RpoE对hvKP体内毒力的影响
验证rpoE缺失是否减弱hvKP的毒力。
构建rpoE敲除株(ΔrpoE),通过小鼠腹膜感染模型和血流感染模型评估生存率、器官细菌载量和组织病理变化。
RpoE-mediated virulence attenuation elicits protective immunity in hypervirulent Klebsiella pneumoniae
包含小鼠感染模型、细胞感染模型、免疫保护实验、免疫血清被动转移、CD4+ T细胞清除实验等多个独立证据层级,并且包含功能验证和机制验证。
小鼠腹膜感染模型 小鼠血流感染模型 RAW264.7巨噬细胞感染模型 C57BL/6小鼠免疫攻击模型
rpoE基因敲除菌株的构建及遗传稳定性(连续传代12代) 免疫接种剂量:10^4 CFU/只,皮下注射,第0、7、14天 攻击菌株及剂量:WT(10^5 CFU)、HD10717(最小致死剂量10^1 CFU)、HD11567(LD50 1.85×10^4 CFU)、HD12080(LD50 7.08×10^7 CFU) CD4+ T细胞清除实验中抗CD4抗体的使用剂量和频率(200μg/只,每4天一次) 免疫血清被动转移实验中血清转移和攻击的时间(转移后24小时攻击)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证rpoE缺失是否减弱hvKP的毒力。
构建rpoE敲除株(ΔrpoE),通过小鼠腹膜感染模型和血流感染模型评估生存率、器官细菌载量和组织病理变化。
评估ΔrpoE感染是否改变宿主炎症反应,并区分细菌载量与基因型效应。
通过IHC检测中性粒细胞(Ly6G)和巨噬细胞(F4/80)浸润,通过qRT-PCR检测肝脏中TNF-α、IL-1β、IFN-γ的mRNA表达;并使用RAW264.7细胞感染模型在感染早期(2小时)比较细菌载量和TNF-α表达。
验证RpoE是否直接调控T3F表达并影响生物膜形成。
通过RNA-seq和RT-qPCR分析ΔrpoE中T3F基因簇表达,Western blot检测MrkA蛋白水平,TEM观察菌毛产生;使用β-半乳糖苷酶报告基因实验和EMSA验证RpoE对T3F启动子的直接结合和转录激活;进行生物膜形成实验,并通过mrk操纵子互补和mrkA缺失突变体验证T3F在RpoE介导的生物膜调控中的功能。
评估ΔrpoE株作为减毒活疫苗的安全性和免疫原性。
对小鼠进行三次皮下免疫(活ΔrpoE、灭活ΔrpoE或PBS),随后用WT株攻击,评估生存率和保护效果;同时监测体重变化、细菌清除和组织病理,评估遗传稳定性(连续传代12代)和免疫抑制小鼠模型中的安全性。
评估ΔrpoE疫苗对三种临床分离株(ST65、ST23、ST11)的保护效力。
确定三个临床株的LD50,免疫小鼠后用各菌株的致死剂量或LD50攻击,监测生存率、细菌载量和组织病理。
表征ΔrpoE疫苗诱导的体液和细胞免疫应答,并验证其功能贡献。
通过ELISA检测血清中总IgG、IgG2b、IgG2c水平;通过流式细胞术分析肺、肝、脾中免疫细胞群(NK细胞、CD4+ T细胞、CD8+ T细胞、B细胞)频率;通过免疫血清被动转移实验评估血清抗体的功能;通过CD4+ T细胞清除实验评估CD4+ T细胞对保护性的贡献。
比较ΔrpoE与其他减毒疫苗策略(ΔkbvR、Δwzc、ΔmrkA、灭活ΔrpoE、ATCC 13883)的安全性和保护效力。
用各候选疫苗免疫小鼠,随后用WT和三种临床分离株攻击,评估生存率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | 溶原性肉汤 | -- | -- |
| L-阿拉伯糖 | -- | -- | |
| 利福平 | -- | -- | |
| 阿普拉霉素 | -- | -- | |
| 氯霉素 | -- | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | HyClone | SH30243.01 |
| 胎牛血清 | Gibco | 16000-044 | |
| RNA提取 | FastPure复杂细胞/组织总RNA提取试剂盒 | Vazyme Biotech Co., Ltd. | -- |
| FastPure细胞/组织总RNA提取试剂盒V2-RC112 | Vazyme | -- | |
| RT-qPCR | HiScript III逆转录预混液试剂盒 | Vazyme | -- |
| Taq Pro通用SYBR qPCR预混液试剂盒 | Vazyme | -- | |
| 免疫组化 | Ly6G抗体 | Abcam | ab238132 |
| F4/80抗体 | Abcam | ab300421 | |
| 二抗 | -- | -- | |
| 生物膜形成实验 | FLUOstar Omega酶标仪 | FLUOstar | -- |
| 透射电子显微镜 | 透射电子显微镜HT7800 | Hitachi | HT7800 |
| Western blot | 抗MrkA抗体 | CUSABIO | CSB-PA318939LA01KBG |
| 抗RNA聚合酶β抗体 | abcam | ab191598 | |
| HRP偶联的山羊抗兔二抗 | FUDE | FDR007 | |
| 增强化学发光检测试剂盒 | New Cell & Molecular Biotech | P10300 | |
| β-半乳糖苷酶实验 | β-半乳糖苷酶检测系统 | Promega | -- |
| EMSA | Ni-NTA His标签纯化琼脂糖 | MCE | HY-K0210 |
| 免疫抑制模型 | 环磷酰胺 | MedChemExpress | HY-17420 |
| ELISA | ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| CD4+ T细胞清除 | 抗CD4抗体 | STARTER | SOB0690 |
| IgG2b同型对照抗体 | BioXCell | BE0090 | |
| 流式细胞术 | FITC抗小鼠CD45 | BioLegend | 103108 |
| APC/Cyanine7抗小鼠CD4 | BioLegend | 100413 | |
| PerCP抗小鼠CD8a | BioLegend | 100731 | |
| APC抗小鼠CD19 | BioLegend | 115511 | |
| PE抗小鼠CD3 | BioLegend | 100205 | |
| PE/Cyanine7抗小鼠NK-1.1 | BioLegend | 108713 | |
| Brilliant Violet 421抗小鼠/人CD11b | BioLegend | 101251 | |
| Brilliant Violet 785抗小鼠Ly-6G | BioLegend | 127645 | |
| APC/Cyanine7抗小鼠Ly-6C | BioLegend | 128025 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 菌株构建 | rpoE敲除方法(λ-Red重组酶或CRISPR-Cas9)、菌株背景(ATCC43816, HD10717, HD12080)、抗生素浓度(利福平100μg/ml,阿普拉霉素30μg/ml,氯霉素200μg/ml) 阅读提示:Methods: Construction of the rpoE mutants |
| 小鼠感染模型 | 小鼠品系(C57BL/6)、年龄(8周龄)、性别(雄性)、感染途径(腹腔注射或尾静脉)、感染剂量(10^5 CFU)、观察时间(100小时) 阅读提示:Methods: Survival assay against mouse peritoneal infection; Bacteremia in mice |
| 免疫接种 | 免疫剂量(10^4 CFU/只)、注射途径(皮下)、免疫时间(第0、7、14天)、对照组(PBS、灭活ΔrpoE) 阅读提示:Methods: Immune protection assay |
| 攻击实验 | 攻击菌株(WT, HD10717, HD11567, HD12080)、攻击剂量(WT 10^5 CFU,HD10717 10^1 CFU,HD11567 LD50 1.85×10^4 CFU,HD12080 LD50 7.08×10^7 CFU)、攻击途径(腹腔注射)、攻击时间(免疫后第21天) 阅读提示:Methods: Immune protection assay; Results: Protective efficacy section |
| 免疫血清被动转移 | 供体免疫方案(10^4 CFU ΔrpoE,第0、7、14天,皮下)、血清收集时间(第21天)、血清处理(56°C 30分钟热灭活)、给药剂量(200μL/只,腹腔)、给药与攻击间隔(24小时) 阅读提示:Methods: Immune serum passive transfer assay |
| CD4+ T细胞清除实验 | 抗CD4抗体剂量(200μg/只)、给药频率(每4天一次)、给药起始时间(免疫前)、同型对照抗体(IgG2b) 阅读提示:Methods: CD4+ T cell depletion assay |
| 免疫抑制模型 | 环磷酰胺给药方案(免疫前第4天150mg/kg,免疫前第1天100mg/kg,免疫后第2天100mg/kg,腹腔注射)、中性粒细胞清除验证 阅读提示:Methods: Immunocompromised mouse safety model |
| 炎症因子检测 | qRT-PCR检测肝脏中TNF-α、IL-1β、IFN-γ mRNA表达;使用GAPDH作为内参;感染后24小时取样 阅读提示:Methods: Total RNA isolation, cDNA generation, and real-time PCR processing |