成人癫痫患者术前基因检测的诊断率低

目的：确定接受癫痫术前评估的患者基因检测的诊断率。方法：我们进行了一项队列研究，包括2019年至2023年间在卡尔加里癫痫项目接受术前评估的115名成人患者，这些患者均接受了研究性外显子组测序。应用了一个包含765个在线人类孟德尔遗传（OMIM）列出的癫痫相关基因的精选癫痫基因面板。变异根据美国医学遗传学与基因组学学会指南进行分类，并评估其临床相关性和与术后结局的关联。结果：在4名个体（3.5%，4/115）中分别鉴定出DEPDC5、NPRL2、KCNT2和PRRT2的致病性或可能致病性变异。所有变异均符合严格的质量标准，具有高致病性评分（Combined Annotation Dependent Depletion (CADD) 34–37），并且在gnomAD v4.1中人群频率缺失或极低。这些患者均无智力障碍，只有一名患者（PRRT2）有阳性家族史。携带KCNT2变异的患者接受了癫痫手术，结局良好（Engel分级ID）。意义：该术前队列表明，在成人癫痫手术候选者中，基因检测的诊断率较低。然而，四名携带（可能）致病性变异的患者中有三名没有提示临床基因检测的特征，表明在许多司法管辖区，根据典型的临床基因检测标准，他们的基因诊断会被遗漏。