胚胎收集与玻璃化
获取并冷冻保存小鼠和人卵裂期胚胎。
小鼠胚胎通过超排卵后交配收集,人胚胎来自临床捐赠。胚胎经玻璃化冷冻保存。
Multi-omics and developmental comparison of direct and conventional warming methods in vitrified human and mouse cleavage-stage embryos
包含小鼠体外发育、胚胎移植、出生后发育评估,以及人和小鼠转录组与DNA甲基化多组学分析,实现体内外功能与分子验证。
小鼠卵裂期胚胎(C57BL/6J) 人捐献卵裂期胚胎
胚胎发育时期(6-10细胞或桑葚胚) 卵裂球存活率是否≥50% RNA-seq和WGBS测序中DEGs和DMRs的筛选阈值(|log2FC|>1, 调整后P<0.05;甲基化差异≥20%, q<0.01) 胚胎移植中每只受体移植5-12个囊胚
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取并冷冻保存小鼠和人卵裂期胚胎。
小鼠胚胎通过超排卵后交配收集,人胚胎来自临床捐赠。胚胎经玻璃化冷冻保存。
比较两种复温方法对胚胎存活率的影响。
小鼠胚胎随机分配至直接复温(直接放入M2培养基)或传统复温(0.25M蔗糖);人胚胎直接放入G-TL培养基或传统步骤。
评估复温后胚胎的存活和发育能力。
胚胎在培养箱中培养,用EmbryoScope或Primo Vision连续监测发育至囊胚阶段,并评估存活率、囊胚形成率和优质囊胚率。
评估复温后的胚胎在体内的着床和发育潜力。
小鼠囊胚移植至假孕雌鼠(TCET),评估着床率、活产率及出生后到第21天的生长发育。
比较分子层面(转录组和DNA甲基化)差异。
对复温后的胚胎进行RNA-seq(转录组)和WGBS(甲基化),分析差异表达基因和差异甲基化区域。
处理测序数据并进行差异表达、差异甲基化及通路分析。
使用HISAT2比对RNA-seq,featureCounts定量,DESeq2分析差异;Bismark处理WGBS数据,甲基化水平由methylKit分析;功能富集用clusterProfiler。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 胚胎玻璃化 | Irvine Scientific玻璃化试剂盒 | Irvine Scientific | 90183 |
| 胚胎培养 | G-TL培养基 | Vitrolife | 10145 |
| KSOM培养基 | Sigma-Aldrich | MR-106 | |
| 矿物油 | Vitrolife | 10029 | |
| M2培养基 | Sigma-Aldrich | MR-015 | |
| 胚胎玻璃化 | DAP213溶液 | COSMO BIO USA | KYD-013-EX-0.5 |
| 胚胎复温 | 蔗糖溶液 | COSMO BIO USA | KYD-014-EX-2 |
| 胚胎培养 | EmbryoScope延时培养箱 | Vitrolife | -- |
| Primo Vision延时系统 | Vitrolife | -- | |
| 胚胎移植 | 经宫颈胚胎导管移植 | Baoding Zhengmu Biotechnology | -- |
| 超排卵 | 孕马血清促性腺激素 | BioVendor | RP1782725000 |
| 人绒毛膜促性腺激素 | Sigma-Aldrich | C1063 | |
| RNA-seq | SMART-Seq全RNA Pico输入试剂盒 | Takara Bio | 634355 |
| 甲基化测序 | Pico甲基化测序文库制备试剂盒 | Zymo Research | D5456 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 胚胎收集与玻璃化 | 胚胎发育时期(6-10细胞或桑葚胚),玻璃化方法 阅读提示:Materials and methods - Mouse embryo experiments |
| 复温与体外培养 | 直接复温组使用预平衡(37°C)培养基,传统组使用蔗糖梯度;培养基型号(G-TL、KSOM、M2) 阅读提示:Materials and methods - Vitrification and warming procedures |
| 移植后评估 | 移植数量和胎龄(5-12个囊胚,7.5dpc;出生后PND1-21评估) 阅读提示:Materials and methods - Evaluation and transfer |