欧洲和非洲迁徙鸟类中禽流感病毒的传播:一项系统综述

Circulation of avian influenza viruses in migratory birds in Europe and in Africa: a systematic review

作者信息Baptiste Defaye, Maeva Lamarque, Jerome Moreau, Thibaut Gelle, Christine Imbert, Denis Malvy, Laurence Delhaes, Aurélien Mercier, Sébastien Hantz, on the behalf of the EMERG Consortium
PMID42751944
发布时间2026-12
DOI10.1080/22221751.2026.2728774

实验完整度

低

本文为系统综述,按PRISMA指南筛选72篇文献进行数据分析,未开展原始实验,无体外、动物或功能验证。

主要模型

迁徙鸟类(166个物种,32个科,17个目) 欧洲和非洲三条迁徙路线(大西洋、地中海、博斯普鲁斯)

重点核对

纳入文献72篇(2005–2025年),欧洲53篇,非洲19篇 总样本量233,683只迁徙鸟类,AIV阳性10,785只(4.7%) 三条迁徙路线:大西洋路线161,286只(3.6%阳性),地中海路线66,197只(6.8%阳性),博斯普鲁斯路线6,139只(9.6%阳性) H5N1阳性占AIV阳性11.0%,分布于21个国家 检测到的H5N1 clade:2.3.4.4b(2020年后唯一检测到的clade),2.2.1和2.3.2(2020年前)

摘要

禽流感病毒(AIV)是全球动物和人类群体中疫情出现和再现的日益重要的驱动因素。其传播受到迁徙鸟类、人类活动和气候变化的影响。欧洲和非洲涵盖了几条正在经历显著环境和生态变化的主要迁徙路线。在这项按照PRISMA指南进行的系统综述中,我们分析了报告欧洲和非洲迁徙鸟类中AIV检测的已发表研究。共纳入72篇出版物(2005–2025年),其中53篇来自欧洲,19篇来自非洲。总体而言,在连接欧洲和非洲的三条主要迁徙路线(大西洋路线、地中海路线和博斯普鲁斯路线)上,共报告了10,960只迁徙鸟类,代表166个物种、32个科和17个目。发表趋势与过去十年主要的HxNy疫情暴发相一致。检测到低致病性和高致病性禽流感病毒(LPAIV和HPAIV),其中LPAIV占优势(86% vs 14% HPAIV)。LPAIV在整个研究期间持续被报告,而HPAIV检测主要局限于2005年H5N1疫情暴发后及2020年后的疫情波次期间。H5N1占AIV检测的11%,在17个欧洲国家和4个非洲国家被报告,自2020年以来以clade 2.3.4.4b为主。总体而言,本综述强调了不同鸟类目对AIV传播的贡献——特别是在H5N1的出现和再现中——并突出了地中海路线在欧洲和非洲之间AIV监测中连接三条路线的核心作用。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
欧洲和非洲迁徙鸟类中禽流感病毒的当前流行情况、近年演变趋势、主要阳性鸟类科,以及HPAIV/LPAIV在三条相互连接的迁徙路线(尤其是H5N1亚型)上的分布特征是什么。
核心机制
迁徙鸟类通过三条主要迁徙路线(大西洋、地中海、博斯普鲁斯)运输LPAIV和HPAIV,地中海路线作为欧洲和非洲之间的关键流行病学界面,其中心地理位置可能促进病毒交换和重组。
主要证据
基于72篇出版物(2005–2025年)的系统综述,涵盖233,683只迁徙鸟类和10,785只AIV阳性鸟类;H5N1占AIV阳性的11.0%,Anseriformes占H5N1阳性鸟类的81.1%;地中海路线HPAIV比例最高(20.3%),且AIV阳性物种多样性最高(90种)。
研究意义
本综述首次综合了欧洲和非洲之间迁徙鸟类中AIV的传播情况,强调应在跨大陆尺度上对三条迁徙路线进行AIV监测,地中海路线作为关键流行病学界面;扩大监测范围至更广泛的鸟类目和代表性不足的非洲地区,将有助于理解鸟类迁徙在AIV传播中的作用并预测未来疫情。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

文献筛选与数据提取

系统收集和筛选报告欧洲和非洲迁徙鸟类中AIV检测的已发表研究

按照PRISMA指南,从PubMed、African Journals Online、Scopus和Web of Science检索2005年1月至2025年12月发表的英文文献,筛选符合纳入标准的研究,提取元数据、地理数据、鸟类相关数据和病毒相关数据。

2

AIV阳性比例与亚型多样性分析

计算全球和迁徙路线水平的AIV阳性比例及血清型比例,确定H5N1比例

基于每篇文献的阳性数和样本量,计算AIV阳性比例和血清型比例,按迁徙路线分类(大西洋、地中海、博斯普鲁斯),分析H5N1比例。

3

按迁徙路线分析AIV分布与亚型特征

比较三条迁徙路线(大西洋、地中海、博斯普鲁斯)的AIV阳性率、亚型多样性和HPAIV/LPAIV分布

将数据按三条主要迁徙路线分类,分析各路线鸟类目组成、AIV阳性比例、亚型频率、H5N1分布及HPAIV/LPAIV比例。

4

H5N1亚型分布与时间趋势分析

分析H5N1在三条迁徙路线上的分布、阳性率范围、涉及鸟类目和clade随时间的变化

提取H5N1阳性数据,按国家、年份、鸟类目和clade分类分析H5N1阳性率范围和时间趋势。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
ExcelMicrosoft--
QGIS--v.3.34.14

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
文献筛选
检索数据库、发表时间范围(2005年1月–2025年12月)、语言限制(英文)、纳入/排除标准、PRISMA流程
阅读提示:Methods部分及Figure 2的PRISMA流程图
数据提取
提取的元数据、地理数据、鸟类相关数据和病毒相关数据的具体字段
阅读提示:Methods部分数据提取列表及Supplementary Table S1
AIV阳性比例计算
阳性数和样本量的定义、按迁徙路线分类的标准、H5N1比例的计算方法
阅读提示:Methods部分及Results部分AIV circulation and subtype diversity by flyway小节
迁徙路线分类
三条迁徙路线(大西洋、地中海、博斯普鲁斯)的地理定义和国家归属
阅读提示:Methods部分及Figure 1
H5N1 clade分析
clade 2.3.4.4b、2.2.1、2.3.2的时间分布和地理分布
阅读提示:Results部分H5n1 subtypes distribution and species involved小节及Table 1