患者队列构建和临床数据采集
纳入符合标准的BA患者并获取其临床特征和结局数据
从1987-2024年间在Helsinki University Hospital治疗的87例BA患者中筛选出60例,所有患者均有PH诊断的临床数据并至少有一次肝活检。回顾性收集医疗记录中的临床数据和血清肝脏生化指标。
Ductular Reaction Underlies Development of Portal Hypertension in Biliary Atresia
回顾性队列研究,包含患者临床数据、肝活检组织学分析及神经网络定量,并运用Cox回归和AUROC等方法进行统计分析,但缺乏体外或动物模型的功能验证。
胆道闭锁患者队列 Kasai肝门空肠吻合术后肝活检组织
PH定义为内镜下食管静脉曲张(≥II级)或血小板减少(<150×10^9/L)伴脾肿大(脾长≥年龄和性别特异性参考值2个Z分数以上) 肝活检时间点:KPE术中及术后1年(中位1.1年) DR量化采用CharBADR神经网络模型分析CK7染色切片 纤维化评估采用Metavir分期和计算机化SRP%定量 Jaundice清除定义为血清胆红素低于20μmol/L
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
纳入符合标准的BA患者并获取其临床特征和结局数据
从1987-2024年间在Helsinki University Hospital治疗的87例BA患者中筛选出60例,所有患者均有PH诊断的临床数据并至少有一次肝活检。回顾性收集医疗记录中的临床数据和血清肝脏生化指标。
利用神经网络模型定量分析肝活检中的DR组分
使用已发表的CharBADR模型对CK7染色的活检切片进行自动化组织学图像分析,识别门脉区、实质区、胆管上皮和中间型肝细胞,并计算BE%、PIH%、DR%和PIH密度。
量化肝纤维化程度
使用Metavir分期和计算机化定量天狼星红阳性面积(SRP%)评估肝纤维化。
定义原发性门静脉高压的发生
根据内镜下食管静脉曲张(≥II级)或血小板减少伴脾肿大的临床标准诊断PH,并记录诊断PH的年龄。
评估DR与纤维化指标对PH的预测价值
运用Cox回归模型、AUROC分析和Kaplan-Meier生存分析确定预测PH的独立因素和最佳截断值。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织学图像分析 | Aiforia Cloud | Aiforia Technologies | -- |
| 图像分割 | HistoQuant | -- | -- |
| 统计分析 | SPSS 24版 | -- | -- |
| 纤维化染色 | 天狼星红 | -- | -- |
| 免疫组化 | 细胞角蛋白7抗体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者纳入 | 患者来源(赫尔辛基大学医院)、治疗时间范围(1987-2024)、诊断标准、是否接受KPE、有无PH临床数据、至少一次肝活检 阅读提示:2.2 Patients and Study Design |
| 肝活检 | KPE时和术后约1年的活检,随访活检窗口设为术后6个月至3年,活检处理(如固定、切片)方法 阅读提示:2.2 Patients and Study Design |
| DR定量 | CK7染色方案和图像采集设置、CharBADR模型和Aiforia Cloud平台参数、Be%定义和计算方法 阅读提示:2.4 Assessment of DR and Liver Fibrosis及图S1 |
| 纤维化定量 | Metavir分期参照系统、天狼星红染色方法、SRP%定量算法和HistoQuant设置 阅读提示:2.4 Assessment of DR and Liver Fibrosis |
| PH诊断 | 食管静脉曲张分级(Paquet分级≥II)、血小板计数阈值<150×10^9/L、脾肿大定义(超声脾长≥2 Z分数) 阅读提示:2.5 Diagnosis of PH |
| 统计分析 | Cox回归模型协变量、最佳截断值优化方法(最大约登指数)、随访时间定义(从活检到PH诊断) 阅读提示:2.6 Statistical Analysis |