文献筛选与数据提取
系统收集和筛选报告欧洲和非洲迁徙鸟类中AIV检测的已发表研究
按照PRISMA指南,从PubMed、African Journals Online、Scopus和Web of Science检索2005年1月至2025年12月发表的英文文献,筛选符合纳入标准的研究,提取元数据、地理数据、鸟类相关数据和病毒相关数据。
Circulation of avian influenza viruses in migratory birds in Europe and in Africa: a systematic review
本文为系统综述,按PRISMA指南筛选72篇文献进行数据分析,未开展原始实验,无体外、动物或功能验证。
迁徙鸟类(166个物种,32个科,17个目) 欧洲和非洲三条迁徙路线(大西洋、地中海、博斯普鲁斯)
纳入文献72篇(2005–2025年),欧洲53篇,非洲19篇 总样本量233,683只迁徙鸟类,AIV阳性10,785只(4.7%) 三条迁徙路线:大西洋路线161,286只(3.6%阳性),地中海路线66,197只(6.8%阳性),博斯普鲁斯路线6,139只(9.6%阳性) H5N1阳性占AIV阳性11.0%,分布于21个国家 检测到的H5N1 clade:2.3.4.4b(2020年后唯一检测到的clade),2.2.1和2.3.2(2020年前)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
系统收集和筛选报告欧洲和非洲迁徙鸟类中AIV检测的已发表研究
按照PRISMA指南,从PubMed、African Journals Online、Scopus和Web of Science检索2005年1月至2025年12月发表的英文文献,筛选符合纳入标准的研究,提取元数据、地理数据、鸟类相关数据和病毒相关数据。
计算全球和迁徙路线水平的AIV阳性比例及血清型比例,确定H5N1比例
基于每篇文献的阳性数和样本量,计算AIV阳性比例和血清型比例,按迁徙路线分类(大西洋、地中海、博斯普鲁斯),分析H5N1比例。
比较三条迁徙路线(大西洋、地中海、博斯普鲁斯)的AIV阳性率、亚型多样性和HPAIV/LPAIV分布
将数据按三条主要迁徙路线分类,分析各路线鸟类目组成、AIV阳性比例、亚型频率、H5N1分布及HPAIV/LPAIV比例。
分析H5N1在三条迁徙路线上的分布、阳性率范围、涉及鸟类目和clade随时间的变化
提取H5N1阳性数据,按国家、年份、鸟类目和clade分类分析H5N1阳性率范围和时间趋势。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 文献筛选 | 检索数据库、发表时间范围(2005年1月–2025年12月)、语言限制(英文)、纳入/排除标准、PRISMA流程 阅读提示:Methods部分及Figure 2的PRISMA流程图 |
| 数据提取 | 提取的元数据、地理数据、鸟类相关数据和病毒相关数据的具体字段 阅读提示:Methods部分数据提取列表及Supplementary Table S1 |
| AIV阳性比例计算 | 阳性数和样本量的定义、按迁徙路线分类的标准、H5N1比例的计算方法 阅读提示:Methods部分及Results部分AIV circulation and subtype diversity by flyway小节 |
| 迁徙路线分类 | 三条迁徙路线(大西洋、地中海、博斯普鲁斯)的地理定义和国家归属 阅读提示:Methods部分及Figure 1 |
| H5N1 clade分析 | clade 2.3.4.4b、2.2.1、2.3.2的时间分布和地理分布 阅读提示:Results部分H5n1 subtypes distribution and species involved小节及Table 1 |