体内验证肿瘤细胞获取免疫细胞线粒体
确认肿瘤细胞在体内能获取宿主免疫细胞线粒体,并评估其在不同肿瘤模型中的普遍性。
将TdTomato标记的MC38、E0771或B16肿瘤细胞植入WT或MtD2小鼠(表达线粒体靶向Dendra2报告基因),14天后通过流式细胞术检测肿瘤细胞中Dendra2信号;构建骨髓嵌合体限制Dendra2表达于造血细胞,检测原发灶和淋巴结中肿瘤细胞Dendra2阳性比例;通过共聚焦显微镜和PCR定量验证。
Mitochondrial transfer from immune to tumor cells enables lymph node metastasis
包含体外共培养、多种小鼠肿瘤模型、骨髓嵌合体、基因敲低、药物抑制、RNA-seq及人类样本分析等多个独立证据层级,并包含功能验证和机制验证。
MC38结肠癌小鼠模型 E0771乳腺癌小鼠模型 B16黑色素瘤小鼠模型 MMTV-PyMT转基因乳腺癌模型 B16LN6淋巴趋向性黑色素瘤模型
肿瘤细胞线粒体获取率(Dendra2阳性比例) 免疫细胞线粒体缺失对MHC I/II、共刺激分子和PD-L1表达的影响 外源线粒体融合与mtDNA泄漏对cGAS/STING激活的依赖 cGAS/STING或I型干扰素阻断对淋巴结转移的影响 GAP43、cGAS、STING、IRF3基因沉默对淋巴结转移的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认肿瘤细胞在体内能获取宿主免疫细胞线粒体,并评估其在不同肿瘤模型中的普遍性。
将TdTomato标记的MC38、E0771或B16肿瘤细胞植入WT或MtD2小鼠(表达线粒体靶向Dendra2报告基因),14天后通过流式细胞术检测肿瘤细胞中Dendra2信号;构建骨髓嵌合体限制Dendra2表达于造血细胞,检测原发灶和淋巴结中肿瘤细胞Dendra2阳性比例;通过共聚焦显微镜和PCR定量验证。
确定线粒体转移的动力学和条件,并评估对免疫细胞功能的影响。
建立肿瘤-白细胞共培养体系,使用时间延迟共聚焦显微镜观察转移过程;检测低氧、LPS和抑制剂对转移的影响;通过流式细胞术分析免疫细胞MitoHi和MitoLo亚群的表面标志和细胞毒能力。
检验获取的线粒体是否改变肿瘤细胞的增殖、侵袭、迁移及免疫逃逸相关表型。
通过流式细胞术检测Dendra2+和Dendra2-肿瘤细胞的细胞周期、MHC I、PD-L1、PD-1表达;RNA-seq分析转录组差异,GSEA富集通路;迁移和侵袭实验。
确定外源线粒体如何触发cGAS/STING通路,并验证是否依赖线粒体融合和mtDNA泄漏。
使用荧光标记观察外源与内源线粒体融合,检测mtDNA泄漏和ROS水平;药物抑制ROS或融合;比较免疫细胞和基质细胞来源的线粒体效应;使用ρ0细胞确定mtDNA来源。
确定cGAS/STING激活是否是肿瘤淋巴结转移所必需的。
通过siRNA敲低B16或B16LN6细胞中的GAP43、cGAS、STING、IRF3,或使用TNT抑制剂L-77123,检测原发肿瘤生长和淋巴结转移发生率。
评估线粒体转移与cGAS/STING激活及淋巴结转移在人类肿瘤中的关联。
重分析已发表的RNA-seq和scRNA-seq数据集,使用MERCI方法计算线粒体转移分数,分析其与cGAS/STING通路基因表达的相关性,并比较原发灶与淋巴结转移灶中接收线粒体的癌细胞中干扰素刺激基因的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Cytiva (HyClone) | SH30605.01 |
| 杜尔贝科改良伊格尔培养基(DMEM) | Cytiva (HyClone) | SH30081.02 | |
| 胎牛血清 | Atlas Biologicals | F-0500-D | |
| 青霉素-链霉素(100×) | Sigma-Aldrich (MilliporeSigma) | P0781 | |
| 0.25%胰蛋白酶 | Cytiva | SH30042.02 | |
| EBM-2内皮细胞生长基础培养基2 | Lonza | CC-3156 | |
| 胶原酶I | Rockland | MB-118-0100 | |
| 胶原酶II | Worthington Biochemical | LS004176 | |
| 胶原酶IV | Sigma-Aldrich | C4-BIOC | |
| 分散酶II | Sigma-Aldrich | D4693-1G | |
| 重组DNase I | Roche (MilliporeSigma) | 04536282001 | |
| 表皮生长因子(EGF) | Sigma-Aldrich | E5160-100UG | |
| 氢化可的松 | Sigma-Aldrich | H0888-1G | |
| 尿苷 | Sigma-Aldrich | U3003-5G | |
| 溴化乙锭溶液 | Sigma-Aldrich | D4693-1G | |
| 药物处理 | 脂多糖(LPS) | Sigma-Aldrich | L4391 |
| 环磷酰胺 | MedChemExpress | HY-17420 | |
| Mdivi-1 | -- | -- | |
| Mito-TEMPO | -- | -- | |
| Myls22 | -- | -- | |
| MAR1-5A3 | -- | -- | |
| H-151 | -- | -- | |
| RU.521 | -- | -- | |
| vadimezan | -- | -- | |
| SNX | -- | -- | |
| KIN1148 | -- | -- | |
| elamipretide | -- | -- | |
| AICAR | -- | -- | |
| bedaquiline | -- | -- | |
| 细胞松弛素B | -- | -- | |
| L-77123 | -- | -- | |
| 流式分析 | DAPI | BioLegend | 422801 |
| 7-AAD | BioLegend | 420404 | |
| 抗CD45抗体(30-F11) | BioLegend | 103111 | |
| 抗Ly6G抗体(1a8) | BioLegend | 127613 | |
| 抗CD11b抗体(M1/70) | BioLegend | 101211 | |
| 抗CD69抗体(H1.2F3) | BioLegend | 104507 | |
| 抗CD3抗体(145-2C11) | BioLegend | 100307 | |
| 抗CD8a抗体(53-6.7) | BioLegend | 100707 | |
| 抗NK1.1抗体(PK136) | BioLegend | 108737 | |
| 抗颗粒酶B抗体(GB11) | BioLegend | 515408 | |
| 抗穿孔素抗体(S16009A) | BioLegend | 154317 | |
| 抗PD-L1抗体(10F.9G2) | BioLegend | 124315 | |
| 抗PD-1抗体(RMPI-30) | BioLegend | 109117 | |
| 抗CD80抗体(16-10A1) | BioLegend | 104739 | |
| 抗CD86抗体(GL-1) | BioLegend | 105021 | |
| 抗H-2Kb抗体(AF6-88.5) | BioLegend | 116519 | |
| 抗IFN-γ抗体(XMG1.2) | BioLegend | 505807 | |
| 抗CD41抗体(MWReg30) | BioLegend | 133927 | |
| BioTracker ATP-红色活细胞染料 | Sigma | SCT045 | |
| 抗cGAS抗体(1B5) | Sigma | ZRB1406 | |
| 抗TMEM173/STING抗体(19851-1-AP) | Protein Tech | 19851-1-AP | |
| 山羊抗大鼠IgG(H+L)交叉吸附二抗 | ThermoFisher | A-11012 | |
| 免疫细胞分离 | 小鼠中性粒细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-097-658 |
| MojoSort小鼠单核细胞分离试剂盒 | BioLegend | 480153 | |
| MojoSort小鼠CD8 T细胞分离试剂盒 | BioLegend | 480008 | |
| MojoSort小鼠NK细胞分离试剂盒 | BioLegend | 480049 | |
| MojoSort小鼠泛B细胞分离试剂盒 | BioLegend | 480051 | |
| MojoSort小鼠泛树突状细胞分离试剂盒 | BioLegend | 480097 | |
| DNA提取 | DNeasy血液和组织试剂盒 | Qiagen | 69504 |
| qPCR | PowerUP SYBR Green预混液 | Thermo | A25742 |
| 细胞转染 | Oligofectamine转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 流式分析 | 流式缓冲液(含0.5%牛血清白蛋白的PBS) | -- | -- |
| 牛血清白蛋白(BSA) | GoldBio | A-421 | |
| 固定染色 | 鬼笔环肽-iFluor 647偶联物 | Cayman Chemical | 20555 |
| VECTASHIELD PLUS防淬灭封片剂(含DAPI) | Vector Laboratories | H-2000-10 | |
| ProLong Gold防淬灭试剂 | Cell Signaling Technology | 9071 | |
| 细胞培养 | Corning 100 mL 0.5M EDTA, pH 8.0 | Corning | 46-034-CI |
| 红细胞裂解液(10×) | BioLegend | 420302 | |
| 动物实验 | C57BL/6J小鼠 | The Jackson Laboratory | 000664 |
| MtD2小鼠(Dendra2 PhAM切除) | The Jackson Laboratory | 018397 | |
| Pham floxed小鼠 | The Jackson Laboratory | 018385 | |
| NZB/BINJ小鼠 | The Jackson Laboratory | 000684 | |
| MMTV-PyMT小鼠 | The Jackson Laboratory | 022974 | |
| NSG免疫缺陷小鼠 | The Jackson Laboratory | 005557 | |
| 细胞培养 | B16细胞系 | ATCC | CRL-6475 |
| E0771细胞系 | ATCC | CRL-3461 | |
| MC38细胞系 | Kerafast | ENH204-FP | |
| SK-MEL-24细胞系 | ATCC | HTB-71 | |
| B16LN6细胞系 | -- | -- | |
| 9464D细胞系 | -- | -- | |
| CHP134细胞系 | -- | -- | |
| SK-N-BE(2)细胞系 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体内线粒体转移检测 | 肿瘤细胞类型、小鼠品系(WT和MtD2)、细胞植入数量(1×105)、植入天数(14天)、Dendra2阳性肿瘤细胞比例 阅读提示:Methods:Animal experiments;Figure 1A-1C |
| 骨髓嵌合体构建 | 照射剂量(11 Gy)、骨髓细胞来源(WT、MtD2或NZB)、骨髓细胞注射数量(10×10^6)、环磷酰胺预处理(150 mg/kg) 阅读提示:Methods:Bone marrow transplantation |
| 体外共培养条件 | 肿瘤细胞与免疫细胞比例(1:1)、共培养时间(16小时)、细胞培养基(RPMI 1640或DMEM含10% FBS和1%青霉素/链霉素)、低氧条件(2% O2)、LPS浓度(1 ng/ml) 阅读提示:Methods:In vitro co-cultures |
| siRNA敲低效应 | siRNA浓度(10 nM)、转染试剂(Oligofectamine)、敲低基因(GAP43、cGAS、STING、IRF3)、验证敲低效率 阅读提示:Methods:Transfection of tumor cells;Figure S4A |
| 药物处理 | 药物名称、浓度、处理时间(3小时)、药物清洗步骤 阅读提示:Methods:In vitro co-cultures;Figure 3J, 3K, etc. |
| 流式细胞术 | 抗体克隆、荧光标记、染色时间(30分钟)、染色温度(4°C)、死活细胞排除(DAPI或7-AAD) 阅读提示:Methods:Flow cytometry |