病例选择与病理学审查
确认诊断并记录肿瘤的形态学特征。
回顾性收集了10例LFS患者的子宫平滑肌肿瘤标本,由两名妇科病理学家审查切片,记录核异型性、核分裂象、肿瘤坏死等特征。
Clinicopathological and molecular features of uterine smooth muscle tumours in patients with Li-Fraumeni syndrome
回顾性病例系列,包含临床病理分析、免疫组化及靶向DNA/RNA测序,但样本量小,缺乏功能验证和动物实验。
10例LFS患者的子宫平滑肌肿瘤样本 8个肿瘤的靶向DNA测序分析
胚系TP53突变类型及状态 p53免疫组化染色模式 FH免疫组化及2SC状态 分子改变(TP53、FH、MED12、RB1、ATRX等)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认诊断并记录肿瘤的形态学特征。
回顾性收集了10例LFS患者的子宫平滑肌肿瘤标本,由两名妇科病理学家审查切片,记录核异型性、核分裂象、肿瘤坏死等特征。
检测FH、p53和2SC的表达状态以评估蛋白表达异常。
对FFPE组织切片进行FH、p53和2SC的免疫组化染色,并对p53和FH的表达模式进行评分。
检测肿瘤样本中的基因突变、拷贝数变异和结构重排。
从FFPE组织中提取DNA,使用OncoPanel POPv3.1 panel进行靶向测序,分析SNV、Indel、CNV和结构重排。
验证和表征DNA测序中检测到的ACTG2::BRAF融合转录本。
对一例肿瘤进行RNA测序,使用ArcherDx FusionPlex Pan Solid Tumour v2 panel进行靶向融合转录本检测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 病例选择与病理学审查 | 患者诊断LFS的标准、uSMT诊断标准、纳入排除标准 阅读提示:见Material and methods中的'Case Selection and Pathology Review'部分 |
| 免疫组化 | 抗体克隆号、稀释比例、抗原修复条件 阅读提示:见Material and methods中的'Immunohistochemistry'部分 |
| 靶向DNA测序 | 基因panel版本、测序平台、数据分析流程 阅读提示:见Material and methods中的'Targeted DNA Next-Generation Sequencing'部分 |
| 靶向RNA测序 | RNA提取方法、文库构建试剂盒、测序平台 阅读提示:见Material and methods中的'Targeted RNA Next-Generation Sequencing'部分 |