iHLCs的生成与表征
验证HLA-A、HLA-B和CIITA三敲除iPSCs可分化为功能成熟的肝细胞样细胞
将TKO iPSCs分化为iHLCs,通过形态学、标志物表达、代谢功能(白蛋白分泌、尿素产生、葡萄糖分泌、胆红素摄取)和HLA表面表达分析进行表征
Reversal of ACLF and ALF using whole blood extracorporeal system combining HLA-depleted liver organoids with granulocyte-monocyte apheresis
包含体外iHLC功能验证、ACLF和ALF两种大鼠模型体内验证及AFP敲除机制验证
HLA-A/B/CIITA三敲除iPSC来源的iHLC类器官 SD大鼠BDL+LPS诱导的ACLF模型 SD大鼠D-半乳糖胺诱导的ALF模型 PHH球状体与HepG2 C3A细胞
iHLCs中HLA-A24和HLA-B7表面表达经IFN-γ处理24小时后检测缺失 BDL+LPS大鼠随机分为无治疗、空柱、GMA、iHLC、HepG2+GMA和UTOpiA组,每组n=4-9 LPS腹腔注射剂量0.25 mg/kg,注射后1小时开始2小时体外循环 D-半乳糖胺诱导ALF大鼠,给药后24小时进行2小时UTOpiA治疗 AFP敲除iHLCs与AFP野生型iHLCs在ACLF大鼠中比较肝脏损伤和p21阳性细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证HLA-A、HLA-B和CIITA三敲除iPSCs可分化为功能成熟的肝细胞样细胞
将TKO iPSCs分化为iHLCs,通过形态学、标志物表达、代谢功能(白蛋白分泌、尿素产生、葡萄糖分泌、胆红素摄取)和HLA表面表达分析进行表征
建立可进行全血暴露的体外循环系统并确定最佳连接顺序
将海藻酸封装的iHLCs与GMA柱串联,测试GMA柱位于iHLC柱上游或下游对iHLCs的保护效果
验证UTOpiA对ACLF大鼠生存率、肝脏功能、炎症和再生的影响
BDL+LPS大鼠接受2小时体外循环,监测3天生存率,检测血浆生化、细胞因子、肝脏组织学和RNA-seq
验证UTOpiA在另一种急性肝衰竭模型中的疗效
D-半乳糖胺诱导ALF大鼠,24小时后进行2小时UTOpiA治疗,监测3天生存率和肝脏损伤
探究UTOpiA对肝细胞转录状态的影响
对治疗后24小时肝脏进行RNA-seq,使用decoupleR推断转录因子活性,免疫荧光验证HNF4α表达
确定iHLC分泌的AFP在UTOpiA治疗效果中的作用
通过CRISPR-Cas9生成AFP敲除iHLCs,比较AFP WT和KO iHLCs在ACLF大鼠中的治疗效果
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | StemFit AK02N培养基 | Ajinomoto Co | -- |
| iMatrix-511 | Nippi | -- | |
| Matrigel基质胶 | Corning | -- | |
| HCM肝细胞培养基套装 | Lonza | -- | |
| EZSPHERE 6孔微孔板900 | AGC | -- | |
| CELL-BANKER 1冻存液 | Nippon Zenyaku Kogyo Co, Ltd | -- | |
| 分化诱导 | 激活素A | R&D Systems | -- |
| 骨形态发生蛋白4 | R&D Systems | -- | |
| CHIR99021 | Stemgent | -- | |
| 成纤维细胞生长因子4 | R&D Systems | -- | |
| Y-27632 | -- | -- | |
| 制瘤素M | -- | -- | |
| 肝细胞生长因子 | -- | -- | |
| DAPT | -- | -- | |
| 流式分析 | 抗HLA-A24单克隆抗体-Alexa Fluor 647 | MBL | -- |
| 抗HLA-B7抗体 | Bio-Rad | -- | |
| 山羊Alexa Fluor 647抗小鼠IgG抗体 | Invitrogen | -- | |
| Ghost Dye Violet 450 | TONBO | -- | |
| BD LSR Fortessa流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 功能检测 | 人白蛋白ELISA定量试剂盒 | Bethyl Laboratories | -- |
| QuantiChrom尿素测定试剂盒 | BioAssay Systems | -- | |
| Glucose-Glo测定 | Promega | -- | |
| 大鼠细胞因子阵列 | RayBiotech | -- | |
| HGF ELISA试剂盒 | R&D | MHG00 | |
| 甲胎蛋白ELISA试剂盒 | RayBiotech | ELH-AFP-1 | |
| 血浆生化 | DRI-CHEM NX500V生化分析仪 | Fujifilm | -- |
| RNA提取 | TRI试剂 | Molecular Research Center | -- |
| FastGene RNA Premium试剂盒 | NIPPON Genetics | -- | |
| RNA测序 | MGIEasy RNA定向文库制备套装V2.0 | MGI Tech | -- |
| DNBSEQ-G400测序仪 | MGI Tech | -- | |
| 动物实验 | 大肠杆菌O111:B4脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| 醋酸纤维素珠 | -- | -- | |
| 显微成像 | BZ-X800显微镜 | KEYENCE | -- |
| SP8共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| THUNDER 3D活细胞成像系统 | Leica | -- | |
| FV3000共聚焦显微镜 | EVIDENT | -- | |
| Cell3Imager duos2 | SCREEN | -- | |
| 微孔板检测 | FLUOstar OPTIMA-6微孔板读数仪 | BMG Labtech | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| ACLF大鼠模型建立 | BDL结扎21天诱导胆汁性肝硬化,LPS剂量0.25 mg/kg腹腔注射,LPS后1小时开始2小时体外循环,大鼠品系Sprague-Dawley雄性300-350g 阅读提示:Methods中Common bile duct ligation和BAL treatment in rats小节,Figure 2C治疗协议图 |
| UTOpiA系统构建 | 海藻酸胶囊含约300万iHLCs(6-10个胶囊),GMA柱含3 mg/g体重300 μm醋酸纤维素珠,GMA柱位于iHLC柱上游,蠕动泵流速1 ml/min,循环2小时 阅读提示:Methods中BAL system小节,Figure 2A系统示意图,Figure S2B和S2C连接顺序优化 |
| iHLCs分化与表征 | HLA-A/B/CIITA三敲除iPSC系,分化方案各阶段因子浓度和时间,iHLCs功能检测(白蛋白分泌1.03-1.28 ng/day/iHLC,尿素产生,葡萄糖分泌,胆红素摄取) 阅读提示:Methods中Generation of iHLCs小节,Figure 1各分图 |
| AFP敲除实验 | CRISPR-Cas9编辑AFP基因,AFP-KO iHLCs表征(形态、标志物、白蛋白分泌),ACLF大鼠中AFP WT vs KO iHLCs比较(TUNEL、p21、Ki67) 阅读提示:Results中AFP knockout of iHLCs小节,Figure 6,Figure S7 |
| 生存分析 | 各组样本量(无治疗n=6,空柱n=8,GMA n=9,iHLC n=4,HepG2 n=5,UTOpiA n=9),观察期3天,统计方法log-rank Mantel-Cox检验加Bonferroni校正 阅读提示:Figure 2D生存曲线图注,Methods中Statistical analysis小节 |