血浆代谢物测量
量化血浆中53种靶向代谢物的浓度。
使用液相色谱-质谱联用(LC-MS/MS)在正离子模式下对血浆样本进行靶向代谢组学分析,采用多反应监测模式,基于参考标准进行绝对定量。
Plasma metabolites, dietary intakes, and breast cancer incidence: a prospective case-cohort study in NutriNet-Santé
前瞻性病例-队列研究,包含代谢物检测、膳食评估、Cox回归、ElasticNet及中介分析;但缺乏体外或动物功能验证。
NutriNet-Santé队列子队列(2762名女性) 乳腺癌病例组(306例)
代谢物测量平台:液相色谱-质谱联用(Agilent 1290LC, SCIEX Api4000) 膳食评估:重复24小时膳食记录(中位数6次) Cox模型调整:腰围、身高、教育水平、癌症家族史、健康状况、吸烟、饮酒、体力活动、月经初潮年龄、生育情况、绝经状态等 排除诊断后2年内病例的敏感性分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
量化血浆中53种靶向代谢物的浓度。
使用液相色谱-质谱联用(LC-MS/MS)在正离子模式下对血浆样本进行靶向代谢组学分析,采用多反应监测模式,基于参考标准进行绝对定量。
评估参与者的长期膳食摄入。
使用重复的24小时膳食记录(R24H)评估膳食摄入,计算55种营养素和24个食物组的平均每日摄入量。
评估个体代谢物和代谢物模式与乳腺癌发病风险的关联。
使用多变量Cox比例风险模型,以年龄为时间尺度,估计代谢物与乳腺癌风险的HRs。主成分分析(PCA)用于识别代谢物模式。
识别与乳腺癌风险相关代谢物相关的膳食因素。
使用ElasticNet回归模型选择与每个代谢物相关的膳食变量,然后通过线性回归估计其关联强度。
评估代谢物是否介导膳食与乳腺癌风险的关联。
对显著的膳食-代谢物关联进行中介分析,使用基于回归的方法估计总效应、直接效应和间接效应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 代谢组学分析 | 安捷伦1290液相色谱仪 | Agilent Technologies | -- |
| SCIEX Api4000三重四极杆质谱仪 | SCIEX | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 研究设计 | 前瞻性病例-队列设计,子队列随机选择,病例定义,随访时间 阅读提示:Methods: Study design and data collection |
| 代谢物测量 | 血浆样本采集、处理、储存条件,LC-MS/MS参数,代谢物定量方法 阅读提示:Methods: Metabolomics; Supplementary Methods |
| 膳食评估 | 24小时膳食记录次数、验证方法、营养素和食物组计算方式 阅读提示:Methods: Dietary intake |
| 统计分析 | Cox模型调整变量、年龄时间尺度、逆抽样概率权重、FDR校正方法、ElasticNet参数、中介分析方法 阅读提示:Methods: Statistical analysis |