整合多组学汇总数据识别重度抑郁症的候选分子机制

背景：重度抑郁症是最常见的精神疾病。尽管其具有显著的遗传成分，但其潜在的生物学机制仍未明确。我们的分析利用分子数量性状基因座（xQTL）数据来识别重度抑郁症的分子生物标志物。方法：我们使用OPERA（Omics Pleiotropic Association）软件，通过共享致病变异，利用全基因组关联研究汇总统计数据和血液及脑组织中5种表型的xQTL数据，识别与重度抑郁症相关的分子表型。xQTL表型包括基因表达、DNA甲基化、剪接变异、染色质可及性和蛋白质丰度。结果：我们在血液组织中识别出939个基因，在脑组织中识别出607个基因，这些基因通过至少一种分子表型与重度抑郁症相关。药物靶标在我们的两个组织的显著基因中均富集。共有23个基因通过3种或更多分子表型显示出关联，为其在重度抑郁症中的因果作用提供了有力证据，并提供了对其生物分子机制的见解。这些高优先级关联包括先前已通过重度抑郁症GWAS识别出的基因，如CDH13和RAB27B，以及新的关联，如H6PD。结论：我们的结果突出了生物标志物和药物靶标识别的有希望的新靶点，并成功扩展了GWAS发现，以识别与重度抑郁症的新关联。然而，我们的研究采用了使用批量脑和血液组织的广泛方法。未来的研究应将这些分析扩展到细胞和区域特异性环境中。