人类脊髓样本收集与种子制备
从D90A患者和对照的脊髓腹角制备可能含有SOD1聚集体的接种种子。
从6名D90A患者和4名对照的腰脊髓腹角制备种子,使用三种不同协议(I、II、III)进行匀浆、离心和沉淀。
Seeds from ALS patients homozygous for the SOD1 D90A mutation transmit two types of SOD1 aggregation and motor neuron disease
包含患者样本种子制备、小鼠接种实验、BEM结构分析、组织病理学和生存分析,多个独立证据层级,并明确功能验证。
hSOD1G85R转基因小鼠 hSOD1D90A纯合突变患者脊髓腹角样本 人类对照脊髓样本
患者来源:6例D90A纯合突变患者和4例对照 种子制备:三种不同方案(方案I、II、III) 接种剂量:1 µl种子,SOD1浓度0.011–0.069 µg/ml 接种位置:成年hSOD1G85R小鼠腰椎腹角L2-L3水平 生存分析:Kaplan-Meier曲线,log-rank检验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从D90A患者和对照的脊髓腹角制备可能含有SOD1聚集体的接种种子。
从6名D90A患者和4名对照的腰脊髓腹角制备种子,使用三种不同协议(I、II、III)进行匀浆、离心和沉淀。
检验人类种子是否能传播疾病并缩短hSOD1G85R转基因小鼠的寿命。
将1 µl种子接种到100日龄hSOD1G85R小鼠的腰椎腹角,监测小鼠直到终末期。
确定接种是否显著影响生存期。
使用Kaplan-Meier曲线和log-rank检验比较不同处理组小鼠的生存期。
确定传播的聚集体是菌株A还是菌株B。
对终末期小鼠的脊髓匀浆进行BEM分析,使用8种抗体检测聚集体表位。
观察聚集体形态和菌株特异性。
用免疫组织化学和荧光双标染色观察脊髓切片中的聚集体。
排除非特异性效应。
用对照人类和对照小鼠的种子接种,不显示生存缩短或播种效应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 种子制备 | Ultra-Turrax匀浆器 | IKA | -- |
| NP-40 | -- | -- | |
| 盐酸胍 | -- | -- | |
| 碘海醇 | -- | -- | |
| 小鼠手术 | 异氟烷 | -- | -- |
| Rimadyl(卡洛芬) | -- | -- | |
| 组织粘合剂 | 3M Vetbond | -- | |
| 立体定位仪 | Kopf Instruments | -- | |
| 注射器 | Hamilton | 33/78/4 S 30 | |
| 灌注泵 | KD Scientific | -- | |
| 蛋白质定量 | Pierce BCA蛋白检测试剂盒 | ThermoFisher Scientific | -- |
| 牛血清白蛋白标准品 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 免疫印迹 | Criterion TGX Stain-Free Any-KD预制胶 | Bio-Rad Laboratories | -- |
| Trans-Blot Turbo Midi硝酸纤维素转印包 | Bio-Rad | -- | |
| Trans-Blot Turbo转印系统 | Bio-Rad | -- | |
| ChemiDoc Touch成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| ImageLab软件 | Bio-Rad | -- | |
| ECL Select化学发光底物 | Cytiva | -- | |
| 免疫组化 | Discovery Ultra自动染色仪 | Roche Diagnostics | -- |
| Ventana蛋白酶1 | Roche Diagnostics | -- | |
| ChromoMap DAB检测试剂盒 | Roche Diagnostics | -- | |
| Pertex封片剂 | DakoCytomation | -- | |
| 罗丹明试剂盒 | Roche Diagnostics | -- | |
| FITC试剂盒 | Roche Diagnostics | -- | |
| DAPI | Roche Diagnostics | -- | |
| 荧光封片剂 | DAKO | -- | |
| 奥林巴斯BX61显微镜 | Olympus | -- | |
| 蔡司710共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 抗体 | 抗兔HRP标记二抗 | DAKO | P0440 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 种子制备 | 种子制备协议(I、II、III)的差异,特别是盐酸胍浓度和离心步骤;样本来源(患者A1-A6和对照C1-C4)的SOD1浓度和总蛋白浓度。 阅读提示:详见Materials and Methods中“Human material and preparation of seeds”和表格1、表2。 |
| 小鼠接种 | 接种用hSOD1G85R小鼠的年龄(100日龄)、接种位点(腰椎腹角L2-L3)、体积(1 µl)、注射速率(0.125 µl/min)和麻醉方案。 阅读提示:参见Materials and Methods中“Inoculation of the ventral horn seeds into lumbar spinal cord and monitoring of mice”。 |
| 生存分析 | 非接种对照组小鼠的生存时间(平均297天,减去接种日龄102天)以及对照组和患者组的统计比较。 阅读提示:参考Results中“Seeds from homozygous hSOD1D90A patients transmit motor neuron disease”和表格3、表4。 |
| BEM分析 | 使用8种抗体的BEM方法,归一化基于57-72抗体染色强度,标准品为hSOD1G93A脊髓匀浆。 阅读提示:参见Materials and Methods中“Binary epitope-mapping assay for hSOD1 aggregate structure”和补充图S1。 |
| 组织病理学 | 抗体aa 57-72和aa 111-127的使用,以及单标和双标免疫组化方案(包括抗原修复、抗体浓度和显色系统)。 阅读提示:参考Materials and Methods中“Histopathology for strain A and B aggregates”。 |