肿瘤模型和EVP诱导血管通透性评估
比较不同肿瘤模型和其EVP诱导肺血管渗漏的能力
将B16F10、K7M2、4T1、67NR细胞原位植入小鼠,14天后通过静脉注射葡聚糖评估血管通透性;分离B16F10和K7M2 EVPs并注入小鼠,1小时后评估通透性。
Tumoral extracellular vesicles and particles reprogram interstitial macrophages in the lung to promote vascular permeability and metastasis
包含体外细胞实验、动物模型、患者样本和组学分析,并进行功能验证(ITGα5敲除/过表达)和机制验证(NF-κB通路)。
B16F10黑色素瘤小鼠模型 K7M2骨肉瘤小鼠模型 间质巨噬细胞(小鼠和人) 结直肠癌患者肿瘤样本
EVP给药剂量和途径:10μg EVPs经眶后注射 血管通透性检测:注射罗丹明-葡聚糖(70kDa)后1小时 IM耗竭:抗CSF1R(BE0213)200μg/只 ITGα5敲除或AV3抑制剂的处理浓度和时间 IL-6中和抗体剂量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较不同肿瘤模型和其EVP诱导肺血管渗漏的能力
将B16F10、K7M2、4T1、67NR细胞原位植入小鼠,14天后通过静脉注射葡聚糖评估血管通透性;分离B16F10和K7M2 EVPs并注入小鼠,1小时后评估通透性。
测试EVP诱导的血管渗漏是否能促进肿瘤细胞外渗和肺转移
注射EVP(高渗漏或低渗漏)1小时后尾静脉注射肿瘤细胞(B16F10、K7M2、4T1),14天后评估转移灶;使用组胺作为阳性对照。
确定哪些肺细胞摄取主要EVP,以找出介导通透性的关键细胞
用PKH67标记EVP并注射,1小时后通过流式细胞术和免疫荧光分析肺细胞亚群,确定IM是主要摄取者。
测试间质巨噬细胞耗竭对EVP诱导的血管通透性和转移的影响
使用抗CSF1R抗体耗竭IM,然后评估EVP诱导的血管渗漏和转移负担,并检测生存率。
找出EVPs激活IM后介导血管通透性的关键细胞因子
对EVP处理的IM进行RNA-seq和细胞因子阵列,发现IL-6、CXCL2、CCL3和TNF上调;使用中和抗体验证IL-6是关键因子。
寻找EVP中负责诱导血管通透性的特定蛋白
对B16F10、K7M2、4T1和Melan-A来源的EVP进行质谱分析,比较蛋白质表达,筛选出ITGα5等候选蛋白,并通过敲除/敲低验证功能。
阐明ITGα5如何调控巨噬细胞信号通路和IL-6产生
使用ITGα5抑制剂AV3或敲除EVP中ITGα5,检测巨噬细胞NF-κB(p-IKKβ、p65核转位)和STAT3磷酸化,以及IL-6分泌;使用NF-κB抑制剂TPCA-1验证通路。
评估ITGα5在结直肠癌患者肿瘤EVP中的表达和功能
比较结直肠癌患者肿瘤和相邻组织来源的EVPs中ITGα5表达,检测其对巨噬细胞IL-6分泌和体内血管通透性的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning | -- |
| RPMI培养基 | Corning | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 12-O-十四烷酰佛波醇-13-乙酸酯 | Sigma | -- | |
| 内皮细胞生长培养基2 | PromoCell | -- | |
| EVP分离 | BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce, Thermo Fisher Scientific | -- |
| EVP表征 | ZetaView纳米颗粒分析仪 | Particle Metrix | -- |
| NanoSight NS500纳米颗粒分析仪 | Malvern Instruments | -- | |
| EVP分离 | OptiPrep密度梯度介质 | -- | -- |
| EVP标记 | PKH67荧光染料 | Sigma | -- |
| CellVue burgundy荧光染料 | eBioscience | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI染色液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| ProLong Diamond防淬灭封片剂 | Thermo Fisher Scientific | P36970 | |
| 显微镜 | LSM 880共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| 组织学 | VectaMount封片剂 | Vector Laboratories | -- |
| PANNORAMIC 250 Flash数字切片扫描仪 | 3DHISTECH | -- | |
| 流式细胞术 | 胶原酶A | Roche | -- |
| 分散酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma-Aldrich | -- | |
| Aurora流式细胞分析仪 | Cytek | -- | |
| 透射电镜 | JEOL JEM-1400透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| IM分离 | BD FACS Melody流式分选仪 | BD | -- |
| IM培养 | 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | -- | -- |
| 巨噬细胞分化 | MACS CD14磁珠 | Miltenyi Biotec | -- |
| 巨噬细胞无血清培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 人血清 | -- | -- | |
| 报告基因 | THP-1-NF-κB-luc2报告基因检测试剂盒 | InvivoGen | thpl-nfkbv2 |
| 细胞因子检测 | 小鼠细胞因子阵列试剂盒 | R&D Systems | -- |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Sigma-Aldrich | -- |
| Novex 4-12% Bis-Tris Plus预制胶 | Life Technologies | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | Bio-Rad | -- | |
| ChemiDoc XRS+凝胶成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 动物实验 | 抗CSF1R抗体 | BioXCell | BE0213 |
| IgG对照抗体 | BioXCell | BE0090 | |
| 抗Ly6G抗体 | BioXCell | BE0320 | |
| 抗Ly6C抗体 | BioXCell | BE0203 | |
| 抗IL-6抗体 | BioXCell | BE0046 | |
| 抗TNF抗体 | BioXCell | BE0058 | |
| 抗CXCL2抗体 | R&D Systems | MAB452 | |
| 抗CCL3抗体 | R&D Systems | AB-450-NA | |
| 细胞外渗实验 | CellTracker绿色CMFDA染料 | Invitrogen | C2925 |
| CD31-PE抗体 | BioLegend | 102408 | |
| 药物处理 | AV3衍生物 | -- | -- |
| TPCA-1(NF-κB抑制剂) | -- | -- | |
| 重组IL-6蛋白 | PeproTech | -- | |
| 组胺 | -- | -- | |
| 基因编辑 | lentiCas9-Blast质粒 | Addgene | 52962 |
| lentiGuide-Puro质粒 | Addgene | 52963 | |
| TransIT-X2转染试剂 | Mirus | -- | |
| ON-TARGETplus小鼠CDH2 siRNA | Horizon | L-040206-00-0005 | |
| ON-TARGETplus非靶向siRNA | Horizon | D-001810-10-05 | |
| 蛋白组学 | 内肽酶LysC | Wako | -- |
| 胰蛋白酶 | Promega | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RNeasy Mini RNA提取试剂盒 | Qiagen | -- | |
| RT-qPCR | 高容量cDNA反转录试剂盒 | -- | -- |
| SYBR green染料 | -- | -- | |
| RNA-seq | Illumina链特异性mRNA文库制备试剂盒 | Illumina | PN 20040534 |
| NextSeq 2000测序仪 | Illumina | -- | |
| 质谱分析 | Q-Exactive质谱仪 | Thermo Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| EVP给药 | EVP剂量:10μg;注射途径:眶后注射;时间:1小时后检测 阅读提示:Methods: In vivo models; Fig. 1g,h |
| 血管通透性检测 | 罗丹明-葡聚糖分子量:70kDa;剂量:0.5mg;注射后1小时分析 阅读提示:Methods: Permeability assays |
| IM耗竭 | 抗CSF1R剂量:200μg/小鼠;给药时间:EVP处理前18小时 阅读提示:Methods: In vivo models; Fig. 3g |
| 体外通透性实验 | HPAEC细胞;胶原包被transwell(3μm);处理时间:60分钟 阅读提示:Methods: Permeability assays |
| ITGα5抑制 | AV3浓度:20μM;孵育时间:1小时 阅读提示:Methods: Pharmacological treatments |