CAR-T细胞制备与碱基编辑
验证了碱基编辑能否高效破坏CD38表达,防止CAR38 T细胞自相残杀,并获得多种基因敲除的CAR-T产品。
从健康供体外周血单核细胞分离T细胞,用TransACT激活,用慢病毒载体转导CAR38或CAR19,并同时用BE3 mRNA和sgRNA进行碱基编辑,破坏CD38、TRBC、B2M、RFX5基因。
Allo-defensive, multiplex base-edited, anti-CD38 CAR T cells for 'off-the-shelf' immunotherapy
包含体外细胞功能验证(细胞毒性、细胞因子释放)、体外免疫逃逸验证(流式交叉配型、混合淋巴细胞反应)、体内异种移植小鼠模型验证(Daudi、Jurkat、MOLM14)等多层级证据,并有明确机制验证(CD38敲除防止自相残杀)。
NSG小鼠异种移植模型 Daudi细胞系 Jurkat细胞系 MOLM14细胞系
CD38碱基编辑效率(流式、Sanger测序) TCRαβ和HLA敲除效率(流式、磁珠去除) 效应细胞与靶细胞比例(体外细胞毒性实验) NSG小鼠肿瘤细胞接种数量(0.5x10^6 Daudi、1x10^7 Jurkat、1x10^5 MOLM14) CAR-T细胞注射时间和数量(第6天,2.5x10^6细胞)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证了碱基编辑能否高效破坏CD38表达,防止CAR38 T细胞自相残杀,并获得多种基因敲除的CAR-T产品。
从健康供体外周血单核细胞分离T细胞,用TransACT激活,用慢病毒载体转导CAR38或CAR19,并同时用BE3 mRNA和sgRNA进行碱基编辑,破坏CD38、TRBC、B2M、RFX5基因。
评估CD38敲除对CAR-T细胞产量、活化、细胞因子释放、代谢以及体外细胞毒性的影响。
通过流式细胞术、细胞因子微球阵列、Seahorse XF分析以及体外细胞毒性实验比较了CD38敲除和未敲除的CAR-T细胞(针对Daudi靶细胞)的表型和功能。
验证破坏HLA-I和HLA-II表达是否能阻断抗HLA抗体结合、减少同种异体刺激,以及CAR38能否清除CD38+的同种异体反应细胞。
通过流式交叉配型实验评估BE-CAR-T细胞与同种异体血清中抗HLA抗体的结合;通过混合淋巴细胞培养评估BE-CAR-T细胞对同种异体单核细胞的增殖反应的影响;通过共培养实验评估对CD38+NK细胞的杀伤。
评估'通用型'BE-CAR38-T细胞在异种移植小鼠模型中对不同血液肿瘤的体内抗肿瘤活性。
在NSG小鼠中分别接种Daudi、Jurkat和MOLM14细胞,随后在第6天静脉注射BE-CAR-T细胞或未修饰T细胞,通过生物发光成像监测肿瘤负荷并记录生存期。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| CAR-T细胞制备 | TransACT | Miltenyi Biotec | -- |
| TexMACS培养基 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 人重组白细胞介素-2 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 基因编辑 | 胞苷碱基编辑器-3 (BE3) mRNA | TriLink BioTechnologies | -- |
| 细胞去除 | 抗TCRαβ抗体(克隆BW242/412) | Miltenyi Biotec | -- |
| 抗HLA-ABC抗体(克隆REA230) | Miltenyi Biotec | -- | |
| 抗HLA-DR,DP,DQ抗体(克隆REA332) | Miltenyi Biotec | -- | |
| 混合淋巴细胞反应 | 3H-胸腺嘧啶 | Revvity | -- |
| 滤膜 | Revvity | -- | |
| 细胞收集器 | TOMTEC Imaging Systems | -- | |
| Meltilex | Revvity | -- | |
| MicroBeta计数器 | PerkinElmer | -- | |
| 流式交叉配型 | FACSLyric流式细胞仪 | BD | -- |
| 动物实验 | IVIS Lumina III成像系统 | PerkinElmer | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CAR-T细胞制备 | 激活试剂(TransACT)、培养基(TexMACS)、血清浓度(3%)、IL-2浓度(20 ng/mL) 阅读提示:Methods - Chimeric antigen receptor T-cell manufacture |
| 基因编辑与转导 | 碱基编辑器(BE3 mRNA)来源、慢病毒MOI(5)、sgRNA序列及编辑位点 阅读提示:Methods - Chimeric antigen receptor T-cell manufacture; Online Supplementary Methods |
| 体外细胞毒性实验 | 靶细胞(Daudi等)荧光标记、效应细胞与靶细胞比例、共培养时间(4小时) 阅读提示:Methods - Flow-based in vitro cytotoxicity assay |
| 混合淋巴细胞反应 | 照射剂量(30 Gy)、效应细胞与刺激细胞比例(1:1)、共培养时间(5天)、3H-胸腺嘧啶掺入时间 阅读提示:Methods - Mixed lymphocyte cultures |
| 体内实验 | 小鼠品系(NSG)、肿瘤细胞接种剂量(Daudi 0.5x10^6、Jurkat 1x10^7、MOLM14 1x10^5)、CAR-T细胞剂量(2.5x10^6)、处理时间(第6天) 阅读提示:Methods - In vivo chimeric antigen receptor T-cell studies |