TDP-43:[GU]-转录组的守护者

TDP-43: [GU]-ardian of the transcriptome

作者信息Irika R Sinha, Abigail L Atkinson, Katherine E Irwin, Jonathan P Ling, Philip C Wong
PMID42135847
发布时间2026-05-14
DOI10.1186/s13024-026-00944-2

实验完整度

低

文献为综述,无原始实验;Methods仅描述文献检索与数据集筛选,未开展湿实验验证。

摘要

TDP-43是一种普遍表达、主要位于核内的DNA/RNA结合蛋白,与包括肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)和阿尔茨海默病(AD)在内的神经退行性疾病相关。在这篇综述中,我们考察了TDP-43的结构和调控,这些特征如何影响其定位和功能活性,以及它们的破坏如何可能导致疾病。在TDP-43的多种功能中,对称为隐蔽外显子的非保守RNA序列的剪接抑制已成为人类疾病尤为核心的方面。TDP-43核耗竭和细胞质聚集是神经退行性疾病受累神经元和胶质细胞中已确立的病理特征,并且不断积累的证据表明,TDP-43介导的剪接抑制丧失在疾病症状出现前即已发生。RNA测序的进步使得系统鉴定隐蔽外显子包含成为TDP-43功能障碍的敏感标志物。在此,我们综合了当前对TDP-43生物学的认识,并整理了来自人类组织和实验模型的数据集,重点关注隐蔽剪接,为利用隐蔽外显子生物学更好地理解、检测和靶向TDP-43功能障碍提供资源。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
TDP-43的结构和调控如何影响其定位与功能活性,其功能障碍如何导致疾病?
核心机制
TDP-43结合pre-mRNA中的[UG]n重复序列,通过空间位阻等机制抑制隐蔽外显子被剪接体识别;其核耗竭或功能丧失导致隐蔽外显子包含,进而通过无义介导的衰变或产生截短蛋白引起转录组和蛋白质组紊乱。
主要证据
综述综合了结构生物学(X射线晶体学、冷冻电镜)、RNA测序、CLIP分析以及来自人类组织、细胞系和动物模型的数据,表明隐蔽外显子在患者组织、脑脊液和血浆中可检测到。
研究意义
为利用隐蔽外显子生物学更好地理解、检测和靶向TDP-43功能障碍提供资源,并支持反义寡核苷酸、U7 snRNA和转基因系统等治疗策略的开发。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。