重组突变蛋白设计及体外功能验证
验证AH基序缺失是否影响Ambn的自组装和细胞膜结合功能。
设计并表达重组AmbnΔL76-P86蛋白,通过TEM和DLS分析自组装,通过细胞铺展实验和竞争实验分析细胞膜结合。
Ameloblastin amphipathic helix motif mediates ameloblast polarization and prismatic enamel formation
包含转基因小鼠模型、体外细胞实验、重组蛋白自组装分析、显微CT和组织学分析及RNA测序,并进行了功能验证和机制探讨。
AmbnΔL76-P86基因工程小鼠 成釉细胞系(ALC)
重组AmbnΔL76-P86蛋白在细胞铺展实验中的功能丧失 AmbnΔL76-P86小鼠釉质矿化密度和棱柱状结构缺陷 成釉细胞极性标志物(Pard3, Cldn1, GM130)的定位改变 AmbnΔL76-P86小鼠中β-catenin和p-Smad2/3的核定位及RhoA信号降低
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证AH基序缺失是否影响Ambn的自组装和细胞膜结合功能。
设计并表达重组AmbnΔL76-P86蛋白,通过TEM和DLS分析自组装,通过细胞铺展实验和竞争实验分析细胞膜结合。
建立AmbnΔL76-P86突变小鼠模型,并验证基因编辑效果及对相关基因表达的影响。
使用CRISPR-Cas9技术生成AmbnΔL76-P86小鼠,通过Sanger测序、qPCR和RNA-seq验证基因型及釉质基质基因表达。
评估AH基序缺失对釉质厚度、矿化密度和微结构的影响。
使用光学显微镜观察釉质外观,微CT分析厚度和矿化密度,SEM观察釉质超微结构。
分析AH基序缺失对成釉细胞形态、极性建立及细胞器定位的影响。
通过H&E染色测量成釉细胞高度,免疫荧光染色观察极性蛋白(Pard3, Cldn1, GM130)和细胞器标志物。
探索AH基序缺失导致成釉细胞极性异常的潜在信号通路。
免疫荧光检测E-cadherin、β-catenin、p-Smad2/3、p-Erk1/2和RhoA,并进行RNA-seq分析差异表达基因和通路富集。
验证重组Ambn蛋白对ALC细胞伸长和极化的影响。
在3D-on-top培养体系中,加入重组WT Ambn和突变体,测量ALC细胞的长宽比。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白表达与纯化 | 重组小鼠AmbnΔL76-P86突变蛋白 | -- | -- |
| 细胞培养 | 达尔伯克改良伊格尔培养基 | Corning | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 微计算机断层扫描 | SkyScan 1174 | Bruker | -- |
| NRecon | -- | -- | |
| Amira | Thermo | -- | |
| 扫描电子显微镜 | Nova NanoSEM 450 | FEI | -- |
| 免疫荧光 | 抗成釉蛋白抗体 | R&D Systems | AF3026-SP |
| 抗GM130抗体 | Huabio | R1608-7 | |
| 抗Claudin-1抗体 | Proteintech | 28674-1-AP | |
| 抗Pard3抗体 | Proteintech | 11085-1-AP | |
| 抗E-钙黏蛋白抗体 | BD Biosciences | 560064 | |
| 抗β-连环蛋白抗体 | Abcam | ab32572 | |
| 抗p-Smad2/3抗体 | Abcam | ab202445 | |
| 抗p-Erk1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4370T | |
| 抗RhoA抗体 | SCBT | sc-418 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab6277 | |
| 驴抗山羊Alexa Fluor 647二抗 | Jackson Immuno | 705-605-003 | |
| 驴抗兔Alexa Fluor 647二抗 | Jackson Immuno | 711-605-152 | |
| 驴抗兔Alexa Fluor 488二抗 | Thermo | A-21206 | |
| 驴抗兔Alexa Fluor 488二抗 | Jackson Immuno | 711-545-152 | |
| 扫描电子显微镜 | 环氧树脂 | Ted Pella | -- |
| 碳化硅砂纸 | 3M Wetordry | -- | |
| 金刚石研磨膏 | Buehler | -- | |
| 磷酸 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 重组蛋白表达与纯化 | 重组蛋白的表达、纯化条件及浓度 阅读提示:参见补充信息 |
| 细胞培养 | ALC细胞培养条件:DMEM、10%FBS、100 U/mL青霉素和100 mg/mL链霉素、37°C、5% CO2 阅读提示:Materials and methods - Cell culture—3D and 2D |
| 小鼠模型 | 基因编辑小鼠的构建方法(CRISPR-Cas9)、品系背景(C57BL/6)、饲养条件(软凝胶饮食) 阅读提示:Materials and methods - Generation of AmbnΔL76-P86 mutant mice |
| 釉质分析 | 微CT扫描参数(50 kV, 800 μA,0.25 mm铝滤片),图像分辨率(14.1 μm和6 μm),样本量(n=5或n=4) 阅读提示:Materials and methods - Micro-computed X-Ray tomography (micro-CT) |
| 组织学与免疫荧光 | P8小鼠下颌切牙,切片厚度7 μm,固定(4% PFA)、脱钙(10% EDTA)时间,抗体浓度和孵育条件 阅读提示:Materials and methods - Histology and ameloblast height measurements; Immunofluorescent labeling |
| RNA测序 | P5小鼠第一磨牙釉质器官样本数量(2个/鼠),文库构建和测序平台 阅读提示:Materials and methods - Bulk RNA sequencing |