基于全基因组测序的浆液性子宫内膜癌特征分析

目的：利用全基因组测序（WGS）定义浆液性子宫内膜癌（EC）的结构变异、突变特征和DNA修复缺陷。方法：选取2012年至2018年间诊断的10例原发性未治疗经典浆液性EC。肿瘤和匹配的正常DNA进行WGS，并使用最先进的生物信息学方法分析测序数据。结果：所有浆液性EC均存在TP53体细胞突变（100%），以及复发性PIK3CA（60%）、FBXW7（40%）、PPP2R1A（30%）突变，CCNE1（50%）和AKT2扩增（30%）。所有浆液性EC经HRDetect检测均为同源重组DNA修复（HR）能力正常，除一例外，其余病例均以衰老/时钟相关或ABOPEC相关突变特征为主。基因组不稳定性水平各异，基因组改变分数（FGA）中位数为45%（范围17-68%）。7例浆液性EC具有高水平的拷贝数改变（CNA）（不同CNA大小≥1Mbp，中位数59；范围26-86），3例具有低水平CNA（不同CNA大小≥1Mbp，中位数12；范围6-23）。虽然高CNA水平与低CNA水平患者在年龄或疾病分期上无差异，但低CNA水平的三例浆液性EC患者至今仍存活（随访68-99个月），而高CNA水平的七例患者中仅一例在58个月随访后存活（范围16-69个月）。结论：尽管浆液性EC以TP53突变和高水平CNA为特征，但HR缺乏的基因组特征并不突出。需要更大规模的前瞻性研究来评估染色体不稳定性对浆液性EC患者结局的影响。