建立感染模型并评估组织分布
验证Bb在小鼠体内的定植和传播
C57BL/6小鼠感染cN40 Bb,30天后处死,通过qPCR检测各组织中Bb DNA拷贝数。
Borrelia burgdorferi disrupts gut barrier functions and microbiota-antibody interactions
包括小鼠感染模型(SPF和悉生)、肠道通透性检测、血清标志物测定、16S rRNA测序、ELISpot和流式细胞术、人体队列样本验证等多层级实验证据。
C57BL/6小鼠 悉生(Germ-free)Swiss Webster小鼠 急性莱姆病患者队列
小鼠品系和感染剂量 FITC-dextran灌胃剂量及检测时间点 血清LBP和IFABP检测时间点 人血清样本采集时间点 16S rRNA测序分析方法
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Bb在小鼠体内的定植和传播
C57BL/6小鼠感染cN40 Bb,30天后处死,通过qPCR检测各组织中Bb DNA拷贝数。
评估Bb感染是否引起肠道炎症和组织损伤
通过H&E染色对肠道组织进行病理评分,重点关注小肠、盲肠和结肠。
确定Bb感染是否导致肠道屏障功能受损
通过灌胃FITC-dextran,检测血清中FITC-dextran浓度来评估肠道通透性。
评估全身性炎症和内毒素血症
通过ELISA检测血清中内毒素、LBP、IFABP、sCD14等标志物。
确定Bb感染对肠道B细胞和抗体产生的影响
通过流式细胞术分析肠系膜淋巴结和Peyer's patches中的GC B细胞,通过ELISpot检测IgA和IgG ASC,通过ELISA检测血清总IgA和IgG。
确定Bb感染是否改变肠道微生物群
对粪便样本进行16S rRNA测序并分析SCFA。
确定Bb感染是否影响抗体对肠道微生物的识别
通过流式细胞术检测粪便微生物的IgA和IgG包被,并进行IgA结合试验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养和感染 | RPMI培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 分子检测 | RNeasy小型试剂盒 | QIAGEN | -- |
| DNeasy试剂盒 | Qiagen | -- | |
| 蛋白质印迹 | 抗小鼠CD45抗体 | Proteintech | -- |
| 组织学 | E-钙黏蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | -- |
| 血清生物标志物检测 | 小鼠LBP试剂盒 | Abcam | -- |
| 人LBP试剂盒 | Abcam | -- | |
| 小鼠FABP2/IFABP试剂盒 | Bio-Techne | -- | |
| 人FABP2/IFABP试剂盒 | Bio-Techne | -- | |
| Pierce显色内毒素定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 流式细胞术 | 抗CD19-BV786抗体 | BD Horizon | 563333 |
| 抗CD45R-BUV661抗体 | BD Horizon | 612972 | |
| 抗CD38-PE-CF594抗体 | BioLegend | 102730 | |
| 抗CD24-BV711抗体 | BD Biosciences | 563450 | |
| 可固定死活染料近红外 | Thermo Fisher Scientific | L34994 | |
| FlowJo软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠感染 | C57BL/6J雌性小鼠,6-8周龄,感染方式为皮内注射宿主适应的螺旋体 阅读提示:Materials and methods: Mice and infection |
| 肠道通透性检测 | FITC-dextran灌胃剂量80 mg/ml,150 μl,灌胃后4小时采血 阅读提示:Materials and methods: FITC-dextran assay |
| 血清标志物检测 | 检测时间点:小鼠7-45dpi,人类visit 1和6个月随访 阅读提示:Materials and methods: Serum biomarker measurements |
| 16S rRNA测序 | 粪便样本采集时间点:0,29,84/85 dpi,每组12只小鼠 阅读提示:Materials and methods: 16S rRNA sequencing and analysis |
| 临床样本 | 20例早期莱姆病患者和20例年龄性别匹配的健康对照 阅读提示:Materials and methods: Human subjects |