模拟数据验证RIED重建可行性
验证反应驱动光子统计能否提供有效波动以增强分辨率并忠实恢复真实结构
模拟了低光子、不同异质性程度的发光信号,使用RIED进行重建并与真值比较,通过PSNR和RSE评估保真度。
Luminescent-reaction-enabled super-resolution imaging
包含模拟数据验证、体外细胞成像(ECL/CL/BL)、跨模态比较(SACD、SIM)、3D成像及超长时程活细胞追踪,并进行了系统的分辨率与伪影评估。
HeLa细胞 COS-7细胞 MCF-7细胞
用于ECL成像的Ru(bpy)32+标记抗体浓度及Bis-tris共反应剂浓度(100mM) ECL成像的电压范围(0.9-1.8V)与扫描步长(200nm) CL和BL成像中底物FFz浓度(10μM)及流动速率(40-250μl/min) 用于BL成像的活细胞培养条件(37°C,5% CO2) 用于荧光比较的激光功率(488nm,5mW/mm2)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证反应驱动光子统计能否提供有效波动以增强分辨率并忠实恢复真实结构
模拟了低光子、不同异质性程度的发光信号,使用RIED进行重建并与真值比较,通过PSNR和RSE评估保真度。
建立高效ECL细胞成像系统并评估图像增强效果
使用Ru(bpy)32+标记抗体和Bis-tris共反应剂,对HeLa细胞中微管进行ECL成像,与TPrA对比亮度,并通过RIED重建获得超分辨图像。
评估RIED-ECL的空间分辨率、帧数需求及与荧光超分辨方法的一致性
对HeLa细胞微管进行RIED-ECL成像,与SACD-FL对比,通过FRC、SSIM和峰值间距分析分辨率。
实现3D超分辨ECL成像并验证轴向分辨率
通过同步电压变化和轴向扫描采集不同深度图像,重建3D微管结构。
评估RIED-ECL在低丰度生物标志物检测中的灵敏度
用RIED-ECL和SACD-FL检测MCF-7细胞表面CEA,比较检测阈值。
验证RIED对CL和BL的普适性及三维成像能力
使用GeNL探针分别在固定细胞和活细胞中实现线粒体等结构的超分辨成像,并评估分辨率和长时间稳定性。
验证RIED-BL在超长时程下追踪线粒体动力学和细胞行为的能力
在COS-7细胞中持续成像41小时,追踪线粒体运动轨迹并分析速度、直径等参数,观察线粒体分裂和融合。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Sangon Biotech | -- | |
| 胰蛋白酶-EDTA | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞透化 | Triton X-100 | Sigma-Aldrich | -- |
| 封闭 | 牛血清白蛋白 | Sangon Biotech | -- |
| 抗体标记 | 山羊抗兔IgG | Huabio | -- |
| Ru(bpy)2(mcbpy-O-Su-ester)(PF6)2 | Aladdin | -- | |
| ECL成像 | 三(2,2'-联吡啶)钌(II) | -- | -- |
| 三丙胺 | Energy Chemical | -- | |
| Bis-tris | Energy Chemical | -- | |
| CL/BL成像 | 氟呋喃嗪 | Promega | -- |
| 转染 | Lipofectamine 3000 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 流式分析(活/死细胞检测) | 碘化丙啶 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞成像 | 电子倍增CCD相机 | Andor | -- |
| 成像激发 | 488纳米激光器 | CNI | -- |
| 488纳米激光器 | Oxxius | -- | |
| ECL电化学激发 | CHI 760e电化学工作站 | CH Instruments | -- |
| 显微镜 | IX83倒置显微镜 | Olympus | -- |
| Ti2e倒置显微镜 | Nikon | -- | |
| HIS-SIM超分辨系统 | CSR Biotech | -- | |
| 活细胞工作站 | 活细胞工作站 | Tokai Hit | -- |
| 活细胞工作站 | OKO Lab | -- | |
| 蠕动泵 | 蠕动泵 | Masterflex | -- |
| CO2培养 | CO2培养箱 | -- | -- |
| 成像 | sCMOS相机 | Hamamatsu | -- |
| ECL成像 | ITO盖玻片 | -- | -- |
| 电化学系统 | 铂片 | -- | -- |
| 银/氯化银参比电极 | -- | -- | |
| 透析 | Membra-Cel MD44透析袋 | Viskase | -- |
| 抗体 | 抗α-微管蛋白抗体 | Abcam | -- |
| 抗TOMM20抗体 | Abcam | -- | |
| 抗CEA抗体 | Abcam | -- | |
| 抗整合素α5抗体 | Abcam | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| ECL成像 | 共反应剂类型(TPrA vs Bis-tris)及浓度(100mM);工作电压范围(0.9-1.8V);曝光时间(20ms-1s等);EM增益(500) 阅读提示:Methods:ECL imaging 小节 |
| CL/BL成像 | 底物FFz浓度(10μM或4-6μM);曝光时间(100-500ms等);灌注速率(40-250μl/min) 阅读提示:Methods:CL imaging和BL imaging 小节 |
| 细胞培养与标记 | 细胞系(HeLa, COS-7, MCF-7);培养条件(37°C,5%CO2);固定条件(4%PFA 30min);封闭液(1%Triton X-100和5%BSA/PBS);抗体浓度(1:100和10μg/ml Ru标记二抗) 阅读提示:Methods:Cell culture and immunolabelling 小节 |
| 活细胞成像对比 | SIM成像平台(HIS-SIM);激光功率(5mW/mm²);曝光时间(100ms);成像持续时间(18min内信号衰减) 阅读提示:Methods:SIM for live-cell imaging 小节 |
| 线粒体追踪分析 | 追踪工具(TrackMate);分析软件(MATLAB);MSD计算限制在前25%轨迹;扩散指数α计算 阅读提示:Methods:Mitochondrial tracking and analysis 小节 |