基因表达分析
检查CHD2在人脑和小鼠脑中的表达模式
利用RNA测序数据分析人脑各区域CHD2表达,并分析小鼠脑中的表达。
Uncoupling memory impairments from autism-associated behaviors in Chd2 deficient mice
研究包含体外基因表达分析、多种行为学实验、条件性基因敲除模型、免疫染色和药物干预等多个独立证据层级,并进行了功能验证。
Chd2+/−小鼠 Chd2+/cKO小鼠(成年期条件性敲除) GAD67-GFP报告小鼠
Chd2+/−和Chd2+/cKO小鼠的基因型及Chd2表达水平验证 行为测试中的性别和年龄匹配 行为测试的顺序和时间间隔 L-838,417给药的剂量和给药方式
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检查CHD2在人脑和小鼠脑中的表达模式
利用RNA测序数据分析人脑各区域CHD2表达,并分析小鼠脑中的表达。
验证Chd2+/−和Chd2+/cKO小鼠模型中Chd2表达降低。
将Chd2-flox小鼠与Actb-Cre或CAGG-CreER系杂交,通过他莫昔芬诱导产生成年条件性敲除。通过qPCR和免疫染色验证基因缺失效果。
评估Chd2缺陷对多种记忆形式的影响。
对Chd2+/−、Chd2+/cKO和对照小鼠进行Y迷宫、物体位置记忆、物体识别记忆和恐惧条件化测试。
评估Chd2缺陷对社交互动和社交新颖性的影响。
进行三室社交互动测试和急性社交失败后的社交回避测试。
探究Chd2缺陷对突触和神经调质基因表达及中间神经元密度的变化。
通过qPCR分析海马和额叶皮层中突触相关基因和神经调质基因的表达;通过免疫染色统计GAD67+中间神经元密度。
测试GABAA受体调节剂L-838,417是否能改善Chd2+/−小鼠的社交缺陷。
对Chd2+/−和野生型小鼠给予L-838,417或溶剂对照,然后进行三室社交测试。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型构建 | 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | T5648 |
| 玉米油 | Sigma-Aldrich | C8267 | |
| 基因表达分析 | RNeasy Plus Mini 试剂盒 | Qiagen | 74134 |
| RevertAid 第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Scientific | K1622 | |
| PowerTrack SYBR Green 预混液 | Applied Biosystems | A46109 | |
| 免疫染色 | NEUN抗体 | Sigma-Aldrich | MAB377 |
| DsRed抗体 | Takara | 632496 | |
| GFP抗体 | Aves-Lab | GFP-1020 | |
| Alexa 488 | Invitrogen | -- | |
| Alexa 546 | Invitrogen | -- | |
| Alexa 647 | Invitrogen | -- | |
| Fluoromount-G 封片剂 | -- | -- | |
| Superfrost plus 载玻片 | Fisher Scientific | -- | |
| 行为测试 | Y迷宫 | Panlab | LE847 |
| 三室箱 | Panlab | LE894 | |
| 网格围栏 | Panlab | LE894A | |
| 高架十字迷宫 | Panlab | LE842 | |
| 恐惧条件化箱 | Med Associates | MED-VFC-OPTO-M | |
| Video Freeze 软件 | Med Associates | -- | |
| ANY-maze 软件 | Stoelting | -- | |
| Falcon 50毫升锥形离心管 | Fisher | 14-432-22 | |
| 药物处理 | L-838,417 | Tocris | 3250 |
| 二甲基亚砜 | Sigma | 472301 | |
| 生理盐水 | Teknova | S5825 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 基因型:Chd2+/−, Chd2+/cKO,他莫昔芬处理方案(150 mg/kg,5天,P55),对照类型 阅读提示:Methods: Animals, Experimental design |
| 行为测试 | 测试顺序、年龄(P83-P125)、光照周期(12pm-7pm)、盲法分析、ANY-maze追踪参数 阅读提示:Methods: Behavioral testing |
| 记忆测试 | Y迷宫暴露时间(10分钟)和测试时间(5分钟)、间隔(60分钟)、物体位置/识别任务的样本数量、探索时间(10分钟)和保留期(24小时)、恐惧条件化电击强度(0.45 mA)和音调(85dB) 阅读提示:Methods: Y-maze, Object location and recognition memory, Fear conditioning |
| 社交测试 | 三室测试的陌生鼠匹配、社交新颖阶段、急性社交失败(CD-1攻击者5分钟)、社交回避测试时间(5分钟) 阅读提示:Methods: Three-chamber social interaction, Acute social defeat |
| 药物干预 | L-838,417剂量(0.05 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、给药至测试的时间(30分钟)、溶剂对照(0.1% DMSO生理盐水) 阅读提示:Methods: Drug administration |
| 基因表达 | qPCR的组织取样(海马、额叶皮层)、内参基因(Actb, Gapdh)、反应重复次数(三次)、相对定量方法(2^-ΔΔCT) 阅读提示:Methods: qPCR |
| 免疫染色 | 灌流固定(4% PFA)、切片厚度(50 μm)、抗体稀释度(NEUN 1:500, DsRed 1:500, GFP 1:1000)、计数区域(PFC, BLA, CA1)、计数切片间隔(每第六张) 阅读提示:Methods: Immunostaining |