参与者招募与分组
收集C9orf72扩增携带者和健康对照的纵向影像及临床数据,并按临床阶段分组。
从UCSF记忆和衰老中心及ALLFTD研究招募82名C9携带者和107名健康对照,基于基线诊断分为aSxC9、proC9、SxC9和HC组。
Longitudinal functional network connectivity changes across the clinical stages of C9orf72 hexanucleotide repeat expansion carriers
包含横断面和纵向影像分析,涉及多组人群(无症状、前驱、症状性携带者和健康对照),并通过NfL和症状严重度进行关联验证,但缺乏体外或动物模型等机制验证。
无症状C9orf72扩增携带者(aSxC9) 前驱期C9orf72扩增携带者(proC9) 症状性C9orf72扩增携带者(SxC9) 健康对照(HC)
参与者分为无症状、前驱、症状性三组,基于基线临床诊断 影像数据采集:3T MRI,包含T1加权和静息态fMRI 纵向随访时间:平均约2年(范围未明确)、多次随访 NfL测量:使用Simoa NF-light Advantage Kit在SiMoA HD-X分析仪上检测 统计阈值:体素水平p<0.05,簇水平FWE校正p<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
收集C9orf72扩增携带者和健康对照的纵向影像及临床数据,并按临床阶段分组。
从UCSF记忆和衰老中心及ALLFTD研究招募82名C9携带者和107名健康对照,基于基线诊断分为aSxC9、proC9、SxC9和HC组。
获取结构性MRI和静息态fMRI数据,用于后续分析。
每个参与者进行3T MRI扫描,包括T1加权结构和T2*加权EPI静息态fMRI。
评估各组纵向灰质体积变化。
使用SPM12进行纵向VBM分析,灰质图分割、配准、调制和平滑,并根据Brainnetome图谱分成246个ROI,应用ComBat协调多站点数据,用LME模型检验纵向变化。
评估静息态功能网络(SN、SMN、DMN、MPN)的横断面和纵向连接变化。
使用fMRIPrep预处理,基于种子点(4mm半径球)计算全脑体素时间序列的相关性,生成网络连接图,应用ComBat协调,通过GLM和LME模型分析组间差异和纵向变化。
探讨基线NfL和症状严重程度与纵向连接和灰质变化的关系。
使用LME模型,分别分析aC9和proC9/SxC9中基线log(NfL)与纵向连接/灰质变化的关系,以及基线CDR plus NACC FTLD总分与纵向连接变化的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| MRI数据采集 | 3T MRI扫描仪 | -- | -- |
| 数据预处理与统计分析 | SPM12 | Wellcome Trust Centre for Neuroimaging | -- |
| MATLAB | MathWorks | -- | |
| fMRI预处理 | fMRIPrep | -- | -- |
| ANTs | -- | -- | |
| FSL | -- | -- | |
| FreeSurfer | -- | -- | |
| AFNI | -- | -- | |
| NfL测量 | Simoa NF-light试剂盒 | Quanterix | -- |
| SiMoA HD-X分析仪 | Quanterix | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 参与者分组 | 临床诊断标准,C9orf72扩增定义(重复>40-50次),排除MAPT/GRN变异,HC的认知正常标准 阅读提示:Methods:2.1 Participants |
| 影像采集 | MRI扫描仪型号,T1和fMRI序列参数,静息态时长,质量控制标准(FD<0.5mm) 阅读提示:Methods:2.3 Image acquisition |
| 灰质体积分析 | VBM预处理步骤,Brainnetome图谱,ComBat协调参数,统计模型设置(LME固定和随机效应) 阅读提示:Methods:2.4 Voxel-based morphometry analysis |
| 功能连接分析 | fMRI预处理细节,种子点坐标,网络掩膜定义,ComBat协调,统计模型(GLM和LME) 阅读提示:Methods:2.5 Functional imaging analysis |
| NfL测量和关联分析 | NfL检测试剂盒和仪器,样本量,统计模型(LME) 阅读提示:Methods:2.6 Longitudinal changes associated with NfL concentrations |