患者筛选与样本收集
识别疑似自身免疫性脑炎且已知抗神经元抗体阴性的患者,并收集血清和脑脊液样本。
从2017至2021年在德国波恩大学医院癫痫科就诊的387例患者中纳入符合标准的血清样本,并进行已知抗神经元抗体筛查。
Pyruvate dehydrogenase autoantibodies in autoantibody-negative patients with seizures are associated with reduced pyruvate dehydrogenase activity
研究包含患者样本筛选、免疫沉淀质谱鉴定、免疫印迹验证、免疫组化、原代神经元摄取与活力实验、酶活性测定及mtDNA检测等多层级验证。
小鼠原代海马神经元 小鼠脑组织切片 HEK 293细胞来源线粒体 患者血清及脑脊液样本
患者队列387例,纳入标准为疑似AIE伴精神症状或癫痫发作,且已知抗神经元抗体阴性 抗PDH抗体阳性患者12例,抗体滴度1:100至1:250,000 原代神经元摄取实验中,20μg/mL抗PDH E1抗体孵育4-24小时 酶活性测定使用5μL分离线粒体,患者CSF稀释度1:2 神经元活力测定在DIV4转导hSyn-GFP后,孵育4及24小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
识别疑似自身免疫性脑炎且已知抗神经元抗体阴性的患者,并收集血清和脑脊液样本。
从2017至2021年在德国波恩大学医院癫痫科就诊的387例患者中纳入符合标准的血清样本,并进行已知抗神经元抗体筛查。
确定患者血清中未知抗体的靶向抗原。
对55例筛选阳性样本进行免疫沉淀和质谱分析,鉴定出PDHc的三个亚基(E1α、E2、E3)为靶点,并在387例队列中通过免疫印迹验证。
证实患者来源的抗PDH抗体能够结合神经元并定位于线粒体。
通过免疫组织化学和免疫细胞化学,检测患者血清对小鼠脑切片和原代海马神经元的结合,并使用MitoTracker确认线粒体定位。
评估抗PDH抗体能否进入活神经元并产生毒性效应。
将活的原代海马神经元与商业抗PDH抗体共孵育,检测神经元摄取和活力变化。
检验抗PDH抗体是否影响PDH酶催化活性。
从HEK 293细胞分离线粒体,与商业抗体或患者CSF孵育,使用PDH Activity Assay Kit测定酶活性。
评估抗PDH抗体阳性患者是否存在线粒体应激或细胞死亡。
使用qPCR定量患者血清和CSF中线粒体DNA D-loop片段拷贝数。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 抗体筛选 | Neurobasal培养基 | -- | -- |
| Roti-Blue 5x染色液 | Roth | A152.1 | |
| Western blot验证 | 猪心PDH | Sigma-Aldrich | P7032-10U |
| 免疫组织化学 | DAPI染色液 | Sigma-Aldrich | D9542 |
| 酶活性测定 | PDH活性检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | MAK183-1KT |
| 蛋白酶抑制剂 | Roche | 5892791001 | |
| qPCR | QiAamp DNA Mini和Blood Mini试剂盒 | QIAGEN | -- |
| iTaq Universal Probes Supermix | Bio-Rad | -- | |
| CFX qPCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| 统计学分析 | GraphPad Prism 10.0.02 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者筛选 | 纳入标准:临床疑似AIE、已知抗神经元抗体阴性、WB中存在<110kDa额外条带;患者队列387例。 阅读提示:Methods 2.1 Human samples |
| 抗体靶点鉴定 | 免疫沉淀使用全鼠脑组织,两个重复;质谱分析样本与对照丰度比。 阅读提示:Methods 2.3 Immunoprecipitation and mass spectrometry |
| 神经元结合实验 | 脑切片:C57Bl/6N成年小鼠,4μm切片;原代神经元:E15-19海马,DIV14固定;患者血清稀释度1:100。 阅读提示:Methods 2.5 Immunohistochemistry on mouse brain slices; 2.7 Immunocytochemistry on murine PHNs |
| 神经元摄取和活力实验 | 抗体浓度20μg/mL;孵育时间4h、8h、24h、48h;活力测定在DIV4转导hSyn-GFP。 阅读提示:Methods 2.8 Anti-PDH antibody uptake and neuronal viability assays |
| 酶活性测定 | 线粒体分离自HEK 293细胞;商业抗体浓度10μg/μL;患者CSF稀释度1:2;使用5μL线粒体。 阅读提示:Methods 2.9 Enzyme assay |
| mtDNA定量 | 用QiAamp Kit提取DNA;qPCR引物和探针序列;扩增条件95°C 15min,55个循环。 阅读提示:Methods 2.10 Quantitative polymerase chain reaction |