观察卒中后小胶质细胞脂噬的动态变化
确定缺血性卒中后小胶质细胞脂噬是否持续受损
在PTI后1、3、7、14、21天,通过免疫荧光共染PLIN2与Iba-1/GFAP、PLIN2与p62,以及透射电镜观察脂滴和脂褐素,评估小胶质细胞脂噬状态。
Microglial IRF7-induced lipophagy impairment aggravates lipid droplet overload and impedes neurological recovery after ischemic stroke
包含光栓模型、dMCAO模型、scRNA-seq数据重分析、体外BV2和原代小胶质细胞、Irf7 cKO小鼠、Gnai2敲低、ChIP-qPCR及功能行为学验证。
小鼠光栓性缺血(PTI)模型 15月龄小鼠远端大脑中动脉闭塞(dMCAO)模型 BV2小胶质细胞系 原代小胶质细胞
PTI模型:Rose Bengal 100 mg/kg腹腔注射,冷光源照射20分钟,位置为前囟外侧1.5mm Irf7 cKO小鼠由Irf7fl/fl与Cx3cr1-Cre杂交获得 LPS处理:1000 ng/mL,24小时 siRNA转染:50 nM Irf7 siRNA或Gnai2 siRNA处理48小时 C-176:12.2 mg/kg腹腔注射,PTI后第3天开始,隔日一次至第14天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定缺血性卒中后小胶质细胞脂噬是否持续受损
在PTI后1、3、7、14、21天,通过免疫荧光共染PLIN2与Iba-1/GFAP、PLIN2与p62,以及透射电镜观察脂滴和脂褐素,评估小胶质细胞脂噬状态。
探索IRF7与自噬和脂质代谢的关联
对两个公开的scRNA-seq数据集(GSE261494、GSE225948)进行重分析,将微胶质细胞分亚群,比较Irf7高表达亚群与低表达亚群的差异表达基因并进行GO富集分析。
验证小胶质细胞IRF7是否加重脂噬损伤和脂滴积聚
使用Irf7 cKO小鼠和对照小鼠,在PTI后14天通过免疫荧光和电镜评估脂滴积聚和脂噬状态。
验证小胶质细胞IRF7是否影响突触可塑性和运动功能恢复
通过Golgi-Cox染色评估树突长度、分支数和棘密度,通过步态分析评估运动功能,并测量梗死体积。
在细胞水平验证IRF7对脂噬和脂滴积聚的作用
在BV2细胞和原代小胶质细胞中使用siRNA敲低Irf7,用LPS刺激,通过BODIPY染色、p62共定位、mCherry-EGFP-PLIN2串联荧光、透射电镜评估脂滴和脂噬。
确定IRF7调控脂噬的下游机制
通过scRNA-seq数据中IRF7相关基因的KEGG富集,结合ChIP-qPCR验证IRF7与Gnai2启动子结合,并在BV2细胞中敲低Gnai2观察对脂噬和PC水平的影响。
评估延迟给予STING抑制剂C-176是否改善脂噬损伤和功能恢复
在不同时间点(1、3、7天)开始给予C-176,隔日一次至14天,通过步态分析、免疫荧光、电镜、western blot等评估。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型建立 | 玫瑰红 | Sigma | 330000 |
| 冷光源 | OPLENIC | -- | |
| 药物处理 | 三嗪C | MedChemExpress | HY-N6707 |
| CDP-胆碱 | MedChemExpress | HY-B0739 | |
| C-176 | MedChemExpress | HY-112906 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| MEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶-EDTA | -- | -- | |
| 细胞处理 | 脂多糖 | Sigma | L2630 |
| 雷帕霉素 | MedChemExpress | HY-10219 | |
| siRNA转染 | riboFECT CP转染试剂盒 | RiboBio | C10511 |
| 细胞处理 | mCherry-EGFP-LC3腺病毒 | HANBIO | HBAD-1006 |
| 脂滴染色 | BODIPY 493/503 | Thermo Fisher Scientific | D3922 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Boster | AR0102 |
| 磷酸酶抑制剂 | Boster | AR1183 | |
| ECL化学发光试剂 | MeilunBio | MA0186 | |
| 免疫荧光 | DAPI溶液 | Boster | AR1176 |
| 抗荧光淬灭剂 | Boster | AR1109 | |
| RT-qPCR | RNA提取试剂盒 | Sangon | B5113121 |
| 逆转录试剂盒 | ABclonal | RK20433 | |
| SYBR Green预混液 | Yeasen | 11184ES08 | |
| CFX96实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| Western blot | ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- |
| 免疫荧光 | TissueFAXS Spectra成像系统 | TissueGnostics | -- |
| 共聚焦显微镜FV3000 | Olympus | -- | |
| 透射电镜 | 透射电子显微镜JEM-1400FLASH | JEOL | -- |
| 步态分析 | DigiGait成像系统 | Mouse Specifics | -- |
| 梗死体积测量 | 冰冻切片机CM1950 | Leica | -- |
| 光学显微镜DM2500 | Leica | -- | |
| PC测定 | 磷脂酰胆碱比色法检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K796-M |
| ChIP | SimpleChIP酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9003 |
| 抗IRF7抗体 | Sigma-Aldrich | ABF130 | |
| 激光多普勒血流仪 | 激光多普勒血流仪RFLSI Ⅲ | RWD | -- |
| Golgi-Cox染色 | FD快速高尔基染色试剂盒 | FD Neuro Technologies | PK401 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PTI模型 | Rose Bengal剂量100 mg/kg、光照强度26000 lx、光照时间20min、位置前囟外侧1.5mm 阅读提示:Materials and methods: Photothrombotic ischemia (PTI) model |
| Irf7条件性敲除小鼠 | Irf7fl/fl与Cx3cr1-Cre杂交,基因分型方法 阅读提示:Materials and methods: Animals; Supplementary Fig. S1 |
| 细胞处理 | LPS浓度1000 ng/mL、处理24h;C-176预处理1µM 30min;siRNA转染50 nM 48h 阅读提示:Materials and methods: Cell treatment; siRNA transfection |
| 药物处理 | TrC 10µM 鼻内给药、CDP-choline 100 mg/kg 腹腔、C-176 12.2 mg/kg 腹腔;给药方案均从PTI后第3天开始,隔日一次至第14天 阅读提示:Materials and methods: Drug administration |
| 脂噬评估 | PLIN2和p62共定位体积、透射电镜观察游离脂滴面积和脂褐素面积 阅读提示:Results: Sustained microglial lipophagy impairment following ischemic stroke; Figure 1 |
| 功能评估 | 步态分析参数(步频、步长等)及神经功能缺损评分 阅读提示:Materials and methods: Gait test; Neurological deficit score |