病例筛选与形态学评估
识别具有至少局灶经典BA形态且满足预定义非典型特征的BA样病变。
回顾性检索2020-2025年病理档案,由两位胸部病理专家独立复阅H&E和免疫组化切片,纳入符合标准的19例。
Bronchiolar adenoma-like lesions with atypical features beyond the classic morphological spectrum: integrating histomorphology and molecular profiles
含19例患者样本、免疫组化、10例全外显子测序、2例靶向测序,并进行了通路层面分子验证。
19例细支气管腺瘤样病变患者FFPE组织样本 10例肿瘤-正常配对全外显子组测序 2例10基因靶向检测
基底细胞层状态:通过P40、TTF-1免疫组化评估,用于区分基底细胞增生、丢失或间质样生长 病理分型:根据腔面细胞表型分为近端型(黏液/纤毛细胞)和远端型(立方/棒状细胞) 分子改变:WES检测致病性体细胞突变,10基因panel检测EGFR、KRAS、NRAS、BRAF、ERBB2、PIK3CA、ALK、ROS1、RET、MET 随访结局:所有手术切除病例中位随访29.6个月,评估无病生存状态 TP53突变与显著上皮非典型性的关联
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
识别具有至少局灶经典BA形态且满足预定义非典型特征的BA样病变。
回顾性检索2020-2025年病理档案,由两位胸部病理专家独立复阅H&E和免疫组化切片,纳入符合标准的19例。
描述BA样病变的临床特征、影像学表现、治疗和随访结局。
收集年龄、性别、吸烟史、CT图像、位置、大小、同步病变、冰冻诊断、最终诊断、治疗和随访数据。
评估基底细胞和腔面细胞标志物表达,确定免疫表型。
在FFPE标本上使用Dako Omnis自动平台进行TTF-1、Napsin A和P40免疫组化染色。
揭示BA样病变的体细胞突变谱和潜在驱动事件。
对2例进行10基因panel检测和Sanger测序,对10例进行WES(肿瘤-正常配对),分析SNV/indel、CNV/SV和TMB。
探讨不同形态学变异型与分子通路的关联。
比较基底增生型和基底缺陷型病变中MAPK和PI3K/AKT/mTOR通路改变频率,分析TP53突变与细胞学非典型性的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组化 | Dako Omnis自动染色平台 | Agilent Technologies | -- |
| TTF-1抗体(克隆SPT24) | Beijing Zhongshan Golden Bridge Biotechnology Co. | -- | |
| Napsin A抗体(克隆IP64) | Beijing Zhongshan Golden Bridge Biotechnology Co. | -- | |
| P40抗体(克隆MXR010) | Fuzhou Maixin Biotech Co. | -- | |
| 分子分析 | AmoyDx DNA/RNA提取试剂盒 | AmoyDx | -- |
| 全外显子组测序 | Qubit 4.0荧光定量仪 | Agilent Technologies | -- |
| Agilent 4200 TapeStation系统 | Agilent Technologies | -- | |
| SureSelectXT文库构建试剂盒 | Agilent | G9611A | |
| Covaris S220聚焦超声破碎仪 | Covaris | -- | |
| AMPure XP核酸纯化磁珠 | Beckman Coulter | -- | |
| Herculase II Fusion DNA聚合酶 | Agilent Technologies | -- | |
| SureSelectXT人全外显子V6捕获试剂盒 | Agilent Technologies | -- | |
| Dynabeads MyOne链霉亲和素T1磁珠 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Illumina NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 病例筛选 | 纳入标准:至少局灶BA样形态加一个预定义非典型特征;由两位胸部病理专家独立复阅 阅读提示:Materials and methods中Case selection小节及Figure S1 |
| 免疫组化 | 抗体克隆号、稀释比例、染色平台:TTF-1(SPT24,1:400)、Napsin A(IP64,1:200)、P40(MXR010,1:200);Dako Omnis平台 阅读提示:Materials and methods中Immunohistochemistry小节 |
| 分子分析 | 10基因panel基因列表、WES建库和测序参数、体细胞变异过滤标准(肿瘤VAF>5%,正常VAF<1%) 阅读提示:Materials and methods中Molecular analysis小节 |
| 随访 | 中位随访时间为29.6个月,范围5-64个月;所有病例无病生存 阅读提示:Results中Clinical characteristics小节 |