确定索拉非尼有效剂量与作用时间
确定后续实验中索拉非尼的最佳浓度和暴露时间。
用2.5、5、7.5、10 μm索拉非尼处理HepG2细胞24、48和72 h,MTT检测细胞活力,最终选择7.5 μm和48 h。
Comparison of the Effects of Sorafenib and Stem Cell Secretome on HepG2 Cancer Cells with Respect to the Ras/Raf/MEK/ERK Pathway
仅HepG2体外实验,含MTT、流式、RT-qPCR、Western blot及免疫荧光验证,无动物或患者样本。
HepG2肝癌细胞系 hADSC条件培养基处理的HepG2细胞 hAC条件培养基处理的HepG2细胞
索拉非尼剂量与暴露时间:7.5 μm,48 h CM处理方式:CM与标准培养基1:1稀释,作用48 h 实验分组:C、S、CM-hADSC、S/CM-hADSC、CM-hAC、S/CM-hAC HepG2接种密度:MTT为5000 cells/well,免疫荧光为50,000 cells/slide 主要检测终点:细胞活力、凋亡、细胞周期、CD133、AFP及Ras/Raf/MEK/ERK相关基因和蛋白
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定后续实验中索拉非尼的最佳浓度和暴露时间。
用2.5、5、7.5、10 μm索拉非尼处理HepG2细胞24、48和72 h,MTT检测细胞活力,最终选择7.5 μm和48 h。
确认干细胞表型和条件培养基来源细胞特征。
hADSCs和hACs在标准培养基中培养,分别维持至第3代和第7代;用倒置显微镜观察形态,用流式细胞术检测CD73、CD90、CD105及细胞角蛋白14、15、16、19。
获得hADSC和hAC分泌因子用于处理HepG2细胞。
细胞以5 × 103 cells/cm2接种,培养至约70%汇合后收集培养基,离心、过滤并与标准培养基1:1稀释。
比较索拉非尼和CM单独或联合对HepG2细胞活力、凋亡和细胞周期的影响。
HepG2细胞按C、S、CM-hADSC、S/CM-hADSC、CM-hAC、S/CM-hAC分组处理48 h,检测CD133、AFP、活力、凋亡和细胞周期。
分析索拉非尼和CM对HepG2细胞中通路相关分子表达的影响。
用RT-qPCR检测HRAS、KRAS、RAF1、MAP2K1、CCND1、CCNE1、BAX、TP53、CASP3、CASP7等基因;用Western blot检测Ras、Raf-1、p-Raf-1、MEK1/2、p-MEK1、ERK1/2、p-ERK1/2、cyclin D1、cyclin E、Bax、cleaved caspase-3、caspase-7、cleaved caspase-7、caspase-9等蛋白;用免疫荧光检测cyclin D和AFP。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 索拉非尼对甲苯磺酸盐 | LC Laboratories | -- |
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | EURx | -- | |
| 青霉素-链霉素-两性霉素B溶液 | Corning | -- | |
| 多气培养箱 | Sanyo | -- | |
| 流式分析 | PE偶联CD73抗体 | Beckman Coulter | -- |
| PE-Cy7偶联CD90抗体 | Beckman Coulter | -- | |
| APC偶联CD105抗体 | Beckman Coulter | -- | |
| 小鼠抗人IgG1抗体 | Beckman Coulter | -- | |
| 细胞角蛋白14、15、16和19的PE偶联抗体试剂盒 | BD Biosciences | -- | |
| CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| PE偶联小鼠抗人CD133抗体 | R&D Systems | FAB11331P | |
| 小鼠IgG2a同型对照 | R&D Systems | IC003P | |
| 免疫荧光 | 小鼠抗人Cyclin D抗体 | Proteintech | 60186-1-Ig |
| 小鼠抗人AFP抗体 | Abcam | ab3980 | |
| 小鼠IgG1同型对照 | Abcam | ab170190 | |
| 山羊抗小鼠二抗 | Abcam | ab175473 | |
| 山羊抗小鼠二抗 | Abcam | ab150133 | |
| 含DAPI的抗荧光淬灭封片剂 | Vector Laboratories | -- | |
| BX43荧光显微镜 | Olympus | -- | |
| XC30相机 | Olympus | -- | |
| RT-qPCR | RNA Extracol | EURx | -- |
| NanoDrop 2000仪器 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| GoTaq一步法RT-qPCR系统 | Promega | -- | |
| LightCycler 96仪器 | Roche | -- | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Merck Millipore | -- |
| cOmplete Mini蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 4× Laemmli上样缓冲液 | Bio-Rad | -- | |
| β-巯基乙醇 | Bio-Rad | -- | |
| PowerPac Basic电源 | Bio-Rad | -- | |
| 抗cyclin E抗体 | Santa Cruz | -- | |
| 抗cyclin D1抗体 | Abcam | -- | |
| 抗Ras抗体 | Abcam | -- | |
| 抗Raf-1抗体 | Abcam | -- | |
| 抗p-Raf-1抗体 | Abcam | -- | |
| 抗MEK1/2抗体 | Abcam | -- | |
| 抗p-MEK1抗体 | Abcam | -- | |
| 抗ERK1/2抗体 | Abcam | -- | |
| 抗p-ERK1/2抗体 | Abcam | -- | |
| 抗Bax抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗剪切型caspase-3抗体 | Cell Signaling | -- | |
| 抗caspase-7抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗剪切型caspase-7抗体 | Abcam | -- | |
| 抗caspase-9抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 抗Hsp90抗体 | Abcam | -- | |
| 山羊抗兔二抗 | Abcam | -- | |
| 山羊抗小鼠二抗 | Abcam | -- | |
| SuperSignal West Pico PLUS化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Invitrogen iBright CL750成像系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| MTT assay | 噻唑蓝四唑溴化物 | Sigma-Aldrich | M2128 |
| Victor Nivo酶标仪 | PerkinElmer | -- | |
| 流式凋亡分析 | PE Annexin V凋亡检测试剂盒 | BD | -- |
| 细胞周期流式分析 | FxCycle PI/RNase染色液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 索拉非尼剂量与作用时间 | 索拉非尼浓度范围2.5、5、7.5、10 μm;处理时间24、48、72 h;最终选用7.5 μm和48 h;MTT n=6 阅读提示:见2.2节、3.1节、Figure 2及其图注 |
| 干细胞培养与条件培养基收集 | hADSC来源Lonza cat. no. PCS-500-011;hAC来源ABM cat. no. T0531;标准培养基DMEM+10% FBS+1%青霉素-链霉素-两性霉素B;37 °C、5% CO2;70%汇合收集;CM离心10,000× g、10 min、4 °C;0.2 µm过滤;1:1稀释 阅读提示:见2.3节、2.3.2节及Supplementary Materials |
| HepG2细胞分组与处理 | 分组为C、S、CM-hADSC、S/CM-hADSC、CM-hAC、S/CM-hAC;索拉非尼7.5 μm;CM 1:1稀释;处理48 h;HepG2来源ATCC cat. no. HB-8065 阅读提示:见2.1节、2.4节和Figure 1 |
| 细胞活力、凋亡与细胞周期检测 | MTT每孔5000 cells,n=10;annexin V/PI流式n=3;细胞周期FxCycle PI/RNase流式n=3;阴性对照1% TritonX-100 阅读提示:见2.5节、Figure 4、Figure 5及图注 |
| 基因与蛋白表达检测 | RT-qPCR内参BACT,凋亡和通路基因n=9;Western blot每样本15 µg,内参GAPDH或Hsp90,定量n=3;免疫荧光HepG2 50,000 cells/slide;抗体信息见Table S1 阅读提示:见2.4.3节、2.4.4节、Table 1、Table 2、Figure 6、Figure 7及Supplementary Materials |