制备羊膜基质载体
比较含活或死基质细胞的羊膜对角膜缘上皮细胞培养的影响。
将人羊膜去上皮化后,部分通过冻融循环灭活基质细胞,获得D-dAM和L-dAM,并验证细胞活性。
Amniotic Membrane Stromal Cells Facilitate Corneal Epithelial Tissue Engineering by Promoting Limbal Epithelial Stem Cell Expansion
包含体外细胞共培养模型(兔角膜缘上皮与羊膜基质细胞)、功能验证(CFE、BrdU标记)、分子机制验证(RNA-seq、代谢组学、外泌体抑制实验)等多层级证据。
兔角膜缘上皮细胞 含活基质细胞的羊膜(L-dAM) 含死基质细胞的羊膜(D-dAM)
羊膜基质细胞活性(L-dAM vs D-dAM) 烟酰胺(NAM)浓度(500 µM) 外泌体抑制剂GW4869浓度(3 µM) 培养时间(14天) 集落形成效率(CFE)和克隆类型比例
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较含活或死基质细胞的羊膜对角膜缘上皮细胞培养的影响。
将人羊膜去上皮化后,部分通过冻融循环灭活基质细胞,获得D-dAM和L-dAM,并验证细胞活性。
在L-dAM和D-dAM上培养兔角膜缘上皮细胞,建立共培养模型。
从兔角膜缘组织分离上皮细胞,接种于dAM基底膜侧,在SHEM培养基中培养14天。
比较两种培养条件下上皮片的形态、细胞连接和屏障功能。
通过大体观察、扫描电子显微镜、免疫荧光和Western blot检测紧密连接蛋白(occludin, claudin-1)表达。
比较两种培养条件下角膜缘干细胞的集落形成能力、增殖和分化状态。
通过CFE实验、BrdU标记、免疫荧光和Western blot检测干性标记物(ΔNp63α, PAX6, Ki67, K14)和分化标记物(K12)表达。
揭示LSCs在不同微环境下的转录组变化,寻找关键通路。
对LSCs进行RNA-seq,分析DEGs、GO和KEGG富集,验证NAD+代谢和NLRP信号通路变化。
验证NAD+在维持LSC稳态中的作用。
通过LC-MS/MS和NAD+/NADH比值实验测定细胞内NAD+水平;在D-dAM培养中添加NAM,检测干性标记物表达和CFE变化。
验证AMSCs通过外泌体转移NAD+维持LSC稳态。
在L-dAM培养中添加外泌体抑制剂GW4869,检测LSC内NAD+水平、干性标记物和CFE的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良鹰培养基 | Gibco | 11995065 |
| DMEM/F-12培养基 | Gibco | 11320082 | |
| 胎牛血清 | Gibco | A5256701 | |
| 胰岛素-转铁蛋白-硒 | Gibco | 51500056 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 人表皮生长因子 | Invitrogen | PHG0311L | |
| 小鼠表皮生长因子 | Invitrogen | PMG8045 | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488标记IgG二抗 | Invitrogen | A11055 |
| 组织处理 | 分散酶II | Sigma-Aldrich | D4693-1G |
| 药物处理 | 烟酰胺 | Sigma-Aldrich | N0636 |
| 细胞培养 | 氢化可的松 | ABclonal | RPM0042 |
| 细胞核染色 | 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Vector Laboratories | H-1200 |
| Western blot | 抗角蛋白12抗体 | Abcam | ab185627 |
| 抗角蛋白14抗体 | Abcam | ab181595 | |
| 抗ΔNp63α抗体 | Abcam | ab124762 | |
| 抗PAX6抗体 | Abcam | ab195045 | |
| NLRC5抗体 | Cell Signaling Technology | 72379 | |
| 外泌体抑制 | GW4869 | MedChemExpress | -- |
| 组织处理 | Hanks平衡盐溶液 | -- | -- |
| 细胞培养 | 补充激素上皮培养基 | -- | -- |
| 细胞增殖检测 | 细胞计数试剂盒-8 | -- | -- |
| BrdU染色试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 8817-6600-42 | |
| RNA提取 | RNeasy迷你试剂盒 | QIAGEN | 74104 |
| RNA定量 | NanoDrop OneC微量紫外可见分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RT-qPCR | SYBR Premix Ex Taq试剂盒 | Takara Bio | RR420A |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | -- | -- |
| 聚偏二氟乙烯膜 | -- | -- | |
| 增强化学发光试剂 | -- | -- | |
| 代谢组学 | Q-Exactive高分辨率液相色谱-质谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Hypercarb多孔石墨碳色谱柱 | -- | -- | |
| NAD+/NADH定量试剂盒 | Beyotime | S0176S | |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596018 |
| DNA酶I | Takara Bio | 2270A | |
| 2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- | |
| NanoDrop ND-2000 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| TruSeq RNA试剂盒 | Illumina | RS-122-2101/2102 | |
| SuperScript II逆转录酶 | Invitrogen | 18064014 | |
| Phusion高保真DNA聚合酶 | Thermo Fisher Scientific | F530S | |
| Illumina HiSeq X Ten/NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 统计分析 | Prism 10.0 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 羊膜制备 | 羊膜来源、去上皮处理方法(Dispase II浓度和时长)、冻融循环次数 阅读提示:Methods: Preparation of the Denuded Amniotic Membrane |
| 细胞培养 | 兔角膜缘上皮细胞的分离方法、培养时间(14天)、培养基成分(SHEM) 阅读提示:Methods: Cultivation of Rabbit Limbal Epithelial Cell Sheet |
| 药物处理 | NAM浓度(500 µM)、GW4869浓度(基于CCK-8结果,未明确具体浓度) 阅读提示:Methods: Cytotoxicity Detection Assay; Results: NAD+ Helps Maintain Stem Cell Homeostasis |
| 功能验证 | CFE实验的细胞接种密度、培养时间(7天)、克隆分类标准 阅读提示:Methods: Clone Culture of LECs |
| 分子检测 | 抗体清单及稀释比例、qRT-PCR内参(β-actin)、Western blot上样量 阅读提示:Methods: Immunostaining, Western Blotting Analysis |