随机II期临床试验设计与患者入组
评估NIS793联合或不联合spartalizumab加ABRA/GEM对比ABRA/GEM单药在初治mPDAC患者中的安全性和疗效。
多中心、随机、开放标签II期研究,包括安全性导入期和随机治疗部分。153例患者随机均分至三组。
Biomarker Analysis from Patients with Metastatic PDAC Treated with TGFβ Antibody NIS793 plus Abraxane + Gemcitabine versus Abraxane + Gemcitabine Alone in a Phase II, Open-Label, Randomized Study
包含随机II期临床试验(153例患者)及配对肿瘤RNA-seq、cfDNA、血浆蛋白质组学和临床前毒理及晶体结构等多层级验证。
转移性胰腺导管腺癌(mPDAC)患者 患者配对肿瘤活检样本 患者血浆样本 临床前毒理学大鼠和食蟹猴模型
随机分组:153例患者随机均分至arm 1(NIS793+spartalizumab+ABRA/GEM)、arm 2(NIS793+ABRA/GEM)和arm 3(ABRA/GEM) 主要终点:无进展生存期(PFS);次要终点:总生存期(OS)、安全性、药代动力学和生物标志物 NIS793给药方案:2,100 mg每2周;spartalizumab:400 mg每4周;ABRA/GEM:吉西他滨1,000 mg/m2和nab-紫杉醇125 mg/m2,第1、8、15天,28天周期 配对肿瘤活检:筛选期和C3D2-4进行RNA-seq;n=8(ABRA/GEM)和n=13(NIS793+ABRA/GEM) 血浆蛋白质组学:SomaScan Assay version 5对57例受试者纵向血浆样本进行分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估NIS793联合或不联合spartalizumab加ABRA/GEM对比ABRA/GEM单药在初治mPDAC患者中的安全性和疗效。
多中心、随机、开放标签II期研究,包括安全性导入期和随机治疗部分。153例患者随机均分至三组。
评估NIS793的药代动力学特征和免疫原性。
采集患者样本进行PK分析和抗药抗体检测。
评估NIS793的靶点结合、药效学和机制验证。
对筛选期和C3D2-4的配对肿瘤活检进行RNA-seq,分析TGFβ信号、EMT、PDAC亚型、CAF标志物和免疫相关基因表达。
量化ctDNA水平和进行基线基因组分析。
从约5 mL血浆中提取cfDNA,构建测序文库,靶向579个癌症相关基因,进行变异调用和肿瘤突变负荷分析。
评估NIS793对血浆蛋白丰度的影响,验证药效学和机制。
使用SomaScan Assay version 5对纵向血浆样本进行蛋白质组学分析,量化10,070种蛋白质。
评估NIS793的非临床安全性。
在大鼠和食蟹猴中进行重复给药毒理学研究,以及组织交叉反应性研究。
确定NIS793与TGFβ1的结合表位,评估是否干扰TGFβ二聚化。
TGFβ1与NIS793 Fab复合物结晶,X射线衍射数据收集和结构解析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| cfDNA提取 | QIAamp循环核酸试剂盒 | QIAGEN | -- |
| cfDNA测序文库构建 | TruSeq Nano文库制备试剂盒 | Illumina | -- |
| cfDNA靶向捕获 | SureSelect RNA捕获探针 | Agilent | -- |
| RNA-seq文库构建 | TruSeq RNA v2文库制备试剂盒 | Illumina | -- |
| RNA质控 | Agilent TapeStation | Agilent | RRID:SCR_019547 |
| 血浆蛋白质组学 | SomaScan检测版本5 | SomaLogic, Inc. | -- |
| 晶体学 | Mosquito液体处理仪 | SPT Labtech | -- |
| Rock Imager培养箱 | Formulatrix | -- | |
| 药物制剂 | NIS793 | Novartis | -- |
| Spartalizumab (PDR001) | Novartis | -- | |
| 化疗 | 吉西他滨 | -- | -- |
| nab-紫杉醇(Abraxane) | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 随机分组和治疗方案 | 分组:arm 1(NIS793+spartalizumab+ABRA/GEM,n=50)、arm 2(NIS793+ABRA/GEM,n=51)、arm 3(ABRA/GEM,n=52);NIS793 2,100 mg每2周;spartalizumab 400 mg每4周;吉西他滨1,000 mg/m2和nab-紫杉醇125 mg/m2第1、8、15天;28天周期 阅读提示:Patients and Methods中的Study design和Study treatment部分 |
| 配对肿瘤活检RNA-seq | 活检时间点:筛选期和C3D2-4;配对样本量:n=8(ABRA/GEM)和n=13(NIS793+ABRA/GEM);测序深度:中位5000万reads/文库;参考基因组:hg19 阅读提示:Patients and Methods中的Bulk RNA-seq sample processing and data analysis部分 |
| cfDNA分析 | 血浆体积:约5 mL;测序深度:中位3亿reads/文库;参考基因组:hg38;靶向基因数:579 阅读提示:Patients and Methods中的Cell-free DNA extraction processing and data analysis部分 |
| 血浆蛋白质组学 | 样本量:57例受试者;平台:SomaScan Assay version 5;统计方法:配对t检验比较C1D1与后续时间点 阅读提示:Patients and Methods中的SomaScan analysis部分 |
| 临床前毒理学 | 大鼠13周研究:每周静脉给药1、3、10 mg/kg;食蟹猴4周研究:每周给药2、8、16 mg/kg;组织交叉反应性研究:42种组织 阅读提示:Patients and Methods中的Preclinical toxicology studies部分 |