5FU处理对线粒体生物发生和形态的影响
探究5FU处理是否改变结直肠癌细胞的线粒体质量和形态
在体外和体内模型中,通过NAO染色、mtDNA含量、蛋白质印迹和电子显微镜检测线粒体质量和形态,并评估凋亡相关蛋白和线粒体膜电位。
Mitochondrial metabolism determines chemotherapy sensitivity in colorectal cancer
包含体外细胞系、类器官、动物模型及患者数据等多层级验证,并有功能实验和机制研究。
HCT116细胞系 AKP小鼠结直肠癌类器官 HCT116异种移植小鼠模型 AKP同源小鼠结直肠癌模型 Taxonomy患者队列
5FU处理浓度:5 μM,处理时间:72小时 CI活性测定:使用Abcam ab109721试剂盒及Seahorse分析 体内给药方案:5FU 10 mg/kg/d i.p. 或150 mg/kg i.p.,metformin 250 mg/kg/d o.g. 存活分析:AKP小鼠治疗至临床终点,记录生存期
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究5FU处理是否改变结直肠癌细胞的线粒体质量和形态
在体外和体内模型中,通过NAO染色、mtDNA含量、蛋白质印迹和电子显微镜检测线粒体质量和形态,并评估凋亡相关蛋白和线粒体膜电位。
检测5FU处理是否增强线粒体功能,特别是电子传递链复合物I活性
通过酶活性测定和Seahorse分析检测复合物I活性,使用LC-MS检测ATP水平和代谢物变化,并进行13C6-葡萄糖示踪和转录组分析。
阐明5FU通过TS抑制和mTOR-PGC1α信号通路促进线粒体生物发生的机制
通过siRNA敲低TS、使用TS抑制剂和mTOR抑制剂,检测PGC1α表达和磷酸化状态,验证信号通路。
评估氧化磷酸化(OxPhos)特征是否能预测结直肠癌患者对5FU化疗的反应
分析Taxonomy队列中接受5FU辅助化疗的患者,使用GSEA和ssGSEA比较OxPhos高和低组的生存期。
验证线粒体功能是否直接影响5FU敏感性
使用CRISPR筛选、ETC抑制剂处理、NDI1过表达和线粒体DNA突变细胞,检测细胞对5FU的敏感性变化。
评估5FU联合线粒体抑制剂(metformin)在体内的抗肿瘤效果
在HCT116异种移植和AKP同源肿瘤模型中,给予5FU和/或metformin治疗,检测肿瘤生长、细胞凋亡和生存期。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 5-氟尿嘧啶 | Abcam | ab142387-5g |
| IACS-010759 | Selleckchem | S8731 | |
| zVAD-fmk | Sigma-Aldrich | 627610 | |
| siRNA转染 | siRNA SMARTpool | Horizon Discovery | L-004717-00-0005 |
| 药物处理 | 奥沙利铂 | -- | -- |
| SN38 | Selleckchem | S4908 | |
| 甲氨蝶呤 | Merck | M1000000 | |
| 培美曲塞 | Merck | PHR1596 | |
| 雷替曲塞 | Selleckchem | S1192 | |
| BAY-2402234 | Cambridge Bioscience | CAY33259-1mg | |
| 雷帕霉素 | Sigma-Aldrich | 553210 | |
| Torin1 | -- | -- | |
| 尿苷 | Merck | U3003 | |
| 细胞活力测定 | 磺基罗丹明B | Sigma-Aldrich | S1402-5G |
| 高内涵荧光显微镜 | 碘化丙啶 | Sigma-Aldrich | P4864 |
| Hoechst 33342 | Invitrogen | H3570 | |
| 线粒体染色 | 壬基吖啶橙 | ThermoFisher | A1372 |
| 四甲基罗丹明乙酯高氯酸盐 | Sigma-Aldrich | 87917 | |
| MitoSOX Red | ThermoFisher | M36008 | |
| 细胞外通量分析 | 鱼藤酮 | Sigma-Aldrich | 45656 |
| 复合物活性测定 | 复合物I酶活性微板测定 | Abcam | ab109721 |
| 蛋白质印迹 | BCA测定 | ThermoFisher | -- |
| Trans-Blot Turbo膜 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫荧光 | 兔抗TOM20抗体 | Abcam | ab186734 |
| 小鼠抗DNA抗体 | Progen | 61014 | |
| 驴抗兔Alexa Fluor 555 | Invitrogen | A31572 | |
| 山羊抗小鼠Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A11001 | |
| ProLong Gold防淬灭封片剂 | Invitrogen | P36930 | |
| 透射电子显微镜 | LR白色树脂 | -- | -- |
| 蛋白质印迹 | PVDF膜 | Bio-Rad | -- |
| 免疫组织化学 | TOM20抗体 | Abcam | ab186734 |
| VDAC2抗体 | ThermoFisher | PA5-28106 | |
| 裂解型caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661L | |
| DAB试剂盒 | Abcam | ab64238 | |
| RNA提取 | High Pure RNA提取试剂盒 | Roche Life Science | 11828665001 |
| RT-qPCR | iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | 1708891 |
| 480 SYBR Green预混液 | Roche Life Science | 4707516001 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和处理 | 细胞系来源、培养基种类、5FU浓度和暴露时间 阅读提示:Methods - Cell culture, Cell reagents |
| 线粒体功能测定 | 复合物I活性测定试剂盒、Seahorse分析条件(底物、抑制剂浓度) 阅读提示:Methods - Mitochondrial complex activity |
| 体内研究 | 动物品系、肿瘤诱导方法、给药剂量和途径、治疗时间线 阅读提示:Methods - In vivo studies |
| 代谢组学分析 | 细胞处理条件、标记物(13C6-glucose)、提取和检测方法 阅读提示:Methods - LC–MS metabolomics analysis |
| 生物信息学分析 | RNA-seq数据处理方法、GSEA参数、OxPhos评分计算 阅读提示:Methods - Gene expression profiling, Taxonomy cohort |