验证TRAF2缺失对蛋白聚集的影响
探究TRAF2介导的线粒体自噬是否在基础条件下清除蛋白聚集体
使用TRAF2icKO小鼠和TRAF2缺失的hiPSC-CMs,通过生化分级、免疫印迹和超分辨成像检测蛋白聚集标记物(p62、多聚泛素化蛋白)和DESMIN定位。
Mitophagy Facilitates Cytosolic Proteostasis to Preserve Cardiac Function
包含小鼠模型、细胞模型、线粒体提取物的体外实验,并通过TRAF2和PARKIN的功能获得和丧失验证线粒体自噬在蛋白聚集体清除中的作用。
TRAF2icKO小鼠 R120G-CRYAB转基因小鼠(R120G-TG) 人诱导多能干细胞来源的心肌细胞(hiPSC-CMs) HEK293细胞
心肌细胞特异性TRAF2消融(TRAF2icKO)及其对线粒体自噬的影响 R120G-CRYAB突变蛋白在心肌细胞中的线粒体定位及其对线粒体膜电位和HSC70的依赖性 AAV9介导的TRAF2或PARKIN过表达对R120G-TG小鼠心脏功能和存活率的影响 Traf2单倍剂量不足(R120G TRAF2-icHET)对R120G-TG小鼠死亡率的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究TRAF2介导的线粒体自噬是否在基础条件下清除蛋白聚集体
使用TRAF2icKO小鼠和TRAF2缺失的hiPSC-CMs,通过生化分级、免疫印迹和超分辨成像检测蛋白聚集标记物(p62、多聚泛素化蛋白)和DESMIN定位。
测试易聚集蛋白(R120G-CRYAB和P209L-BAG3)是否被线粒体摄取
分离线粒体并与表达GFP标记的R120G-CRYAB或P209L-BAG3的细胞裂解液共孵育,使用digitonin去除外膜以生成线粒体质体,检测蛋白是否进入基质。
测试外源TRAF2或PARKIN过表达是否减少蛋白聚集体并恢复肌节结构
在TRAF2缺失或R120G-CRYAB突变的hiPSC-CMs中,使用腺病毒过表达TRAF2或PARKIN,检测多聚泛素化蛋白水平、线粒体自噬通量和肌节结构。
验证线粒体自噬的调节是否影响R120G-CRYAB转基因小鼠的心脏功能和存活
对R120G-TG小鼠进行AAV9-cTnT-TRAF2或PARKIN处理(8周龄),同时通过诱导性Traf2敲低(R120G TRAF2-icHET),监测心功能、存活率、蛋白聚集体和线粒体形态。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与转染 | 他莫昔芬 | -- | -- |
| 线粒体摄取实验 | 毛地黄皂苷 | -- | -- |
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 基质胶 | -- | -- | |
| 分子克隆 | 脂质体3000 | Invitrogen | -- |
| 聚乙烯亚胺 | -- | -- | |
| 蛋白检测 | 蛋白酶抑制剂混合物 | -- | -- |
| 生化分级 | 丽春红S | -- | -- |
| 免疫印迹 | 抗GAPDH抗体 | -- | -- |
| 抗VDAC抗体 | -- | -- | |
| 抗COXIV抗体 | -- | -- | |
| 抗LONP1抗体 | -- | -- | |
| 抗p62抗体 | -- | -- | |
| 抗多聚泛素抗体 | -- | -- | |
| 抗肌间线蛋白抗体 | -- | -- | |
| 抗αB-晶状体蛋白抗体 | -- | -- | |
| 抗HSC70抗体 | -- | -- | |
| 抗HA抗体 | -- | -- | |
| 抗FLAG抗体 | -- | -- | |
| 抗GFP抗体 | -- | -- | |
| 抗α-辅助动蛋白抗体 | -- | -- | |
| 抗SOD2抗体 | -- | -- | |
| 抗TRAF2抗体 | -- | -- | |
| 抗PARKIN抗体 | -- | -- | |
| 抗CLPP抗体 | -- | -- | |
| 抗HTRA2抗体 | -- | -- | |
| 细胞增殖与毒性检测 | CCK-8检测 | -- | -- |
| 动物实验 | AAV9-cTnT-TRAF2 | -- | -- |
| AAV9-cTnT-GFP | -- | -- | |
| AAV9-cTnT-PARKIN | -- | -- | |
| 其他 | Prism | GraphPad Software Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| TRAF2icKO小鼠模型 | Traf2floxed等位基因,Myh6-MerCreMer转基因,tamoxifen处理方案(饮食中给药一周),小鼠周龄,心功能评估时间点(如20周)。 阅读提示:见方法部分‘Mice’和结果部分‘Cardiac myocyte-specific ablation of TRAF2…’ |
| hiPSC-CMs培养与分化 | 人iPSC系(包括TRAF2 KO和CRYAB R120G敲入),分化方案,培养条件(基质胶,培养基),是否使用mKate-α-actinin报告基因。 阅读提示:见扩展材料和方法,以及结果部分‘Loss of TRAF2 impairs mitophagy…’ |
| 线粒体摄取实验 | GFP标记的CRYAB-WT或R120G表达载体,HEK293细胞转染,线粒体分离方法,digitonin处理浓度和时间,CCCP处理浓度(50μM,6小时)。 阅读提示:见方法中‘Mitochondrial import assay’和结果部分‘Aggregate-prone mutants of cytosolic proteins accumulate in mitochondria’ |
| AAV9介导的TRAF2过表达 | AAV9载体构建(cTnT启动子),病毒剂量(7×10^11病毒基因组/只),注射方式(尾静脉)和时机(8周龄),心功能评估(超声心动图)和生存监测时间。 阅读提示:见结果部分‘Targeted TRAF2 overexpression rescues mortality…’ |
| TRAF2敲低实验 | 诱导性敲低模型:R120G-TG小鼠携带一个Traf2 floxed等位基因和MerCreMer,tamoxifen处理方案,心功能评估和生存期。 阅读提示:见结果部分‘TRAF2 deficiency worsens cardiac function…’ |