人类队列中sST2与水肿和结局的关联验证
验证sST2是否与人类缺血性卒中后的脑水肿和临床结局相关。
对83例大面积缺血性卒中患者的血浆进行蛋白质组学筛选,发现sST2与中线移位(MLS)和净水摄取(NWU)相关,并通过ELISA验证。
Brain Endothelial Soluble ST2 Production and Cerebral Edema in a Rat Model of Ischemic Stroke
包含人类队列蛋白质组学与ELISA验证、大鼠MCAO模型、细胞培养与FISH、sST2敲除大鼠的功能与机制验证等多层级实验。
大鼠MCAO卒中模型 sST2敲除大鼠 hCMEC/D3内皮细胞系 人类队列样本
MCAO缺血时间(120分钟)与再灌注 sST2敲除大鼠基因型确认(PCR) 脑水肿测量方法(SwellingIndirect和SwellingReglodi) 血脑屏障完整性评估(伊文思蓝外渗和IgG免疫荧光)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证sST2是否与人类缺血性卒中后的脑水肿和临床结局相关。
对83例大面积缺血性卒中患者的血浆进行蛋白质组学筛选,发现sST2与中线移位(MLS)和净水摄取(NWU)相关,并通过ELISA验证。
确定sST2在实验性卒中后的表达变化、组织来源和时间进程。
对大鼠进行短暂MCAO,在不同时间点测量血浆sST2蛋白和脑组织sST2 mRNA,并分析不同组织的表达。
确定脑内sST2产生的具体细胞类型。
对原代人神经血管单元细胞培养系统进行蛋白质组学数据库筛查,对hCMEC/D3细胞进行TNF-α刺激,并对MCAO大鼠脑切片进行RNAscope原位杂交。
生成sST2特异性敲除大鼠品系,用于研究sST2在卒中后水肿中的作用。
使用CRISPR/Cas9技术靶向sST2基因外显子1,产生1.8kb缺失,并通过PCR和测序验证。
验证sST2敲除是否能减轻脑水肿并评估血脑屏障完整性。
对sST2敲除大鼠和野生型大鼠进行MCAO,测量脑水肿、病变体积、IgG外渗、伊文思蓝外渗和ZO-1染色。
探究sST2敲除引起的基因表达变化,特别是与血脑屏障相关的通路。
对FACS分选的内皮细胞和小胶质细胞进行bulk RNA测序,并进行通路富集分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质组学 | Olink Target 96 panels | Olink | -- |
| sST2测量 | sST2 ELISA试剂盒 | Critical Diagnostics | -- |
| Western blot | 抗ST2抗体 | Novus | -- |
| HRP偶联二抗 | -- | -- | |
| Zeba脱盐柱 | ThermoFisher | -- | |
| Pierce白蛋白去除试剂盒 | ThermoFisher | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | High-Capacity cDNA反转录试剂盒 | Applied Biosystems | -- |
| qPCR | TaqMan环境预混液2.0 | Applied Biosystems | -- |
| 细胞培养 | 人脑血管周细胞 | ScienCell | 1200 |
| 人脑微血管内皮细胞 | iXcell | 10HU-051 | |
| hCMEC/D3细胞系 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 原位杂交 | RNAscope多重荧光V2检测试剂盒 | ACDBio | 323100 |
| sST2探针 | ACDBio | 1051411 | |
| CD31探针 | ACDBio | 315311 | |
| 细胞分选 | 抗大鼠CD68抗体 | Bio-Rad | MCA341GA |
| 抗大鼠CD45抗体 | Invitrogen | 62-0461-80 | |
| 抗大鼠CD31抗体 | BD-Pharmigen | -- | |
| BD FACSAria II细胞分选仪 | BD | -- | |
| RNA提取 | RNeasy Plus Micro试剂盒 | QIAGEN | -- |
| RT-qPCR | PrimeTime一步法RT-qPCR预混液 | Integrated DNA Technologies | -- |
| RNA测序 | NEBNext PolyA文库构建试剂盒 | New England Biolabs | -- |
| Illumina NextSeq 2000测序仪 | Illumina | -- | |
| 细胞因子测量 | Milliplex Map试剂盒 | Millipore | -- |
| Luminex 200系统 | Luminex | -- | |
| 动物实验 | Sprague Dawley大鼠 | Charles River Laboratories | -- |
| 基因敲除 | Jur7536-10300-DEL sST2敲除大鼠品系 | Charles River | -- |
| 血脑屏障完整性分析 | 抗大鼠IgG抗体 | Jackson ImmunoResearch | -- |
| 抗大鼠ZO-1多克隆一抗 | ThermoFisher | 61-7300 | |
| AlexaFluor 488偶联的山羊抗兔二抗 | ThermoFisher | A-11008 | |
| 伊文思蓝 | -- | -- | |
| 荧光测量 | SpectraMax iD3多功能酶标仪 | Molecular Devices | -- |
| 图像分析 | ImageJ软件 | National Institutes of Health | -- |
| HALO软件 | Indica Labs | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人类队列 | 队列来源(GAMES-RP和SPOTRIAS)、样本量、采样时间(入组时、48小时)、sST2测量方法(ELISA) 阅读提示:参见Methods部分 Human Cohorts 和 sST2 ELISA |
| 大鼠MCAO模型 | 品系(Sprague Dawley)、体重(270-330g)、缺血时间(120分钟)、再灌注、时间点(3小时至7天) 阅读提示:参见Methods部分 Rodent MCAO Stroke Model 和 sST2 Western Blotting |
| sST2敲除大鼠 | 基因型确认(PCR检测缺失)、敲除有效性(sST2 mRNA水平) 阅读提示:参见Methods部分 Jur7536-10300-DEL sST2 KO rat strain 和 Results 部分 Soluble ST2 knockout reduces brain edema |
| 脑水肿测量 | TTC染色、计算SwellingIndirect和SwellingReglodi的方法、时间点(3天) 阅读提示:参见Methods部分 Measurement of rat brain edema |
| 血脑屏障完整性 | IgG免疫荧光和伊文思蓝外渗方法、ZO-1染色定量、样本量 阅读提示:参见Methods部分 Assays of blood-brain barrier integrity |