ADAMTS19缺失导致进行性非综合征性心脏瓣膜病

Loss of ADAMTS19 causes progressive non-syndromic heart valve disease

作者信息Florian Wünnemann, Asaf Ta-Shma, Christoph Preuss, Severine Leclerc, Patrick Piet van Vliet, Andrea Oneglia, Maryse Thibeault, Emily Nordquist, Joy Lincoln, Franka Scharfenberg, Christoph Becker-Pauly, Philipp Hofmann, Kirstin Hoff, Enrique Audain, Hans-Heiner Kramer, Wojciech Makalowski, Amiram Nir, Sebastian S Gerety, Matthew Hurles, Johanna Comes, Anne Fournier, Hanna Osinska, Jeffrey Robins, Michel Pucéat, MIBAVA Leducq Consortium principal investigators, Orly Elpeleg, Marc-Phillip Hitz, Gregor Andelfinger, Harry C Dietz, Andrew S McCallion, Gregor Andelfinger, Bart L Loeys, Lut Van Laer, Per Eriksson, Salah A Mohamed, Luc Mertens, Anders Franco-Cereceda, Seema Mital
PMID31844321
期刊Nat Genet
发布时间2020-01
DOI10.1038/s41588-019-0536-2

实验完整度

人类全外显子组测序、小鼠敲除模型功能验证、单细胞RNA测序及基因调控网络分析等多层级证据。

主要模型

人类家系患者 Adamts19敲除小鼠 体外分化的人瓣膜间质细胞

重点核对

人类患者ADAMTS19纯合功能缺失突变 Adamts19敲除小鼠的主动脉瓣功能障碍及组织学变化 单细胞RNA测序中Adamts19在瓣膜间质细胞中的特异性表达 Wnt刺激下人瓣膜间质细胞中ADAMTS19表达上调 Adamts19敲除小鼠中Klf2表达上调

摘要

心脏瓣膜病大约在普通人群中的患病率为2%。尽管最初的观察常局限于某个瓣膜(如主动脉瓣或二尖瓣),但在其他瓣膜中也经常观察到疾病表现,患者常需手术治疗。尽管心脏瓣膜病发病率很高,但迄今只有少数基因被发现是单基因致病的病因。在这里,我们确定了两个近亲家庭,每个家庭都有两名受影响的成员在生命早期出现进行性心脏瓣膜病。全外显子组测序显示,所有四名受影响个体均携带ADAMTS19基因的纯合截短无义等位基因。Adamts19纯合敲除小鼠表现出主动脉瓣功能障碍,重现了人类表型的某些方面。使用lacZ报告基因和单细胞RNA测序进行的表达分析将Adamts19定位为瓣膜间质细胞的新标志物;瓣膜间质细胞中基因调控网络的推断将Adamts19置于Wnt信号通路下游、由转录因子淋巴样增强因子结合因子1驱动的高判别性网络中。Adamts19敲除小鼠中内皮Krüppel样因子2的上调先于血流动力学紊乱,表明Wnt–Adamts19–Klf2轴中的紧密平衡对于瓣膜的正确成熟和维持是必需的。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
ADAMTS19功能缺失是否导致非综合征性进行性心脏瓣膜病及其潜在机制
核心机制
Adamts19位于Wnt信号下游、由Lef1调控的基因调控网络中,其缺失导致内皮细胞Klf2表达上调,影响瓣膜成熟和维持。
主要证据
人类家系全外显子组测序发现ADAMTS19纯合无义突变;Adamts19敲除小鼠表现进行性主动脉瓣疾病,伴随细胞外基质紊乱和瓣膜增厚;单细胞RNA测序和基因调控网络分析将Adamts19定位于Wnt–Lef1调控网络,并观察到Klf2上调先于血流动力学改变。
研究意义
研究提出ADAMTS19在瓣膜间质细胞维持细胞外基质完整性和间质-内皮信号平衡中具有关键作用,为心脏瓣膜病的致病机制和治疗靶点提供新见解。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

人类遗传学分析

鉴定导致家族性早发心脏瓣膜病的致病基因

对两个近亲家庭进行全外显子组测序,发现受影响个体均携带ADAMTS19基因纯合功能缺失突变,包括一个拷贝数缺失和一个无义突变。

2

小鼠模型构建与表型分析

验证Adamts19缺失对心脏瓣膜结构和功能的影响

利用基因敲除小鼠(Adamts19tm4a和Adamts19tm4b)进行超声心动图、组织学和电镜分析,观察到主动脉瓣功能障碍、瓣膜增厚和细胞外基质紊乱。

3

表达模式分析

确定Adamts19在心脏瓣膜中的时空表达模式

使用lacZ报告基因染色和RNA原位杂交,显示Adamts19在胚胎及出生后所有四个心脏瓣膜的瓣膜间质细胞中表达,并在内皮细胞中不表达。

4

单细胞RNA测序与基因调控网络分析

揭示Adamts19在瓣膜间质细胞中的调控网络及缺失后的转录变化

对E14.5 WT和敲除小鼠心脏进行单细胞RNA测序(Drop-seq),通过基因调控网络分析鉴定Adamts19受Lef1调控,并发现敲除后内皮细胞中Klf2表达上调。

5

体外验证Wnt调控

验证ADAMTS19受Wnt信号直接调控

体外分化人瓣膜间质细胞,用Wnt3a和R-spondin-3刺激,通过qPCR检测到ADAMTS19和AXIN2表达上调。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
SureSelect人类全外显子V5捕获试剂盒Agilent Technologies--
Illumina HiSeq 2500测序仪Illumina--
EasyTaq DNA聚合酶TransGen BiotechAP111-02
M165 FC体视显微镜Leica Microsystems--
Movat五色染色试剂盒American MasterTechKTRMP
VectaMount永久封片剂Vector LaboratoriesH-5000
抗原修复液Vector LaboratoriesH-3300
VECTASHIELD抗淬灭封片剂(含DAPI)Vector LaboratoriesH-1200
RNAscope多重荧光试剂盒v2Advanced Cell Diagnostics323100
HybEZ加湿系统烤箱Advanced Cell Diagnostics--
Opal染料(Opal 570、Opal 620、Opal 690)PerkinElmer--
ProLong Gold抗淬灭封片剂Thermo Fisher Scientific--
DMi8显微镜Leica Microsystems--
VEVO 3100成像系统FUJIFILM VisualSonics--
MS550S探头(32 MHz)FUJIFILM VisualSonics--
H7600透射电子显微镜Hitachi--
CHIR99021Stem Cell Technologies--
Wnt3a重组蛋白Peprotech--
BMP2重组蛋白Thermo Fisher--
IWR-1Sigma Aldrich--
抗CD31磁珠Miltenyi Biotec130-091-935
R-spondin-3----
LightCycler v.1.5实时荧光定量PCR仪Roche Molecular Systems--
新生小鼠心脏解离试剂盒Miltenyi Biotec130-098-373
DMEM高糖培养基Thermo Fisher Scientific31053028
Medfusion 3500注射泵Smiths Medical--
SUPERase•In RNA酶抑制剂Thermo Fisher ScientificAM2694
条形码磁珠ChemGenes--
Fuchs-Rosenthal血细胞计数板INCYTO82030-474
AMPure XP磁珠Beckmann Coulter Life Sciences--
Bioanalyzer高灵敏度DNA分析Agilent Technologies5067-4626
Nextera XT DNA文库制备试剂盒Illumina--
通用文库定量试剂盒KAPA--
NextSeq 500测序系统Illumina--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
人类遗传学分析
突变类型及家系共分离;ADAMTS19纯合功能缺失突变与疾病表型的关联
阅读提示:Methods: Exome sequencing and human genetic analysis; Figure 1
小鼠模型构建
基因敲除小鼠品系(Adamts19tm4a/tm4b)的构建及基因型确认;C57BL/6N背景
阅读提示:Methods: Mouse strains and experiments; Genotyping strategies
小鼠表型分析
超声心动图参数(主动脉瓣返流、峰值流速、压力梯度)检测时间点(3、6、9月龄)和样本量;组织学染色方法
阅读提示:Methods: Echocardiography imaging of mice; IHC of mouse heart valves; Figures 2-4
单细胞RNA测序
E14.5心脏解离方法、Drop-seq条件、细胞数量和质量过滤参数;基因调控网络分析参数
阅读提示:Methods: Single-cell RNA-seq; Computational analysis; GRN analysis
体外VIC分化及Wnt刺激
VIC分化方案(细胞因子组合、浓度和时间);qPCR检测的基因及引物
阅读提示:Methods: Differentiation of VICs and Wnt stimulation