肿瘤栓子培养模型生成
模拟体内淋巴管环境以生成肿瘤栓子,用于后续分子分析。
使用SUM149细胞系在超低附着板中培养,培养基加入PEG-8000,置于旋转平台,培养0-10天。
Multiscale modeling uncovers macrophage infiltration and TNF-α signaling networks for targeting in inflammatory breast cancer tumor emboli
本研究包含体外3D肿瘤栓子培养、转录组/蛋白质组分析、患者样本空间免疫表型分析、转基因小鼠活体成像及药物干预等多个独立证据层级,并进行功能验证。
SUM149细胞系 SUM149 3D肿瘤栓子培养 CX3cr1GFP小鼠模型 IBC患者样本
3D肿瘤栓子培养条件,包括培养基、PEG-8000浓度2.25%、细胞接种密度10K、培养时间0-10天 Birinapant处理浓度1000 nM,处理时间3天(体外)或4小时(体内) 患者样本免疫组化中抗体克隆和稀释度,如CD163 (MRQ-26, Ready-to-Use) CX3cr1GFP小鼠模型的构建,包括与裸鼠品系007850杂交 体内实验的细胞植入数量和窗口腔室手术细节
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟体内淋巴管环境以生成肿瘤栓子,用于后续分子分析。
使用SUM149细胞系在超低附着板中培养,培养基加入PEG-8000,置于旋转平台,培养0-10天。
比较3D肿瘤栓子与2D单层培养的基因和蛋白表达差异,揭示肿瘤栓子特征。
提取RNA和蛋白质进行测序和表达分析,鉴定差异表达基因和蛋白。
评估IBC患者肿瘤栓子中免疫细胞浸润情况。
对24例IBC患者样本进行CD8、CD79α、FOXP3和CD163免疫组化染色,使用图像分析算法定量。
动态观察肿瘤栓子植入后巨噬细胞的募集行为。
将肿瘤栓子细胞植入CX3cr1GFP小鼠的窗口腔室,通过活体成像监测GFP标记的巨噬细胞和RFP标记的肿瘤细胞。
验证Birinapant靶向TNF-α信号能否抑制肿瘤栓子驱动的肿瘤进展。
用Birinapant预处理肿瘤细胞后植入小鼠,成像监测肿瘤生长和巨噬细胞浸润。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Ham's F-12培养基 | Mediatech Inc. | -- |
| 胎牛血清 | Atlanta Biologicals | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 抗生素/抗真菌剂 | -- | -- | |
| 氢化可的松 | Invitrogen | -- | |
| 胰岛素 | Gibco | -- | |
| 肿瘤栓子培养 | 聚乙二醇8000 | Sigma | -- |
| Birinapant | APExBIO | -- | |
| 细胞培养 | 超低吸附24孔板 | Corning | -- |
| 免疫组化 | CD163抗体 | Ventana | 760-4437 |
| CD8抗体 | Dako | M7103 | |
| CD79α抗体 | Dako | M7050 | |
| FOXP3抗体 | eBioscience | 14-447 | |
| 活体成像 | EVOS M7000显微镜 | ThermoFisher | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 肿瘤栓子培养 | 细胞接种量、PEG-8000浓度、培养时间、旋转平台条件 阅读提示:Methods 2.5 Tumor emboli organoid platform |
| 药物处理 | Birinapant浓度、处理时间 阅读提示:Methods 2.5和2.8 |
| 活体成像 | 细胞植入量、窗口腔室手术细节、成像时间点 阅读提示:Methods 2.8 Implantation of cells in the window chamber surgical model and intravital imaging |
| 空间免疫表型分析 | 患者样本数量、抗体克隆和稀释度、图像分析算法 阅读提示:Methods 2.3 Spatial analysis of patient samples |