临床样本中单核细胞mDll4和血浆exDll4的检测
验证PLWH中单核细胞Dll4表达和血浆exDll4水平是否升高,并分析其与单核细胞亚群的关联。
使用流式细胞术检测PBMC中单核细胞mDll4表达和单核细胞亚群分布;使用ELISA检测血浆exDll4水平;分析exDll4与单核细胞亚群的关联。
Monocyte Dll4 Contributes to Systemic Inflammation in People Living With HIV
包含临床样本、体外原代细胞、细胞系及功能验证
人原代单核细胞 THP-1细胞 HIV感染者队列 HUVEC
单核细胞mDll4通过流式细胞术检测,至少获取20,000个单核细胞门内事件 血浆exDll4通过ELISA检测,使用100μl未稀释血浆,每个样本重复检测并取平均值 原代单核细胞用LPS或TNF-α刺激24小时,Western blot检测Dll4和N1-ICD蛋白 THP-1细胞转染30μM对照或Dll4 siRNA,在LPS或TNF-α刺激下进行RNA测序,每组n=5 单核细胞粘附和跨内皮迁移实验,THP-1细胞用Calcein AM标记,HUVEC单层上粘附40分钟或迁移4小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证PLWH中单核细胞Dll4表达和血浆exDll4水平是否升高,并分析其与单核细胞亚群的关联。
使用流式细胞术检测PBMC中单核细胞mDll4表达和单核细胞亚群分布;使用ELISA检测血浆exDll4水平;分析exDll4与单核细胞亚群的关联。
确定LPS和TNF-α是否能诱导单核细胞Dll4表达和exDll4分泌。
用LPS或TNF-α刺激THP-1细胞和原代单核细胞,检测Dll4 mRNA和蛋白表达,以及培养上清中exDll4水平。
确定Dll4-Notch信号下游调控的基因和通路。
THP-1细胞转染Dll4 siRNA或对照siRNA,在LPS或TNF-α刺激下进行RNA测序,进行差异表达和富集分析。
验证Hes1是否与STAT1/2或STAT2/3形成异源三聚体,抑制干扰素信号。
使用AlphaFold 3预测Hes1-STAT复合物结构,并通过Co-IP在THP-1细胞中验证Hes1与STAT2的相互作用。
评估Dll4-Notch1信号对单核细胞粘附和跨内皮迁移的影响。
THP-1细胞转染Dll4 siRNA或对照siRNA,在LPS或TNF-α存在下,进行粘附实验和跨内皮迁移实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 血浆exDll4检测 | Quantikine ELISA试剂盒 | Aviva Systems Biology | OKEH02321 |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 非必需氨基酸 | -- | -- | |
| 单核细胞刺激 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L3012 |
| 重组人TNF-α | PeproTech | 300-01A | |
| 单核细胞分离 | EasySep™ 人单核细胞富集试剂盒(不去除CD16) | STEMCELL Technologies | 19058 |
| PBMC分离 | Ficoll-Paque® Plus | Cytiva | -- |
| 细胞冻存 | CryoStor® CS10 | StemCell Technologies | 100-1061 |
| 流式细胞术 | 抗人CD32 | Biolegend | 303202 |
| 抗人CD64 | Biolegend | 305002 | |
| 抗CD16-FITC | BioLegend | -- | |
| 抗Dll4-PE | BioLegend | -- | |
| 转染 | Lipofectamine™ RNAiMAX | Invitrogen | 13778 |
| RNA提取 | RNeasy Mini Kit | Qiagen | -- |
| RNA测序 | TruSeq Stranded mRNA LT样本制备试剂盒 | Illumina | -- |
| 粘附实验 | 钙黄绿素AM | Cayman Chemical Company | 14948 |
| 跨内皮迁移实验 | Transwell® 5.0 μm孔径聚碳酸酯膜插入物 | Corning | 3421 |
| 重组人趋化因子MCP-1 | Thermo Fisher Scientific | 300-04-5UG |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本采集与处理 | 样本来源:HIV感染者105例(25女80男),未感染对照105例(31女74男);样本类型:血浆和PBMC;储存条件:血浆-80°C,PBMC液氮不超过两年 阅读提示:Methods中Human subjects部分 |
| 流式细胞术检测mDll4 | 抗体稀释比例:anti-CD14-APC 1:100,anti-CD16-FITC 1:100,anti-Dll4-PE 1:20;获取事件数:至少20,000个单核细胞门内事件;数据分析软件:FlowJo 阅读提示:Methods中Flow cytometry部分和图1A |
| ELISA检测exDll4 | 血浆用量:100μl未稀释;重复:每个样本重复检测并取平均值;试剂盒:Quantikine ELISA kit (OKEH02321, Aviva Systems Biology) 阅读提示:Methods中ELISA部分 |
| 原代单核细胞刺激 | 细胞数:1×10^6细胞/2ml;刺激物浓度:LPS 200ng/mL,TNF-α 20ng/mL;刺激时间:12和24小时;培养板:12孔板 阅读提示:Methods中Cell culture部分 |
| RNA测序和Dll4沉默 | siRNA浓度:30μM;转染试剂:Lipofectamine RNAiMAX;刺激条件:LPS或TNF-α;每组样本量:n=5;测序平台:Illumina NextSeq 550 阅读提示:Methods中THP-1 Cell RNA Isolation, Bulk RNA Sequencing, and Bioinformatics部分 |