患者DSP突变iPSC及心脏成纤维细胞样MSC建立与鉴定
建立可重复的DSP突变心脏成纤维细胞样MSC模型并确认其MSC/心脏成纤维细胞特征。
从2例DSP突变ACM患者PBMC重编程iPSC,经早期中胚层中间阶段衍生MSC,并用流式、核型、基因组测序和RNA-seq与同一供体心脏成纤维细胞比较。
Desmoplakin Mutations in Cardiac Fibroblasts Cause TGFβ1-Mediated Pathological Fibrogenesis in Desmoplakin Cardiomyopathy Via Beclin-1 Regulation
含患者iPSC-MSC体外模型、DSP敲低小鼠体内模型及全基因组分析,并完成BECN1/CAV1/p38机制与功能验证
正常供体iPSC来源心脏成纤维细胞样MSC DSP突变患者iPSC来源心脏MSC POSTNMRM-Cre+;DSPw/f小鼠心脏肌成纤维细胞DSP杂合缺失模型 人DSP突变心脏组织与小鼠心脏组织
DSP突变iPSC-MSC中WT DSP mRNA和蛋白水平约为正常MSC的50%,且未检测到截短突变蛋白 TGFβ1处理浓度1 ng/mL,处理时间包括24、48、72小时;Sircol胶原检测为72小时 TGFβ1后24小时检测BECN1-VIM、BECN1-ATG14、BECN1-UVRAG共免疫沉淀关联变化 小鼠3周龄起腹腔注射tamoxifen 5天,6周龄起每日腹腔注射1 µg TGFβ1持续7至8天 自噬通量用Premo Autophagy Tandem Sensor RFP-GFP-LC3B检测自噬体和自噬溶酶体
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立可重复的DSP突变心脏成纤维细胞样MSC模型并确认其MSC/心脏成纤维细胞特征。
从2例DSP突变ACM患者PBMC重编程iPSC,经早期中胚层中间阶段衍生MSC,并用流式、核型、基因组测序和RNA-seq与同一供体心脏成纤维细胞比较。
验证DSP突变MSC是否对TGFβ1表现过度纤维化反应。
用1 ng/mL TGFβ1处理正常和DSP突变MSC,检测培养上清胶原、细胞内纤维状胶原、COL1/COL3、VIM和纤维化基因表达。
确定DSP突变MSC中最早受损的自噬步骤。
使用RFP-GFP-LC3B自噬通量传感器、LC3B-I/II Western blot和BECN1 Western blot在基线和TGFβ1后检测自噬体、自噬溶酶体和BECN1水平。
验证DSP是否通过竞争VIM结合调节BECN1可用性及下游自噬和纤维化。
在正常和DSP突变MSC中通过co-IP检测DSP-VIM、BECN1-VIM、BECN1-ATG14、BECN1-UVRAG;通过siDSP和siVIM敲低及BECN1过表达验证功能。
验证DSP缺陷导致异常长CAV1斑块并过度激活p38和纤维化基因。
在DSP突变MSC、DSP敲低MSC和DSP突变人心脏组织中免疫染色CAV1,检测p-p38/p38、SMAD2/3和ERK1/2,并用CAV1敲低、BECN1过表达、Dynasore、SB525334和SB202190处理验证。
在体内验证活化成纤维细胞DSP缺陷增强TGFβ1诱导的心脏纤维化。
将POSTNMRM-Cre+小鼠与DSPw/f小鼠杂交,tamoxifen诱导成纤维细胞DSP杂合缺失,再腹腔注射TGFβ1并检测心脏纤维化、自噬、p-p38和纤维化基因。
从全基因组层面确认DSP缺陷相关差异表达基因和通路。
使用Illumina mRNA表达微阵列分析DSP R160X先证者、其无症状母亲、DSP E1159R先证者和正常SW的iPSC-MSC,并与PKP2 delC MSC比较。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| iPSC重编程与培养 | TeSR-E8培养基试剂盒 | STEMCELL Technology Inc | -- |
| 细胞培养 | Matrigel包被培养板 | -- | -- |
| Normocin | Invitrogen | -- | |
| 庆大霉素 | GIBCO | -- | |
| RNA提取与qPCR | mirVana miRNA分离试剂盒 | Invitrogen | -- |
| Quantitect逆转录试剂盒 | Qiagen | -- | |
| SYBR Green I | Roche | -- | |
| Roche LightCycler 96 | Roche | -- | |
| 基因组DNA提取与PCR | QIAamp DNA Mini试剂盒 | Qiagen | 51304 |
| DreamTag Green PCR预混液 | Thermo Scientific | K1081 | |
| Western blot | DSP抗体 | Abcam | ab71690 |
| 胶原检测 | Sircol检测试剂盒 | Biocolor | S1000 |
| 免疫荧光成像 | Alexa Fluor 488抗小鼠或抗兔IgG | Invitrogen | -- |
| Alexa Fluor 594抗小鼠或抗兔IgG | Invitrogen | -- | |
| 自噬成像 | Premo自噬串联传感器RFP-GFP-LC3B试剂盒 | Life Technologies | -- |
| 质粒构建与过表达 | DSP isoform-I-GFP载体 | Addgene | 32227 |
| pcDNA4-beclin-1 | Addgene | 24388 | |
| pCDH-CMV-MCS-EF1-GFP慢病毒载体 | System Biosciences Inc | -- | |
| siRNA敲低 | VIM ON-TARGET siRNA-SMART pool | Horizon Discovery | L-003551-00-0005 |
| CAV1 ON-TARGET siRNA-SMART pool | Horizon Discovery | L-003467-00-0005 | |
| AllStars阴性对照siRNA | Qiagen | -- | |
| 质粒转染 | Lipofectamine 2000 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 电穿孔 | Neon转染系统100 µL试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 小鼠模型 | DSP-floxed小鼠 | The Jackson Lab | Jax #026665 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| DSP突变MSC模型与DSP表达鉴定 | 患者DSP突变类型、iPSC克隆选择、iPSC-MSC代数、WT DSP mRNA/蛋白检测方法;DSP突变MSC中未检测到截短突变蛋白 阅读提示:Methods中Heart Tissues and Generation of Human iPSCs、Generation of Human Normal and DSP-Mutant iPSC-MSCs、Results第一段及Figure 1、Figure S1、Figure S2 |
| TGFβ1诱导纤维化反应 | TGFβ1浓度1 ng/mL、处理72小时用于胶原和纤维化基因、Sircol上清胶原检测、细胞内纤维状胶原免疫染色、COL1/COL3/VIM Western检测 阅读提示:Methods中Sircol Collagen Assay,Results中Increased Collagen and VIM Levels in DSP-Mutant MSCs by TGFβ1及Figure 2 |
| 自噬通量与自噬步骤检测 | RFP-GFP-LC3B自噬传感器、细胞数2×105/孔、TGFβ1处理24至72小时、LC3B-II/I及总BECN1 Western、自噬体/自噬溶酶体计数 阅读提示:Methods中Imaging Autophagy With Premo Autophagy Tandem Sensor RFP-GFP-LC3B,Results中Defective Autophagy Pathway in DSP-Mutant MSCs及Figure 3 |
| DSP-VIM-BECN1相互作用与功能救援 | Co-IP检测时间基线/24小时/72小时、VIM与DSP共定位面积、BECN1-VIM/BECN1-ATG14/BECN1-UVRAG关联、siDSP或siVIM浓度50 nmol/L、BECN1过表达电转参数 阅读提示:Methods中Plasmids and siRNAs、Transfection of Plasmids、RNA Interference/Transfection of Synthetic siRNAs、Electroporation of MSCs,Results中Figure 4至Figure 7 |
| 小鼠体内DSP杂合缺失与TGFβ1处理 | POSTNMRM-Cre+;DSPw/f基因型、3周龄起tamoxifen腹腔注射5天、6周龄起每日1 µg TGFβ1腹腔注射7至8天、第7周取材、Sirius red-fast green及自噬/纤维化指标 阅读提示:Methods中Generation and Study of Mice With Heterozygous DSP Deletion in Myofibroblasts,Results中Heterozygous DSP Deletion in Mouse Myofibroblasts In Vivo及Figure 8 |
| 全基因组表达分析 | 分析样本包括DSP R160X先证者、其无症状母亲、DSP E1159R先证者和正常SW iPSC-MSC、1.3倍差异阈值、1186个共同差异基因、DAVID 6.7 KEGG通路分析 阅读提示:Methods中Illumina Microarray Data and RNA Sequencing,Results中DSP Mutations and Fibrogenic Pathways by Gene Expression Analysis及Figure S6E、S6F |