析确定简单斜率显著性区域。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 血液采集 | PAXgene血液RNA采血管 | BD Biosciences | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本与数据采集 | 样本来源:Add Health第5波随机三分之一子样本;血液采集管:10 mL PAXgene Blood RNA vacutainer管(BD Biosciences);测序平台及批次:文中未明确说明具体型号 阅读提示:Methods中Study Design, Setting, and Sample小节 |
| 日常歧视评估 | 量表版本:5条目改编版日常歧视量表;计分范围:0-3;标准化方法:z分数;内部一致性:α = .80 阅读提示:Methods中Perceived Everyday Discrimination小节 |
| CTRA基因表达量化 | 基因集:52个基因(19个促炎,33个I型干扰素/抗体);数据转化:log2转化并标准化;复合评分计算方式:促炎评分减干扰素/抗体评分 阅读提示:Methods中Conserved Transcriptional Response to Adversity小节 |
| 统计关联分析 | 模型调整变量:模型1批次;模型2批次+人口学+收入;模型3+生活方式+白细胞亚型;权重:第5波生物标志物子样本权重;显著性水平:p < 0.05;敏感性分析:额外调整CRP和教育程度 阅读提示:Methods中Statistical Analysis小节及Table 2脚注 |
| 协变量评估 | 年龄范围:33-42岁;BMI范围:15.3-72.0 kg/m2;收入分类:7类;吸烟状态:ever vs. never;酗酒频率:6级;白细胞亚型:CD3D, CD19, CD4, FCGR3A, CD14 阅读提示:Methods中Covariates小节 |