研究队列构建
识别丹麦中部地区所有成人ALD肝硬化患者并排除近期已有严重全身性感染者,以计算首发感染发病率
从区域电子健康记录系统MidtEPJ中提取2013年1月1日至2023年9月1日期间诊断为ALD肝硬化(ICD‐10代码K70.3和K70.4)的成人(≥18岁)患者,排除纳入日期前90天内发生严重全身性感染者13例,最终纳入2511例
Incidence and Mortality of Community-Acquired Sepsis or Bacteraemia in Patients With Alcohol-Related Cirrhosis
基于区域登记数据库的观察性队列研究,无体外或动物实验,未提供实验方法和功能验证过程。
丹麦中部地区2013—2022年诊断为ALD肝硬化的成人患者队列(N=2511) 发生社区获得性严重全身性感染的亚队列(N=156)
ALD肝硬化诊断依据ICD‐10代码K70.3和K70.4,纳入2013年1月1日至2023年9月1日期间诊断的成人(≥18岁)患者 社区获得性严重全身性感染定义:阳性血培养和/或脓毒症或菌血症出院诊断代码;社区获得性要求入院前6天内无住院,血培养在入院48小时内采集,或入院48小时内CRP>100 mg/L且TOKS评分≥5 排除标准:纳入日期前90天内发生过严重全身性感染者(排除13例) Fine & Gray回归模型:单变量模型纳入年龄、性别、MELD‐Na评分、胆红素、白蛋白、血小板、INR、钠、肌酐;多变量模型纳入年龄、性别和MELD‐Na评分;随访在诊断后1年结束 死亡竞争风险:死亡和医院获得性严重全身性感染作为竞争风险事件
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
识别丹麦中部地区所有成人ALD肝硬化患者并排除近期已有严重全身性感染者,以计算首发感染发病率
从区域电子健康记录系统MidtEPJ中提取2013年1月1日至2023年9月1日期间诊断为ALD肝硬化(ICD‐10代码K70.3和K70.4)的成人(≥18岁)患者,排除纳入日期前90天内发生严重全身性感染者13例,最终纳入2511例
识别首发社区获得性严重全身性感染并区分社区获得性与医院获得性
由临床微生物学家审查所有阳性血培养并排除明显皮肤污染;结合脓毒症和菌血症出院诊断代码定义严重全身性感染;社区获得性定义为入院前6天内无住院且血培养在入院48小时内采集,或入院48小时内CRP>100 mg/L且TOKS评分≥5;不符合者定义为医院获得性
计算社区获得性严重全身性感染的累积发病率和发病率,并描述血培养病原体分布
使用累积发病率函数计算30天、90天、1年和3年累积风险,死亡和医院获得性严重全身性感染作为竞争风险;计算每1000人年的发病率;统计血流感染病原体种类和频率
识别第一年内社区获得性严重全身性感染的预测因素
使用Fine & Gray回归进行单变量和多变量分析,单变量纳入年龄、性别、MELD‐Na评分、胆红素、白蛋白、血小板、INR、钠和肌酐,多变量纳入年龄、性别和MELD‐Na评分;随访在诊断后1年结束
评估社区获得性严重全身性感染后的全因死亡率,并比较脓毒症与菌血症
对156例发生社区获得性严重全身性感染的患者,从感染日期随访至死亡或2023年9月1日,使用Kaplan-Meier估计7天、30天和90天死亡率,并分别计算脓毒症和菌血症的90天死亡率进行log-rank检验比较
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 血培养处理 | Bact/ALERT系统 | BioMérieux, Marcy-l'Étoile, France | -- |
| 细菌鉴定 | MALDI-TOF质谱 | Bruker, Bremen, Germany | -- |
| 统计分析 | Stata 18.5版 | StataCorp | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 研究队列构建 | 纳入时间范围:2013年1月1日至2023年9月1日;诊断代码:ICD-10 K70.3和K70.4;年龄≥18岁;排除纳入前90天内严重全身性感染者;样本量N=2511;MELD-Na评分缺失率53% 阅读提示:Methods 2.2 Study Cohort 及 Table 1 |
| 严重全身性感染识别与分类 | 血培养采集时间窗:入院48小时内;社区获得性附加标准:CRP>100 mg/L且TOKS评分≥5(入院48小时内);入院前6天内无住院;排除明显皮肤污染标准;脓毒症和菌血症诊断代码见表S1 阅读提示:Methods 2.4 Serious Systemic Infections 及 Table S1 |
| 发病率与病原分布分析 | 随访时间:从纳入至首次社区获得性严重全身性感染、医院获得性严重全身性感染、死亡或2023年9月1日;总随访7024人年;竞争风险:死亡和医院获得性严重全身性感染;血培养阳性患者N=114,鉴定133种菌种 阅读提示:Methods 2.7.1 及 Results 3.1、Table 2 |
| 预测因素分析 | 随访时间:诊断后1年;单变量模型纳入年龄、性别、MELD-Na评分、胆红素、白蛋白、血小板、INR、钠和肌酐;多变量模型纳入年龄、性别和MELD-Na评分;完整病例分析;竞争风险:死亡和医院获得性严重全身性感染 阅读提示:Methods 2.7.2 及 Tables 3、4 |
| 感染后死亡率分析 | 样本量N=156;随访起点:社区获得性严重全身性感染日期;随访终点:死亡或2023年9月1日;死亡率时间点:7天、30天、90天;脓毒症与菌血症90天死亡率比较采用log-rank检验 阅读提示:Methods 2.7.4 及 Results 3.3、Figure 3、Figure S2 |