检测UBE2M在肿瘤内皮细胞中的表达
明确UBE2M在肿瘤血管内皮及尖端细胞中是否表达上调
对B16黑色素瘤、LLC肿瘤及配对正常组织进行CD31与UBE2M免疫荧光染色;对临床肺癌组织切片进行免疫荧光染色;分析GSE118904和GSE159013数据集。
Endothelial deletion of the neddylation E2 enzyme UBE2M inhibits tumor growth by promoting non-productive angiogenesis
包含体外HUVEC模型、条件性内皮UBE2M敲除小鼠肿瘤模型、Matrigel plug assay、临床肺癌样本及单细胞/RNA-seq数据集分析,并有质谱、免疫共沉淀、荧光素酶报告基因等机制验证。
人脐静脉内皮细胞(HUVEC) HEK293T细胞 Ube2miECKO条件性内皮UBE2M敲除小鼠(C57BL/6) B16黑色素瘤及LLC皮下肿瘤模型、E0771原位乳腺癌模型
UBE2M在肿瘤内皮细胞及尖端细胞中表达升高(免疫荧光、GSE118904、GSE159013) 内皮UBE2M缺失导致B16黑色素瘤和E0771乳腺癌生长受抑,但LLC皮下肿瘤生长不受影响 内皮UBE2M缺失导致血管密度增加、平均血管长度缩短、灌注受损及渗漏增加 UBE2M介导STAT1在Lys703位点类泛素化,促进Tyr701磷酸化及DLL4转录 内皮DLL4再表达可恢复Ube2miECKO小鼠肿瘤生长、血管灌注并减少尖端细胞比例
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确UBE2M在肿瘤血管内皮及尖端细胞中是否表达上调
对B16黑色素瘤、LLC肿瘤及配对正常组织进行CD31与UBE2M免疫荧光染色;对临床肺癌组织切片进行免疫荧光染色;分析GSE118904和GSE159013数据集。
验证内皮UBE2M缺失对肿瘤生长的影响
将Ube2mfl/fl小鼠与Cdh5-CreERT2小鼠杂交获得Ube2miECKO小鼠,他莫昔芬诱导敲除后接种B16、E0771或LLC肿瘤细胞,测量肿瘤体积和重量,并进行H&E、TUNEL、Hypoxyprobe-1和Ki67染色。
明确内皮UBE2M缺失导致的血管形态和功能改变
通过CD31免疫荧光、微CT血管造影、激光散斑对比成像、lectin和dextran灌注实验及Matrigel plug assay评估血管密度、长度、分支、灌注和渗漏。
明确UBE2M对 endothelial 细胞增殖、迁移、成管和出芽能力的影响
在HUVEC中通过慢病毒敲低或过表达UBE2M,进行CCK-8、Transwell迁移、划痕愈合、成管和微珠出芽实验;并用MLN4924处理。
探究UBE2M是否通过DLL4影响血管出芽
在UBE2M敲低/过表达或MLN4924处理的HUVEC中检测DLL4蛋白和mRNA;在Ube2miECKO小鼠B16、E0771和LLC肿瘤中检测内皮DLL4表达。
验证DLL4是否是UBE2M下游关键效应分子
在Ube2miECKO小鼠肿瘤内注射Cre诱导的AAV-DLL4,随后他莫昔芬诱导UBE2M敲除并表达DLL4,评估肿瘤生长、缺氧、坏死、血管面积、长度、灌注和尖端细胞比例。
明确UBE2M调控DLL4的分子机制
用质谱筛选HUVEC中NEDD8结合蛋白,结合转录因子数据库预测DLL4转录因子;通过变性免疫共沉淀、Western blot、qPCR和荧光素酶报告基因验证STAT1类泛素化位点及对DLL4的转录调控。
探究UBE2M缺失是否增敏抗VEGF治疗
在肿瘤生长至5 mm时诱导UBE2M敲除,随后每日口服cediranib或联合MLN4924处理,评估B16、E0771和LLC肿瘤生长、血管密度及周细胞覆盖。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco, Thermo Fisher Scientific | -- |
| RPMI-1640培养基 | Gibco, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| M199培养基 | Gibco, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 人内皮无血清培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 内皮细胞生长补充剂 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 慢病毒包装与感染 | PSP质粒 | Addgene | 12260 |
| PMD质粒 | Addgene | 12259 | |
| PLVX-PURO质粒 | Takara Bio | 632164 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 硝酸纤维素膜 | Pall | -- | |
| 免疫荧光 | 抗CD31抗体 | Servicebio | GB150217-100 |
| 抗CD31抗体 | R&D Systems | AF3628 | |
| Western blot与免疫荧光 | 抗UBE2M抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-390064 |
| 抗DLL4抗体 | Cell Signaling Technology | 2589 | |
| 免疫荧光 | 抗DLL4抗体 | R&D Systems | AF1389 |
| Western blot | 抗STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 9172 |
| 抗磷酸化STAT1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8394 | |
| 免疫荧光 | 抗CXCR4抗体 | Abcam | ab124824 |
| 体内缺氧检测 | Hypoxyprobe-1缺氧探针 | Hypoxyprobe, Inc. | HP1-100 |
| 免疫荧光 | Ki67抗体 | Abcam | ab15580 |
| RNA提取与逆转录 | TRIzol试剂 | ThermoFisher Scientific | -- |
| RT-qPCR | ReverTraAce qPCR逆转录试剂盒 | Toyobo Inc. | -- |
| LightCycler 480 II实时PCR系统 | Roche | -- | |
| 血管灌注与渗漏检测 | FITC标记葡聚糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| 血管灌注检测 | DyLight 488标记番茄凝集素 | Vector Laboratories | -- |
| DyLight 649标记番茄凝集素 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 微CT血管造影 | Microfil血管造影剂 | Flow Tech | -- |
| Matrigel plug实验 | 低生长因子Matrigel | Corning | -- |
| 重组小鼠FGF-2 | -- | -- | |
| VEGF-A | -- | -- | |
| 肝素 | -- | -- | |
| Transwell迁移实验 | Transwell小室 | Corning | -- |
| 结晶紫 | Beyotime | -- | |
| 成管实验 | μ-Slide血管生成板 | Ibidi | -- |
| 钙黄绿素 | Yeasen | -- | |
| 出芽实验 | 微载体珠 | Cytiva | -- |
| 纤维蛋白原 | Solarbio | -- | |
| 抑肽酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 凝血酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 荧光素酶报告基因实验 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
| 药物处理 | MLN4924 | -- | -- |
| 西地尼布 | MCE | -- | |
| 乌帕替尼 | -- | -- | |
| MG132 | -- | -- | |
| DAPT | -- | -- | |
| 免疫荧光封片 | fluoromount-G封片剂 | Southern Biotech | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 内皮UBE2M敲除小鼠诱导 | 他莫昔芬剂量20 mg/kg/d,腹腔注射5天,间隔1周后接种肿瘤 阅读提示:Methods中Mice小节及Mouse tumor models and treatment小节 |
| 皮下肿瘤接种 | B16或LLC细胞1×10^6个/100 μL PBS皮下接种;E0771细胞1×10^6个/100 μL PBS接种乳腺脂肪垫 阅读提示:Methods中Mouse tumor models and treatment小节 |
| cediranib联合治疗 | cediranib每日灌胃1.5 mg/kg,肿瘤建立后开始给药至取材 阅读提示:Methods中Mouse tumor models and treatment小节 |
| Matrigel plug实验 | Matrigel含FGF-2 400 ng/mL、VEGF-A 400 ng/mL和肝素50 units/mL,皮下注射后第7天取材 阅读提示:Methods中Matrigel plug assay小节 |
| 血管灌注与缺氧检测 | Hypoxyprobe-1 60 mg/kg静脉注射后循环60分钟;dextran 25 mg/mL、lectin 1 mg/mL静脉注射后循环30分钟 阅读提示:Methods中Pimonidazole stain, vascular leakage and perfusion assay小节 |
| HUVEC培养与慢病毒感染 | HUVEC使用第3至6代,培养于含10% FBS、1% P/S、53% M199、37%人内皮无血清培养基和15 mg/mL内皮细胞生长补充剂的完全M199中 阅读提示:Methods中Cells小节 |
| STAT1类泛素化位点验证 | 预测的5个赖氨酸位点K110、K673、K679、K697和K703,其中K703R突变几乎完全消除类泛素化 阅读提示:Results中Neddylation promotes the activity of the DLL4 transcription factor STAT1小节及Figure 8C |