验证近视过程中巩膜Postn启动子H3K18la富集及表达变化
确认H3K18la是否在Postn启动子区域富集并伴随Postn表达上调。
在FDM小鼠中,通过CUT&Tag-qPCR检测Postn启动子H3K18la富集,通过RT-qPCR和免疫印迹检测Postn mRNA和蛋白水平。
Scleral Postn Drives Myopia via Promoting Myofibroblast Transdifferentiation
包含体外细胞实验(HSFs)和体内小鼠FDM模型,且具有功能获得/丧失验证及机制研究(co-IP、AKT通路)。
C57BL/6小鼠形觉剥夺性近视(FDM)模型 人巩膜成纤维细胞(HSFs)
FDM诱导:使用透光率约20%-30%的弥散镜片遮盖右眼 AAV8-POSTN或AAV8-shRNA-POSTN的球后Tenon囊注射剂量(5×10^12至1×10^13基因组拷贝/mL) HSFs处理:缺氧(1% O2)或乳酸(20 mM)处理48小时 rhPOSTN处理浓度:10、25、50 ng/mL处理24小时 整合素中和抗体:抗整合素αvβ5(2.5 µg/mL)预孵育30分钟
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认H3K18la是否在Postn启动子区域富集并伴随Postn表达上调。
在FDM小鼠中,通过CUT&Tag-qPCR检测Postn启动子H3K18la富集,通过RT-qPCR和免疫印迹检测Postn mRNA和蛋白水平。
确定乳酸积累是否通过p300介导的H3K18la促进Postn表达。
在小鼠巩膜中过表达或敲低LDHA,在HSFs中使用siRNA敲低LDHA或p300,并检测H3K18la和POSTN水平。
验证巩膜Postn过表达是否足以诱导近视。
通过球后Tenon囊注射AAV8-POSTN,检测屈光参数、巩膜α-SMA和COL1α1水平。
验证降低巩膜Postn水平是否能抑制FDM。
注射AAV8-shRNA-POSTN后诱导FDM 2周,检测屈光参数和巩膜α-SMA及COL1α1水平。
确认POSTN是否直接促进人巩膜成纤维细胞FMT。
在HSFs中过表达POSTN mRNA或敲低POSTN,或用rhPOSTN处理,检测α-SMA和COL1α1水平。
确定Postn是否通过结合特定整合素激活AKT信号。
通过免疫共沉淀检测POSTN与整合素αv、β3、β5的相互作用,通过免疫印迹检测AKT磷酸化水平。
确认在FDM小鼠巩膜中Postn与整合素结合并激活AKT。
在FDM小鼠、Postn过表达或敲低小鼠中,通过免疫共沉淀和免疫印迹检测Postn与整合素αv、β3、β5的相互作用及p-AKT水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物饲养 | 小鼠饲料 | Jiangsu Xietong Pharmaceutical Bio-engineering Co., Ltd | 1010058 |
| RNA提取 | RNeasy纤维组织迷你试剂盒 | Qiagen | 74704 |
| RQ1无RNA酶DNA酶 | Promega | -- | |
| 逆转录 | M-MLV逆转录酶 | Promega | -- |
| qPCR | ChamQ SYBR color qPCR预混液 | Vazyme | -- |
| ABI ViiA 7实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 组织处理 | 混合研磨仪MM 400 | Retsch | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 11995 |
| 细胞消化 | I型胶原酶 | Sigma-Aldrich | C0130 |
| IV型胶原酶 | Gibco | 17104 | |
| 胰蛋白酶 | Gibco | 25200 | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 40微米细胞过滤器 | BD Biosciences | -- | |
| CUT&Tag | Hyperactive通用CUT&Tag检测试剂盒 | Vazyme | TD903 |
| 抗H3K18la抗体 | PTM Bio | PTM-1406 | |
| 山羊抗兔IgG H&L | Vazyme | AB206-01-AA | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 12430 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099 | |
| GlutaMAX补充剂 | Gibco | 35050079 | |
| Mycoblue支原体检测试剂盒 | Vazyme | D101-01 | |
| 低氧培养 | Coy体外低氧培养箱系统 | Coy Laboratory Products | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- |
| CALNP转染试剂 | D-Nano Therapeutics | DN002-10 | |
| 蛋白处理 | 重组人POSTN蛋白 | MCE | HY-P77818 |
| 抗整合素αvβ5中和抗体 | Merck/Millipore | MAB1961 | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| 蛋白定量 | 增强型BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 免疫印迹 | 硝酸纤维素膜 | Millipore | -- |
| 免疫印迹显影 | FluorChem E成像系统 | ProteinSimple | -- |
| 免疫沉淀 | NP-40裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| Protein A/G琼脂糖珠 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 数据统计 | GraphPad Prism软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型(FDM) | 小鼠品系、性别、年龄,弥散镜片透光率、遮盖时间 阅读提示:Methods: Form Deprivation Myopia in Mice |
| AAV注射 | 病毒注射剂量(5 µL,滴度5×10^12-1×10^13基因组拷贝/mL),注射部位(sub-Tenon's capsule) 阅读提示:Methods: Scleral Genetic Modification of Mice and Experimental Paradigms, Sub-Tenon's Capsule Injection |
| 细胞培养与处理 | HSFs来源,培养基成分,缺氧条件(1% O2),乳酸浓度(2.5, 10, 20 mM),处理时间(48小时) 阅读提示:Methods: Experiments in Cultured Human Scleral Fibroblasts |
| siRNA敲低 | siRNA序列,浓度(30 nM),转染试剂(Lipofectamine RNAiMAX) 阅读提示:Methods: Experiments in Cultured Human Scleral Fibroblasts |
| 蛋白检测 | 一抗、二抗信息(见补充表S2),蛋白上样量、凝胶浓度(10% SDS-PAGE) 阅读提示:Methods: Immunoblot Analysis, Supplementary Table S2 |