MC3纯度分析
评估三个供应商MC3的化学纯度并识别主要杂质。
使用HPLC-CAD/PDA对三个供应商的MC3样品进行纯度评估,收集杂质峰馏分并进行LC-MS/MS鉴定。
Impact of ionizable lipid source on quality and stability of siRNA-loaded lipid nanoparticles
研究涵盖体外细胞实验(HepG2基因沉默、活力、PBMC免疫原性),并用多种理化表征(DLS、DSC、SAXS、Cryo-EM)及70天稳定性评估进行验证,证据层级独立。
HepG2细胞 人PBMC siRNA-LNP制剂(V1、V2、V3)
MC3纯度差异(86-99%),杂质主要为二烯酮 siRNA-LNP的N/P比为3.4 HepG2细胞处理浓度:mRNA/蛋白敲低5 nM,活力30 nM PBMC处理浓度:30 nM 储存条件:4°C和25°C,70天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估三个供应商MC3的化学纯度并识别主要杂质。
使用HPLC-CAD/PDA对三个供应商的MC3样品进行纯度评估,收集杂质峰馏分并进行LC-MS/MS鉴定。
使用不同来源MC3制备siRNA-LNP,以评估杂质是否保留并影响纳米颗粒特性。
使用微流控混合NanoGenerator Flex-M系统制备含有不同MC3来源的siRNA-LNP(V1、V2、V3),并透析去除乙醇。
检测MC3杂质是否被保留在LNP制剂中。
通过离心超滤浓缩LNP,用甲醇溶解,然后进行LC-CAD分析,比较MC3原料和LNP的色谱图。
评估不同MC3来源的LNP在粒径、Zeta电位、包封效率、表观pKa、内部结构和热行为方面的差异。
使用DLS测量粒径和Zeta电位,RiboGreen法测定包封效率,TNS荧光法测定表观pKa,DSC记录热谱,SAXS检测内部结构,Cryo-EM观察形态。
评估不同MC3来源的LNP对HepG2细胞中TTR mRNA和蛋白敲低效率、细胞活力及PBMC免疫原性的差异。
HepG2细胞用5 nM siRNA-LNP处理48小时,提取RNA进行qRT-PCR检测TTR mRNA;处理72小时后收集上清进行ELISA检测TTR蛋白;用30 nM处理48小时进行细胞活力检测;PBMC用30 nM处理24小时,上清用于Luminex检测细胞因子。
评估MC3来源对LNP在4°C和25°C储存70天后的化学和物理稳定性及功能的影响。
LNP在4°C和25°C储存70天后,通过LC分析化学组成,DLS测量粒径、PDI、Zeta电位,RiboGreen法测定包封siRNA,并进行mRNA敲低和细胞活力测试。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 纯度分析 | 高效液相色谱系统 | Shimadzu | -- |
| Corona Veo RS电雾式检测器 | Thermo Scientific | -- | |
| BEH C18色谱柱(3.5 μm,130 Å,3 mm × 150 mm) | Waters | -- | |
| 杂质鉴定 | ACQUITY Premier CSH C18色谱柱(2.1 × 100 mm,1.7 μm) | Waters | -- |
| Synapt G2-Si q-TOF质谱仪 | Waters | -- | |
| LNP制备 | NanoGenerator Flex-M微流控系统 | PreciGenome | -- |
| 透析卡(MWCO 3.5 kDa) | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 理化表征 | Zetasizer pro纳米粒度仪 | Malvern Panalytical | -- |
| Quant-iT RiboGreen RNA定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| TNS(6-(对甲苯胺基)-2-萘磺酸钠盐) | MilliporeSigma | -- | |
| Spark多功能酶标仪 | Tecan | -- | |
| MicroCal PEAQ-DSC自动化差示扫描量热仪 | Malvern Panalytical | -- | |
| Empyrean衍射仪配备ScatterX78附件 | Malvern Panalytical | -- | |
| C-flat载网 | EMS | -- | |
| Quantifoil 1.2/1.3载网 | EMS | -- | |
| Glacios透射电子显微镜 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Falcon 4i直接电子探测器 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 脂质成分分析 | Amicon Ultra离心超滤管(3 kDa) | MilliporeSigma | -- |
| 细胞培养 | Eagle基本必需培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| Hank's平衡盐溶液 | ATCC | -- | |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| mRNA敲低 | Direct-zol RNA小提试剂盒 | Zymo Research | -- |
| NanoDrop分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | -- | |
| Veriti热循环仪 | Applied Biosystems | -- | |
| QuantStudio 5实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 蛋白敲低 | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 人前白蛋白SimpleStep ELISA试剂盒 | Abcam | ab231920 | |
| 细胞活力 | CellTiter-Glo发光细胞活力检测试剂盒 | Promega | -- |
| 细胞因子检测 | 人Luminex液相芯片检测试剂盒 | R&D Systems | LXSAHM-13 |
| Luminex 200系统 | R&D Systems | -- | |
| MC3供应商 | DLin-MC3-DMA (MC3) | MedChemExpress, MedKoo Biosciences, Echelon Biosciences | -- |
| LNP制备 | 二硬脂酰磷脂酰胆碱 | Avanti Polar Lipids | -- |
| PEG2000-C-DMG | MedChemExpress | -- | |
| 胆固醇 | MedChemExpress | -- | |
| 帕替西兰钠siRNA | MedChemExpress | -- | |
| 阴性对照siRNA | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞因子检测 | 大肠杆菌O111:B4脂多糖 | MilliporeSigma | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MC3纯度分析 | MC3供应商来源,样品浓度,LC方法条件(色谱柱、流动相、梯度),LC-MS/MS参数(离子模式、碰撞能量) 阅读提示:Section 2.2 纯度评估 |
| siRNA-LNP制备 | 脂质摩尔比,N/P比,乙醇浓度,流速比,透析条件 阅读提示:Section 2.3 siRNA-LNP制备 |
| 体外基因沉默 | HepG2细胞密度,siRNA剂量,处理时间,mRNA提取和分析方法 阅读提示:Section 2.6.2 mRNA敲低研究 |
| 细胞活力 | HepG2细胞密度,siRNA剂量,处理时间,检测方法 阅读提示:Section 2.6.4 细胞活力 |
| 免疫原性 | PBMC供体来源,siRNA剂量,处理时间,阳性对照 阅读提示:Section 2.6.5 趋化因子和细胞因子阵列 |
| 稳定性研究 | 储存温度,储存时间,取样时间点,检测方法 阅读提示:Section 2.7 稳定性研究 |