BTK 降解剂浓度-反应与动力学表征
确定 NX-2127 和 NX-5948 在人血小板中降解 BTK 的效力、钩状效应和动力学差异。
在洗涤血小板、PRP 和全血中孵育 NX-2127 或 NX-5948,通过 Western blot 检测 BTK 水平并计算 DC50。
Selective degradation of platelet BTK by PROTAC NX-5948 provides antithrombotic benefits without affecting hemostasis
含人洗涤血小板、PRP、全血、小鼠模型及患者样本多层级验证,并有蛋白质组学与功能机制验证
健康志愿者人洗涤血小板、PRP 与全血 C57BL/6 小鼠(9-10 周龄) 小鼠血小板、B 细胞与巨核细胞 小鼠 FeCl3 诱导颈动脉血栓形成模型
NX-5948 在洗涤血小板中 DC50 为 5.3nM,在 PRP 中为 12.8nM,处理 4 小时 30°C NX-2127 在洗涤血小板中 DC50 为 12nM,在 PRP 中为 98nM,处理 4 小时 30°C NX-5948 小鼠口服 30 mg/kg,24 小时后血小板 Btk 降低约 97% 流式细胞术刺激剂:CRP 5 μg/mL、TRAP-6 10μM、凝血酶 1 U/mL,刺激 10 分钟 尾出血实验以 37°C 温盐水浸泡法记录至首次止血停止最长 10 分钟
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定 NX-2127 和 NX-5948 在人血小板中降解 BTK 的效力、钩状效应和动力学差异。
在洗涤血小板、PRP 和全血中孵育 NX-2127 或 NX-5948,通过 Western blot 检测 BTK 水平并计算 DC50。
验证 NX-2127 和 NX-5948 降解 BTK 的选择性,并确认降解依赖 cereblon 和泛素-蛋白酶体途径。
TMTpro 定量蛋白质组学分析 PRP 处理样本;Western blot 检测 TEC 和 AAK1;使用 pomalidomide 或 MLN4924 预处理后检测 BTK 降解。
确定 BTK 降解是否选择性损害 GPVI 依赖而保留 PAR-1 依赖的血小板信号与功能。
Fura-2 负载血小板检测 Ca2+ 动员;流式细胞术检测整合素 αIIbβ3 活化和 P-选择素表达;96 孔板聚集实验检测聚集。
评估 BTK 降解对血小板在胶原或纤维蛋白原表面铺展及流动条件下血栓形成的影响。
铺展实验将洗涤血小板置于胶原或纤维蛋白原包被盖玻片;体外血栓实验将 DiOC6 标记 PRP 与红细胞重组后灌流通过胶原包被生物芯片并共聚焦成像。
验证口服 NX-5948 在小鼠体内降解血小板 BTK 并评估离体血小板功能、动脉血栓形成和出血时间。
小鼠单次口服 NX-5948 后分离血小板、B 细胞和巨核细胞检测 Btk;离体流式检测 CRP 和凝血酶刺激的血小板活化;FeCl3 诱导颈动脉血栓形成并用活体显微成像;尾出血实验记录出血时间。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| PROTAC 孵育 | NX-2127 | MedChemExpress | HY-153220 |
| NX-5948 | Tocris Bioscience | 8856 | |
| 血小板分离 | 前列腺素 E1 | -- | -- |
| apyrase | -- | -- | |
| Western blot | NuPAGE 样本缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 抗 talin 抗体(TA205) | Thermo Fisher Scientific Invitrogen | MA528133 | |
| 抗 3-磷酸甘油醛脱氢酶抗体(6C5) | Santa Cruz | SC-32233 | |
| 抗 BTK 抗体(D3H5) | Cell Signaling Technology | 8547 | |
| 抗 TEC 抗体(A12533) | Antibodies.com | A12533 | |
| 体外血栓形成实验 | DiOC6 | -- | -- |
| Vena8 GCS 生物芯片 | Cellix | -- | |
| 血小板铺展实验 | ActinGreen 488 ReadyProbes | Invitrogen | -- |
| ProLong Diamond 抗淬灭封片剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| EVOS-FL 显微镜 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 小鼠 B 细胞分离 | MojoSort 小鼠 B 细胞分离试剂盒 | BioLegend | -- |
| 70 μm 细胞筛网 | Falcon, Corning Inc | -- | |
| 体内血栓与尾出血 | DyLight-488-抗 GPIbβ | Emfret | ×488 |
| 流式细胞术 | PAC1-异硫氰酸荧光素 | BD Biosciences | -- |
| 抗 CD62P-PE | BD Biosciences | -- | |
| Jon/A-PE | Emfret | -- | |
| WugE9-异硫氰酸荧光素 | Emfret | -- | |
| 交联胶原相关肽(CRP) | Triple Helical Peptides | -- | |
| 凝血酶受体激活肽 6(TRAP-6) | Bachem | -- | |
| ADP | Cambridge Bioscience | -- | |
| PAR4 激活肽 | Sigma-Aldrich | -- | |
| BD Accuri C6 Plus 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 钙动员实验 | Fura-2 AM | Thermo Fisher Scientific | -- |
| A23187 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 96 孔透明底黑色微孔板 | Corning, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Tecan Infinite 200 PRO 多功能酶标仪 | Tecan | -- | |
| 蛋白质组学分析 | PhosSTOP | Roche | -- |
| cOmplete Mini 无 EDTA 抑制剂 | Roche | -- | |
| SepPak 柱 | Waters | -- | |
| Orbitrap Fusion Lumos 质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 96 孔板聚集实验 | Labtech LT-4500 酶标仪 | Labtech | -- |
| 全血细胞计数 | Siemens ADVIA 2120 血液分析仪 | Siemens | -- |
| 血小板分离 | Coulter 计数器 | Beckman Coulter | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PROTAC 处理与 BTK 降解检测 | NX-2127 与 NX-5948 浓度、处理时间 4 小时、处理温度 30°C;血液抗凝剂为 4% 柠檬酸三钠;洗涤血小板终浓度 4 × 10⁸/mL 阅读提示:Methods 中“Human platelet isolation”与“Incubation with PROTACs”及 Figure 1 legend |
| 人血小板功能检测 | 处理浓度 NX-2127 3.0μM、NX-5948 100nM;CRP 5 μg/mL、TRAP-6 10μM、凝血酶 1 U/mL 刺激 10 分钟;流式采集 10 000 事件;样本来自健康、无用药志愿者 阅读提示:Methods 中“Flow cytometry”与 Figure 4 legend |
| 小鼠给药与采样 | NX-5948 30 mg/kg 口服灌胃,5 mL/kg;24 小时后采血;C57BL/6 小鼠 9-10 周龄;样本量 n = 3-5 每组(依据既往血栓研究 80% 效力检测 ≥30% 差异) 阅读提示:Methods 中“Mice”与 Figure 6 legend |
| 体内动脉血栓形成与尾出血 | 12% FeCl3 作用 3 分钟;荧光成像 20 分钟;DyLight-488-anti-GPIbβ 100 μg/kg 静脉注射;尾出血以 37°C 温盐水浸泡,记录至首次停止出血并监测再出血,最长 10 分钟 阅读提示:Methods 中“In vivo arterial thrombosis and tail-bleeding assays”与 Figure 7 legend |
| 蛋白质组学分析 | TMTpro 标记、高 pH 反相色谱分 20 个组分、Orbitrap Fusion Lumos SPS-MS3 模式、Sequest 搜索 UniProt 人数据库、5% FDR;n = 3 生物学重复 阅读提示:Methods 中“Proteomic analysis of platelet samples”与 Figure 2 legend |