整合素表达谱分析
比较正常胃黏膜细胞和胃癌细胞的整合素表达差异,以验证肿瘤细胞是否丢失EMILIN-1受体
通过流式细胞术分析GES-1和AGS细胞中多种整合素亚基的表达。
Loss of EMILIN-1/integrin axis drives microenvironmental reprogramming in gastric tumorigenesis
包含体外细胞实验(增殖、粘附、管形成、迁移、克隆形成)、CRISPR-Cas9基因敲除、基因修饰小鼠模型(E955A-KI)、人胃发育不良组织分析及生存分析等多个独立证据层级,并进行功能与机制验证。
GES-1胃黏膜细胞系 AGS、Hs746T、NCI-N87胃癌细胞系 Bj-5ta成纤维细胞系及EMILIN-1敲除克隆 Emilin1-E955A敲入小鼠模型
α4整合素在GES-1细胞中表达,在AGS等胃癌细胞系中缺失 使用条件培养基模拟肿瘤-基质细胞相互作用 CRISPR-Cas9介导的EMILIN-1敲除Bj-5ta成纤维细胞 Tamoxifen或DMP-777处理诱导胃黏膜损伤 人胃发育不良组织EMILIN-1免疫组化染色
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较正常胃黏膜细胞和胃癌细胞的整合素表达差异,以验证肿瘤细胞是否丢失EMILIN-1受体
通过流式细胞术分析GES-1和AGS细胞中多种整合素亚基的表达。
验证EMILIN-1/α4β1整合素相互作用对细胞粘附和增殖的影响
使用CAFCA和xCELLigence系统检测细胞对gC1q的粘附和增殖反应,并在AGS细胞中过表达α4整合素进行回补实验。
研究胃癌细胞是否通过旁分泌信号影响基质细胞中EMILIN-1的表达
用胃癌细胞条件培养基处理成纤维细胞和淋巴内皮细胞,检测EMILIN-1 mRNA和蛋白水平变化。
验证EMILIN-1缺失是否足以驱动成纤维细胞向CAF样表型转化并促进肿瘤进展
使用CRISPR-Cas9在Bj-5ta细胞中敲除EMILIN-1,分析α-SMA表达、信号通路激活及对胃癌细胞迁移、克隆形成和球体侵袭的影响。
验证EMILIN-1功能缺失对胃黏膜癌前病变易感性的影响
对E955A-KI小鼠和WT小鼠进行Tamoxifen或DMP-777处理,评估胃黏膜病变严重程度和α-SMA表达。
评估EMILIN-1在人类胃发育不良组织中的表达及其临床相关性
对人胃发育不良和正常黏膜组织进行EMILIN-1、α-SMA和α9整合素的免疫组化染色,并分析生存数据。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI培养基 | -- | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| F-12K培养基 | -- | -- | |
| EBM™-2 + EGM™-2 MV BulletKit™ | Lonza | -- | |
| 潮霉素B | Invitrogen | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞转染 | FuGENE HD转染试剂 | Promega | -- |
| G418 | -- | -- | |
| RNA提取 | NucleoSpin RNA II提取试剂盒 | MachereyNagel | -- |
| RT-PCR | iQ SYBRGreen荧光染料 | Bio-Rad | -- |
| CFX96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| CRISPR/Cas9 | pLV hUbC-Cas9-T2A-GFP载体 | AddGene | -- |
| FACS分析 | PE标记的抗整合素抗体 | Biolegend | -- |
| APC标记的抗α3整合素抗体 | Biolegend | -- | |
| LSRFortessa X-20流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 细胞分选 | BD FACSAria™ III流式细胞分选仪 | BD Biosciences | -- |
| 细胞粘附实验 | 钙黄绿素AM | -- | -- |
| Infinite M1000多功能酶标仪 | TECAN | -- | |
| 细胞粘附与增殖实验 | xCELLigence RTCA单板系统 | Agilent | -- |
| E-plate VIEW 96板 | Acea Bioscience | -- | |
| 管形成实验 | Cultrex® BME基质胶 | Trevigen | -- |
| Leica AF6000LX显微镜 | Leica | -- | |
| 免疫组化 | UltraVision LP检测系统HRP DAB试剂盒 | Thermo Scientific | -- |
| As556兔多克隆抗体 | -- | -- | |
| 动物实验 | 他莫昔芬 | -- | 10540-29-1 |
| DMP-777 | DBA Italia | -- | |
| Western blot | HRP标记的二抗 | Bethyl | -- |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor荧光染料偶联物 | Invitrogen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系培养条件 | 细胞系来源、培养基类型、血清浓度、添加物 阅读提示:Materials and methods: Cell cultures |
| 条件培养基实验 | 条件培养基制备方法、处理细胞类型、处理时间(72小时) 阅读提示:Figure 2 legend |
| EMILIN-1敲除实验 | CRISPR-Cas9靶点、载体、细胞系 阅读提示:Materials and methods: CRISPR/Cas9 system |
| 动物模型 | 小鼠品系、基因型、药物剂量(Tamoxifen 350 mg/kg, DMP-777 350 mg/kg)、给药方式、给药时间 阅读提示:Materials and methods: Animals and in vivo procedures |
| 免疫组化分析 | 抗体、抗原修复方法、评分系统(H-score、α-SMA评分) 阅读提示:Materials and methods: Immunostaining |