Srebp1c缺陷Tregs的表型和功能表征
评估Srebp1c缺失对Tregs免疫抑制功能的影响
从Srebp1c-KO和WT小鼠脾脏纯化CD4+CD25+ Tregs,与Tconv共培养检测抑制能力;在EAE和TNBS结肠炎模型中过继转移Tregs,监测疾病严重程度和免疫浸润。
SREBP1c modulates Treg immunobiology through a phospholipid-dependent adenosine pathway
包含体外抑制实验、EAE和结肠炎模型、代谢组学、脂质组学、转录组学及cPLA2α抑制挽救实验等多层级验证。
小鼠Srebp1c缺陷Tregs(CD4+CD25+FoxP3+) 体外诱导Tregs(iTregs) 实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型 TNBS诱导的结肠炎小鼠模型
Srebp1c-KO小鼠品系:B6;129S6-Srebf1tm1Mbr/J(JAX 004365) Tregs纯化:CD4+CD25+细胞通过EasySep试剂盒分离 iTreg分化条件:IL-2(100 U/mL)和TGF-β(5 ng/mL),4天 EAE诱导:MOG35-55肽段皮下注射,配合百日咳毒素(500 ng,第0和2天) cPLA2α抑制剂处理:pyrrophenone(10 nM)或MAFP(5 μM)处理3小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估Srebp1c缺失对Tregs免疫抑制功能的影响
从Srebp1c-KO和WT小鼠脾脏纯化CD4+CD25+ Tregs,与Tconv共培养检测抑制能力;在EAE和TNBS结肠炎模型中过继转移Tregs,监测疾病严重程度和免疫浸润。
探究Srebp1c缺失对体内Tregs数量、亚群和表面标志物表达的影响
通过流式细胞术分析外周血、脾脏、胸腺中Tregs频率和数量,检测CD25、FOXP3、CD73、PD-1等标志物表达,并进行体外迁移实验。
确定Srebp1c缺失对Tregs能量代谢的影响
通过靶向代谢组学、Seahorse代谢分析、葡萄糖/乳酸浓度测定以及同位素示踪技术,比较Srebp1c-KO和WT Tregs的代谢特征。
揭示Srebp1c缺失对Tregs转录组和脂质组的影响
对Srebp1c-KO和WT iTregs进行RNA-seq和脂质组学分析,鉴定了差异表达基因和差异脂质物种,尤其是磷脂类。
验证cPLA2α在Srebp1c缺陷Tregs表型中的驱动作用
用cPLA2α抑制剂(pyrrophenone或MAFP)处理Srebp1c-KO iTregs,检测CD73表达、腺苷水平、抑制功能和糖酵解活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞分离 | EasySep试剂盒 | STEMCELL Technologies | -- |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| Treg分化 | 白细胞介素-2 | -- | -- |
| 转化生长因子-β | -- | -- | |
| 流式细胞术 | LIVE/DEAD可固定Aqua死细胞染色试剂盒 | Invitrogen | -- |
| 羧基荧光素二醋酸盐琥珀酰亚胺酯 | Merk | -- | |
| 代谢分析 | Seahorse XFe24分析仪 | Agilent | -- |
| 寡霉素 | -- | -- | |
| 2-脱氧葡萄糖 | -- | -- | |
| 代谢组学 | API-4000三重四极杆质谱仪 | AB Sciex | -- |
| 高效液相色谱系统 | Agilent | -- | |
| 脂质组学 | Nexera X2超高效液相色谱系统 | Shimadzu | -- |
| 6500+ QTRAP系统 | AB SCIEX | -- | |
| RNA-seq | Monarch总RNA小提试剂盒 | New England Biolabs | -- |
| NextSeq 550测序仪 | Illumina | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶/磷酸酶抑制剂 | -- | -- | |
| Odyssey成像系统 | LICORbio | -- | |
| 药物处理 | 甲基花生四烯酰氟磷酸酯 | -- | -- |
| 依托莫昔 | -- | -- | |
| 代谢分析 | 棕榈酸 | -- | -- |
| EAE诱导 | MOG35-55肽 | -- | -- |
| 百日咳毒素 | -- | -- | |
| 完全弗氏佐剂 | -- | -- | |
| 腺苷定量 | 荧光定量试剂盒 | Cell Biolabs | -- |
| 细胞培养 | 抗CD3抗体 | eBioscience | -- |
| 抗CD28抗体 | eBioscience | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| Tregs纯化和鉴定 | CD4+CD25+细胞纯度,FoxP3表达确认 阅读提示:Methods: Tissue processing and Treg purification; Figure 1A |
| Srebp1c-KO小鼠模型 | 小鼠品系和基因型确认 阅读提示:Methods: Mice |
| iTreg分化 | IL-2和TGF-β浓度,分化时间,细胞密度 阅读提示:Methods: iTreg generation |
| EAE模型 | MOG35-55剂量,CFA配制,百日咳毒素用量和注射时间 阅读提示:Methods: EAE induction |
| TNBS结肠炎模型 | TNBS浓度,给药途径,Tregs过继转移时间和数量 阅读提示:Methods: TNBS-induced colitis model |
| 抑制实验 | 共培养比例,培养时间,CFSE染色浓度 阅读提示:Methods: Suppression and proliferation assays; Figure 1B |
| Seahorse代谢分析 | 细胞数量,培养基组成,药物注射浓度(寡霉素、2-DG、鱼藤酮/抗霉素A) 阅读提示:Methods: Seahorse metabolic analysis |
| 代谢组学 | 细胞数量,同位素标记葡萄糖浓度和孵育时间,质谱参数 阅读提示:Methods: Metabolomics; Supplemental Methods |
| 脂质组学 | 细胞数量,提取和检测方法,仪器参数 阅读提示:Methods: Liquid chromatography–electrospray ionization tandem mass spectrometry; Supplemental Methods |
| RNA-seq | RNA提取方法,测序平台,差异表达分析标准(log2FC > 0.5, adjusted P < 0.05) 阅读提示:Methods: RNA-seq; Statistics |
| Western blot | 抗体信息,蛋白上样量,内参 阅读提示:Methods: Western blotting; Supplemental Table 2 |