酶促糖基化和酰胺化重塑多烯类抗生素的生物活性

Enzymatic glycosylation and amidation reshapes polyene bioactivity

作者信息Saadia N Mirza, Alberto Carella, Joseph W Thompson, Deepanjan Panda, Anna R I McDonald, Matthew D Crossley, Wei Li Thong, Katherine J Robins, Sarah A Shepherd, Matthew J Cliff, Clara Valero, Andrew Thom, Michael Bromley, Jason Micklefield
PMID42527598
期刊Nature
发布时间2026-09
DOI10.1038/s41586-026-10834-8

实验完整度

包含体外酶活测定、异源表达、体内动物感染模型、NMR结构表征等多层次实验,并进行功能验证和机制研究。

主要模型

体外酶促反应体系(纯化GTs、PcsA等酶) 白色链霉菌 (Streptomyces albus J1074) 异源表达宿主 结节链霉菌 (Streptomyces nodosus DSM 40109) 工程菌株 CD1小鼠侵袭性曲霉病模型

重点核对

KfuSV等糖基转移酶的体外活性及底物谱 NysSV亚簇体内功能验证(S. albulus产NysA3) 双修饰衍生物Nys34的抗真菌活性与毒性 Nys34在小鼠体内的药代动力学及疗效

摘要

真菌疾病对人类健康的威胁日益加剧,原因是抗菌素耐药性的上升和缺乏新的抗真菌治疗方法1,2。多烯类抗生素是一类复杂的天然产物,因其广谱活性而被广泛用作抗真菌药物3。然而,其临床应用受到严重毒性和溶解性差的限制,因此迫切需要更安全有效的替代品4。先前生产改良多烯的努力依赖于成本高、步骤效率低和原子效率低的化学合成5,6。在这里,我们描述了以前未描述的多烯类化合物的生物合成途径的发现和表征,包括将糖引入多烯骨架的不寻常的糖基转移酶。我们还展示了如何扩大酰胺转移酶的反应范围,将多烯类化合物中有害的羧酸取代基转化为其他官能团。引入第二个糖并结合羧酸修饰,可产生更有效的多烯抗真菌药物,其毒性降低,并且可通过清洁高效的发酵或酶法途径获得。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
如何通过酶法对多烯类抗生素进行糖基化和羧酸修饰,以获得活性更高、毒性更低、溶解度更好的衍生物?
核心机制
Nys34等双修饰衍生物可能不通过结合麦角固醇发挥作用,其作用机制可能与母体多烯(如AmB和NysA1)的固醇海绵机制不同,但具体机制尚未阐明。
主要证据
体外酶活实验确定糖基转移酶(如KfuSV)和酰胺转移酶PcsA的功能;NMR确证NysA3、AmB-l-digitoxose等结构;IC50测定显示NysA3衍生物较NysA1活性提高;小鼠感染模型显示Nys34降低肺真菌载量87%;UV-Vis滴定显示Nys34不结合麦角固醇。
研究意义
本研究提供了一种高效清洁的酶法平台,用于优化多烯类抗真菌药物的生物活性和调节其作用机制,为开发更安全有效的抗真菌药物提供了新途径。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

糖基转移酶的发现与体外表征

鉴定能对多烯底物添加糖基的酶,并测试其底物灵活性。

通过基因组挖掘在多种链霉菌中发现候选糖基转移酶(SelSV、SnNysSV、SaNysSV、MycS3、KfuSV),在大肠杆菌中过表达并纯化,以TDP-糖为供体与AmB或NysA1等多烯底物进行体外反应,通过LC-HRMS检测产物。

2

NysSV的功能验证

验证NysSV是否负责将l-digitoxose添加到NysA1的C35位产生NysA3。

从S. albulus和S. noursei纯化NysA3,进行反向糖基化实验(加入TDP和酶),监测NysA1生成;在异源宿主S. albus中表达SaNysSV亚簇,其裂解液与NysA1孵育检测NysA3产生。

3

MycS3和KfuSV的功能验证

确认MycS3和KfuSV分别参与mycoheptin和kasufungin生物合成中的糖基化步骤。

MycS3与dihydromycoheptin和TDP-l-digitoxose孵育,观察单糖加成产物;KfuSV与kasufungin B和TDP孵育,检测kasufungin D形成。

4

体内糖基化修饰多烯

在产AmB的菌株S. nodosus中异源表达KfuSV或SaNysSV亚簇,验证特定位点添加l-digitoxose。

将kfuSV或SaNysSV亚簇表达质粒导入S. nodosus,发酵后提取产物,LC-HRMS和NMR分析确认AmB-l-digitoxose结构。

5

酶法羧酸化修饰及衍生物制备

扩展酰胺转移酶PcsA的底物范围,催化多烯C16羧酸转化为酰胺、异羟肟酸或酰肼,以获得毒性降低的衍生物。

使用含His6标签的PcsA,与NysA1、NysA3、pimaricin等聚烯底物及l-谷氨酰胺或其类似物(如γ-羟肟酸、γ-肼)反应,LC-HRMS和NMR确认产物。

6

抗真菌活性和毒性评价

测定新多烯衍生物对多种临床真菌病原体的抑制活性及对红细胞和哺乳动物细胞的毒性。

根据EUCAST方法测定IC50值;用马血溶血试验评估毒性EC50;对人细胞系(HEK293、A549、HEPG2)进行MTS毒性试验。

7

体内疗效和药代动力学评价

评估Nys34在免疫抑制小鼠侵袭性曲霉病模型中的疗效和耐受性,并建立药代动力学模型指导剂量方案。

对CD1小鼠进行最大耐受剂量探索,单次药代动力学研究(采血),感染A. fumigatus CEA10后用Nys34和AmB治疗,测定肺真菌载量。同时进行群体药代动力学建模和蒙特卡洛模拟选择方案。

8

作用机制初步研究

探究Nys34不同与母体多烯的作用机制,是否涉及麦角固醇结合。

通过UV-Vis滴定检测多烯与麦角固醇的结合,以及麦角固醇预复合对抗真菌活性的影响,比较AmB、NysA1和Nys34。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
体外糖基转移酶活性测定
反应体系中酶的浓度(5-20 µM)、TDP-糖供体浓度(2 mM)、MgCl2浓度(1 mM)、多烯底物浓度(100 µM)、缓冲液及pH(50 mM Tris-HCl,pH 7.4)、反应温度(30°C)和时间(24小时)
阅读提示:Methods: In vitro GT glycosylation assays
糖基转移酶底物谱分析
TDP-糖的合成方法、测试的19种TDP-糖、KfuSV对11种TDP-糖的活性
阅读提示:Methods: In vitro GT glycosylation assays; Extended Data Fig. 1
异源表达亚簇构建
使用的引物序列、质粒构建方法、宿主菌株(S. albus J1074 和 S. nodosus DSM 40109)
阅读提示:Methods: Expression of S. albulus nysSV-subcluster in S. albus; Methods: Expression of kfuSV- and Sa-nysSV-subclusters in S. nodosus
Polyene发酵生产
培养基组成(FSM、GYM、SPG)、树脂种类和浓度(amberlite XAD16N,50 g/L)、发酵天数(7天)、提取溶剂(甲醇)
阅读提示:Methods: Production of polyenes from S. albulus and S. noursei; Methods: Production of polyenes from S. netropsis; Methods: Production of polyenes from S. kasugaensis
活性和毒性测试
抗真菌测试所用培养基(RPMI-1640)、接种物浓度(5×10^5/mL)、孵育时间(48小时);马血红细胞的浓度(2.5%)、孵育条件(37°C,1小时)
阅读提示:Methods: Antifungal activity tests (IC50 determination); Methods: Horse blood haemolysis
动物实验
小鼠品系(CD1)、免疫抑制方案(Triamcinolone 40 mg/kg)、感染剂量(5×10^5 CEA10孢子)、给药方案(Nys34 5 mg/kg q8h ×4)、终点(CFU/克肺组织)
阅读提示:Methods: Drug tolerability and pharmacokinetic studies in mice; Methods: Infection experiments in mice