Epigraph抗原设计
设计覆盖H9N2病毒群体广泛表位的HA和NA免疫原。
从GISAID数据库获取H9N2 HA和NA序列,使用Epigraph算法生成两个HA(HA_EG1/EG2)和两个NA(NA_EG1/EG2)免疫原。
A bivalent inactivated influenza vaccine incorporating epitope-optimized surface proteins confers cross-protective immunity against H9N2 influenza virus
包含疫苗设计、动物免疫、HI/ELISA、流式、ELISpot、攻毒保护、被动转移等多个独立实验验证,功能验证和机制验证完整。
BALB/c小鼠 MDCK细胞 HEK293T细胞 SPF鸡胚
疫苗剂量:10 μg/只,肌肉注射,初免后3周加强 攻毒剂量:10×LD50,滴鼻感染 实验动物:6-8周龄雌性BALB/c小鼠,每组6或10只 对照组:PBS,疫苗对照AL/39 检测指标:HI抗体、IgG、T细胞因子(IFN-γ、IL-4、TNF-α)、肺病毒载量(TCID50、qPCR)、组织病理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
设计覆盖H9N2病毒群体广泛表位的HA和NA免疫原。
从GISAID数据库获取H9N2 HA和NA序列,使用Epigraph算法生成两个HA(HA_EG1/EG2)和两个NA(NA_EG1/EG2)免疫原。
构建表达Epigraph免疫原的嵌合病毒并制备灭活疫苗。
将优化的HA和NA基因与PR8内部基因克隆至pHW2000载体,共转染293T细胞,拯救cHANA1和cHANA2病毒,经灭活、纯化后混合成cHANA疫苗。
评估cHANA疫苗诱导的抗体和T细胞免疫应答。
BALB/c小鼠初免-加强免疫后,检测血清HI滴度、IgG亚型、T细胞细胞因子分泌(流式、ELISpot)。
评估cHANA疫苗对异源H9N2病毒致死攻击的保护效果。
免疫小鼠用3株异源H9N2病毒(10×LD50)攻毒,监测体重和存活率,检测肺病毒载量及组织病理。
验证cHANA疫苗诱导的抗体在保护免疫中的关键作用。
将免疫小鼠的血清转移至naïve受体小鼠,随后攻毒,监测生存率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 基因合成 | 基因合成服务 | Sangon Biotech | -- |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | -- | -- |
| 疫苗制备 | β-丙内酯 | -- | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Vazyme | -- | |
| Western blot | 抗HA抗体 | Sino Biological | -- |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | -- | |
| TEM | Talos L120C透射电子显微镜 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 免疫佐剂 | 铝佐剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| ELISA | HRP标记的山羊抗小鼠IgG | ProteinTech | -- |
| TMB底物 | -- | -- | |
| 流式细胞术 | 红细胞裂解液 | Absin | -- |
| 可固定活力染料510 | -- | -- | |
| 抗CD3e抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗CD8a抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗CD4抗体 | BD Biosciences | -- | |
| BD细胞固定/破膜试剂盒 | BD Biosciences | -- | |
| 抗IL-4抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗IFN-γ抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗TNF-α抗体 | BD Biosciences | -- | |
| BD LSRFortessa X-20流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| ELISpot | 小鼠IFN-γ预包被ELISpot试剂盒 | Dakewe Biotech | 2210002 |
| IL-4预包被ELISpot试剂盒 | Dakewe Biotech | 2210402 | |
| PMA | -- | -- | |
| 离子霉素 | -- | -- | |
| ImmunoSpot分析仪 | -- | -- | |
| 动物实验 | 阿佛丁 | -- | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 9 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 疫苗制备 | 灭活条件:0.1% BPL,4℃过夜;纯化方式:超速离心和蔗糖梯度离心 阅读提示:Materials and methods: Construction of bivalent chimeric inactivated vaccine |
| 动物免疫 | 免疫剂量:10 μg /只;佐剂:铝佐剂(1:1体积比);免疫途径:肌肉注射;免疫方案:初免-加强(间隔3周);小鼠品系和性别:6-8周龄雌性BALB/c;每组数量:6或10只 阅读提示:Materials and methods: Animal experiments; Figure 4 legend |
| 攻毒实验 | 攻毒毒株和剂量:Jiangsu/2002、Shandong/2019、Hunan/2018,10×LD50;攻毒途径:滴鼻;观察时间:14天;安乐死标准:体重下降≥25% 阅读提示:Materials and methods: Animal experiments; Figure 6 legend |
| 免疫学检测 | HI抗体检测使用17株代表株;ELISA使用重组HA蛋白(1 μg/mL包被);流式细胞术刺激物:HA_EG1和HA_EG2(15 μg/mL);ELISpot刺激物:HA蛋白(1 μg/孔)来自Jiangsu/2002, Shandong/2019, Hunan/2018 阅读提示:Materials and methods: ELISA, Flow cytometry, ELISpot; Figure 4 and 5 legends |
| 被动血清转移 | 血清体积:200 μL/只;转移途径:腹腔注射;攻毒:10×LD50 Jiangsu/2002 阅读提示:Materials and methods: Passive transfer of serum assay; Figure 8 legend |