RIF患者子宫内膜的转录组和甲基化组分析
鉴定RIF中与蜕膜化相关的差异表达基因和蛋白精氨酸甲基化变化。
对正常生育女性(FER)和RIF患者的子宫内膜活检样本进行RNA-seq和Alstra-DIA甲基化蛋白质组学分析,并通过免疫印迹和免疫荧光验证SDMA、PRMT5等表达。
Targeting the PRMT5-Nur77 methylation axis enhances endometrial decidualization capacity and female fertility in preclinical models
包含人子宫内膜转录组及甲基化组分析、PRMT5条件敲除小鼠和PRMT5抑制剂模型的体内功能验证、人EnSCs体外功能及机制验证(IP-MS、CUT&Tag等),以及RIF患者样本和队列的临床相关性分析。
人子宫内膜基质细胞(EnSCs)原代培养 子宫基质特异性Prmt5敲除小鼠(Prmt5d/d) PRMT5抑制剂GSK591处理的ICR小鼠模型 RIF患者子宫内膜活检样本及原代EnSCs
子宫内膜标本的取材时机(LH+2至LH+11) Prmt5d/d小鼠的子宫基质特异性敲除效率(Amhr2-Cre) GSK591的给药时间(D5-D7)和剂量 Pep-Nur77R346K的给药途径(宫内灌注)和次数 RIF患者队列的纳入标准和样本量(n=114)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定RIF中与蜕膜化相关的差异表达基因和蛋白精氨酸甲基化变化。
对正常生育女性(FER)和RIF患者的子宫内膜活检样本进行RNA-seq和Alstra-DIA甲基化蛋白质组学分析,并通过免疫印迹和免疫荧光验证SDMA、PRMT5等表达。
验证PRMT5在体内对子宫内膜蜕膜化和胚胎着床的功能。
使用Amhr2-Cre小鼠与Prmt5fl/fl小鼠交配获得Prmt5d/d小鼠,观察其生育力、着床点和蜕膜化标志物表达,并进行人工蜕膜化实验。
验证PRMT5的甲基化酶活性对子宫内膜蜕膜化的必要性。
给ICR小鼠在胚胎着床后(D5-D7)腹腔注射GSK591,并在人工蜕膜化模型中处理,观察蜕膜化反应和胚胎吸收情况。
研究PRMT5及其底物Nur77在人类EnSCs蜕膜化过程中的分子机制。
分离原代人EnSCs,用MPA和cAMP诱导蜕膜化,通过腺病毒敲低PRMT5或Nur77,检测蜕膜化标志物、细胞形态和滋养层球体侵入能力,并进行转录组、CUT&Tag和蛋白质组学分析。
确定PRMT5在蜕膜化中的关键底物及其甲基化位点。
通过免疫沉淀-质谱(IP-MS)和SDMA甲基化蛋白质组学鉴定PRMT5相互作用蛋白和SDMA底物,预测并验证Nur77的甲基化位点,体外甲基化实验和特异性抗体确认R346位点。
验证设计的多肽Pep-Nur77R346K能否恢复PRMT5缺陷导致的蜕膜化损伤。
将Pep-Nur77R346K和对照肽Pep-Nur77WT处理PRMT5敲低的人EnSCs和小鼠模型,检测蜕膜化标志物、Nur77修饰状态、滋养层侵入能力以及体内着床恢复情况。
评估子宫内膜PRMT5/Nur77-R346me2s水平与RIF及妊娠结局的关系。
对RIF和对照子宫内膜进行免疫荧光和蛋白印迹分析,在更大的回顾性队列中验证PRMT5、Nur77和Nur77-R346me2s水平,并通过逻辑回归和ROC曲线评估其预测价值。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM-F12培养基 | -- | -- |
| 蛋白质印迹 | SDMA抗体 | -- | -- |
| ADMA抗体 | -- | -- | |
| MMA抗体 | -- | -- | |
| PRMT5抗体 | -- | -- | |
| Nur77抗体 | -- | -- | |
| Nur77-R346me2s抗体 | ABclonal | -- | |
| pNur77-S351抗体 | -- | -- | |
| IGFBP1抗体 | -- | -- | |
| ELISA | PRL ELISA试剂盒 | -- | -- |
| 小鼠模型 | GSK591 | -- | -- |
| 芝加哥蓝 | -- | -- | |
| 蛋白纯化 | PTMScan SDMA基序富集试剂盒 | Cell Signaling Technology | -- |
| 蛋白质组学 | Alstra-DIA质谱 | -- | -- |
| 遗传操作 | Amhr2-Cre小鼠 | -- | -- |
| Pgr-Cre小鼠 | -- | -- | |
| Ltf-iCre小鼠 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人类子宫内膜样本收集 | 样本来源、RIF诊断标准、取材时间点(LH+2至LH+11) 阅读提示:Methods: Human endometrial sampling |
| 小鼠模型 | 小鼠品系(Prmt5d/d, ICR)、基因敲除策略(Amhr2-Cre)、GSK591剂量和给药时间 阅读提示:Methods: Mice and treatment; Results: Figure 2 |
| 人EnSC培养和蜕膜化诱导 | EnSC分离方法、培养条件、MPA和cAMP浓度、处理时间(0-72h) 阅读提示:Supplemental Methods; Results: Figure 3 |
| PRMT5敲低和Nur77突变实验 | 腺病毒shRNA序列、转染效率、Nur77突变体(R346K)、PRMT5过表达 阅读提示:Supplemental Methods; Results: Figures 4-5 |
| 肽处理实验 | 肽序列、浓度(10 μM)、给药方式(宫内灌注)、给药时间点(着床前) 阅读提示:Methods: Peptides; Results: Figures 6-7 |
| 临床队列分析 | 队列样本量(n=114)、RIF定义(≥3次失败)、Western blot半定量方法、统计模型 阅读提示:Methods: Human endometrial sampling; Results: Figure 8 |