NCM-K4DT永生化细胞系建立
建立稳定永生化人脉络膜黑色素细胞系
从4名供体分离原代NCMs,采用两步顺序慢病毒转导:先转导CDK4/Cyclin D1,Zeocin筛选;再转导hTERT,hygromycin筛选。通过PCR和Western blot验证转基因整合和表达。
Establishment of Stable Immortalized Human Choroidal Melanocytes for Ocular Research
含体外原代细胞、永生化细胞系、免疫缺陷小鼠体内成瘤实验及CRISPR编辑功能验证
来自4名供体的原代人脉络膜黑色素细胞(NCMs) 永生化NCM-K4DT细胞系 免疫缺陷小鼠皮下移植模型 UM细胞系(92.1、Mel202、Mel270、Mel285、MP41、MP46、OMM2.3、UPMD1)
NCMs供体4名:年龄/性别分别为51/X、66/Y、48/Y、48/X;尸检延迟天数(PPDI)分别为1、2、4、3;永生化代次分别为P11、P7、P9、P11 慢病毒转导:CDK4/Cyclin D1 MOI=5,hTERT MOI=5;转导时使用5 µg/mL polybrene;CDK4/Cyclin D1后使用500 µg/mL Zeocin筛选12天,hTERT后使用150 µg/mL hygromycin筛选10天 体内成瘤实验:免疫缺陷小鼠(NOD-Prkdcem26Cd52Il2rgem26Cd22/NjuCrl,Charles River Laboratories,#572)皮下注射1×10^6个92.1-Luc2-tdTomato或NCM-K4DT-Luc2-tdTomato细胞,细胞悬于PBS与Matrigel 1:1混合物;每组n=3;观察12周 CRISPR编辑:NCM-K4DT细胞以1.7×10^4 cells/cm^2接种于100 mm皿,转染前培养2天;每条件500 ng SCIP质粒,设3个重复;转染后24小时进行Ghost Dye Red 780染色和FACSMelody分选EGFP阳性细胞 统计学:原代NCMs和K4DT系使用4个独立生物学重复,每个实验3个技术重复(除非另有说明);两组比较使用非配对双尾Student t检验,多组比较使用单因素或双因素ANOVA及事后检验;P<0.05为显著
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立稳定永生化人脉络膜黑色素细胞系
从4名供体分离原代NCMs,采用两步顺序慢病毒转导:先转导CDK4/Cyclin D1,Zeocin筛选;再转导hTERT,hygromycin筛选。通过PCR和Western blot验证转基因整合和表达。
验证永生化后是否保留黑色素细胞形态、标志物表达和功能
通过Western blot、免疫荧光和功能实验检测黑色素细胞标志物(PMEL、TYRP1、Melan-A、SOX10)、黑色素含量和酪氨酸酶活性,并评估形态。
评估永生化细胞的增殖能力和细胞周期调控是否正常
通过群体倍增实验、细胞周期流式分析、Ki67免疫荧光和p21 Western blot检测增殖和细胞周期调控。
确保永生化细胞系维持非癌性基因组特征
通过靶向基因分型筛选UM相关热点突变,通过全基因组测序核型和CNV分析评估染色体稳定性。
确定K4DT永生化是否赋予致瘤潜力
在免疫缺陷小鼠皮下注射NCM-K4DT-Luc2-tdTomato细胞,以92.1-Luc2-tdTomato为阳性对照,监测肿瘤形成12周。
评估NCM-K4DT系是否适用于基于质粒的CRISPR编辑
使用SCIP系统引入UM相关突变(GNAQQ209L、GNA11Q209L、BAP1C91G),通过Sanger测序和ICE分析编辑效率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Wisent | -- |
| Ham's F12培养基 | Wisent | -- | |
| 霍乱毒素 | MilliporeSigma | -- | |
| 佛波醇-12-肉豆蔻酸酯-13-乙酸酯 | MilliporeSigma | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Wisent | -- | |
| 遗传霉素G418 | Corning | -- | |
| CnT-40黑色素细胞增殖培养基 | CELLnTEC | -- | |
| Accumax细胞聚集体解离液 | Innovative Cell Technologies | -- | |
| CryoStor冻存液 | MilliporeSigma | #CS10 | |
| 支原体检测 | MycoAlert PLUS检测试剂盒 | Lonza | -- |
| 质粒构建 | NEB快速连接试剂盒 | New England Biolabs | -- |
| Gibson组装预混液 | New England Biolabs | -- | |
| NEB Stable感受态大肠杆菌 | New England Biolabs | #C3040H | |
| Qiagen EndoFree质粒大提试剂盒 | Qiagen | -- | |
| 慢病毒生产 | ViraPower慢病毒表达系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| PEI MAX 40K转染试剂 | Polysciences | -- | |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | -- | |
| 永生化转导 | 聚凝胺 | Millipore-Sigma | -- |
| Zeocin | InvivoGen | -- | |
| 潮霉素 | Wisent | -- | |
| 荧光素酶检测 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 氯化镁 | Millipore Sigma | -- | |
| 辅酶A | GoldBio | -- | |
| 三磷酸腺苷 | BioBasic | -- | |
| Tris-HCl | Millipore Sigma | -- | |
| D-荧光素钾盐 | GoldBio | -- | |
| 白色96孔板 | Sarstedt | -- | |
| iD5 SpectraMax酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| PCR | DNeasy血液和组织试剂盒 | Qiagen | -- |
| Q5高保真2X预混液 | New England Biolabs | -- | |
| Azure Biosystems c150凝胶成像系统 | Azure Biosystems | -- | |
| Western blot | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 4%至15% Mini-PROTEAN TGX预制蛋白凝胶 | Bio-Rad | -- | |
| CDK4抗体 | Cell Signaling | #12790 | |
| cyclin D1抗体 | Cell Signaling | #2978 | |
| hTERT抗体 | Abcam | #32020 | |
| p21抗体 | Santa Cruz Biotechnology | #6246 | |
| pan-Actin抗体 | Cedarlane | #CLT9001 | |
| 抗小鼠IgG | Jackson Immuno Labs | #115-036-003 | |
| 抗兔IgG | Jackson Immuno Labs | #313-036-003 | |
| WesternSure PREMIUM底物 | LI-COR | -- | |
| C-DiGit印迹扫描仪 | LI-COR | -- | |
| 免疫荧光 | Ki67抗体 | BD Biosciences | #556003 |
| TYRP1抗体 | Abcam | #ab235447 | |
| PMEL抗体 | Abcam | #ab137078 | |
| SOX10抗体 | Abcam | #ab218522 | |
| CRALBP抗体 | Thermo Fisher Scientific | #MA1-813 | |
| Alexa Fluor-594偶联二抗 | Cell Signaling Technology | #A21442 and #A21203 | |
| Phalloidin 488 | Cayman Chemical | #20549 | |
| DAPI | Thermo Fischer Scientific | #D3571 | |
| Alexa Fluor-488山羊抗小鼠 | Thermo Fisher Scientific | #A-11029 | |
| Alexa Fluor-647驴抗兔 | Jackson ImmunoResearch | #715-605-150 | |
| Fluoromount-G封片剂 | Southern Bio | -- | |
| 细胞周期分析 | 碘化丙啶 | -- | -- |
| RNase A | -- | -- | |
| BD Accuri C6 Plus流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 黑色素定量 | 二甲基亚砜 | -- | -- |
| 酪氨酸酶活性测定 | L-DOPA | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 基因分型 | QuickExtract DNA提取液 | Lucigen | -- |
| CNV分析 | Illumina Infinium Global Diversity Array (GDA-8 v1.0) | Illumina | -- |
| 体内成瘤实验 | Matrigel基质胶 | Corning | -- |
| IVIS Lumina II系统 | PerkinElmer | -- | |
| D-荧光素钾盐 | GoldBio | -- | |
| D-PBS | Wisent | -- | |
| Living Image软件 | PerkinElmer | -- | |
| CRISPR编辑 | pQCi质粒 | Addgene | #154090 |
| NucleoSpin质粒转染级试剂盒 | Machery-Nagel | -- | |
| Neon Invitrogen电转仪 | Invitrogen | -- | |
| Ghost Dye Red 780可固定活力染料 | Tonbo Biosciences | -- | |
| FACSMelody细胞分选仪 | BD Biosciences | -- | |
| 组织学 | NDP.view2软件 | Hamamatsu | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 原代NCMs分离与培养 | 供体信息(年龄/性别、PPDI、死因)、眼球处理时间(死后5天内)、培养基配方(DMEM/Ham's F12 1:1,10% FBS,10 ng/mL cholera toxin,100 nM PMA,青霉素/链霉素)、G418筛选浓度(100 µg/mL,P0-P5) 阅读提示:Methods中Cell Models小节及Table 1 |
| K4DT慢病毒转导与筛选 | 转导顺序、MOI(CDK4/Cyclin D1 MOI=5;hTERT MOI=5)、polybrene浓度(5 µg/mL)、转导时间(8小时)、筛选药物浓度和时间(Zeocin 500 µg/mL 12天;hygromycin 150 µg/mL 10天) 阅读提示:Methods中Generation of CDK4/Cyclin D1 and hTERT (K4DT)-Expressing NCMs小节 |
| 细胞增殖和细胞周期分析 | 群体倍增检测时间点(14天,每72-96小时)、LowP(P16-20)和HighP(P25)代次定义、对照细胞代次(P9-13)、PI浓度(50 µg/mL)、RNase A浓度(100 µg/mL) 阅读提示:Methods中Population Doubling and Cell Cycle Analysis小节及Figure 3图注 |
| 黑色素含量和酪氨酸酶活性测定 | 细胞数量(黑色素:2×10^5;酪氨酸酶:2.5×10^4/孔)、L-DOPA浓度(1 mM)、检测波长(黑色素405 nm;酪氨酸酶475 nm)、蛋白归一化方法(BCA) 阅读提示:Methods中Melanin Quantification和L-DOPA Tyrosinase Activity Assay小节 |
| 体内成瘤实验 | 小鼠品系和供应商(NOD-Prkdcem26Cd52Il2rgem26Cd22/NjuCrl;Charles River Laboratories,#572)、注射细胞数(1×10^6)、注射部位(左右侧腹)、每组n数(n=3)、观察时间(12周)、生物发光成像时间点(2、4、8、12周)和底物剂量(100 µL/10 g体重) 阅读提示:Methods中In Vivo Tumorigenicity Assessment小节及Figure 6图注 |
| CRISPR/Cas9基因编辑 | SCIP质粒用量(500 ng/条件)、电转条件、分选时间(转染后24小时)、sgRNA和HAs设计来源、ICE分析软件(Synthego)、GNAQQ209L、GNA11Q209L、BAP1C91G突变设计 阅读提示:Methods中SCIP-Based CRISPR Editing小节及Figure 7图注 |